; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G027330 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G027330
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description50S ribosomal protein L23, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr04:19796533..19798521
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G027330
SyntenyCmoCh04G027330
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001014 - Ribosomal protein L23/L25, conserved site
IPR005633 - Ribosomal protein L23/L25, N-terminal
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR012678 - Ribosomal protein L23/L15e core domain superfamily
IPR013025 - Ribosomal protein L25/L23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602342.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.1e-6575.65Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_004140408.1 60S ribosomal protein L23a isoform X1 [Cucumis sativus]2.0e-6374.09Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKAD +KKADPKAQALK AKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022922609.1 60S ribosomal protein L23a-like [Cucurbita moschata]2.8e-6576.17Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022991052.1 60S ribosomal protein L23a [Cucurbita maxima]1.2e-6373.58Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKAD++KKADPKAQALK AKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRP+TLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGI+
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

XP_022995723.1 60S ribosomal protein L23a [Cucurbita maxima]2.0e-6375.26Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALK AKAVKSGPTF KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQU4 50S ribosomal protein L23, chloroplastic9.6e-6474.09Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKAD +KKADPKAQALK AKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1E3W3 50S ribosomal protein L23, chloroplastic1.3e-6576.17Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1JKM4 50S ribosomal protein L23, chloroplastic5.6e-6473.58Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKAD++KKADPKAQALK AKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRP+TLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGI+
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1JN21 50S ribosomal protein L23, chloroplastic1.3e-6576.17Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
        MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRA

Query:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        DKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  DKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

A0A6J1K8U2 50S ribosomal protein L23, chloroplastic9.6e-6475.26Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSSKKADPKAQALK AKAVKSGPTF KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22644 60S ribosomal protein L23A2.9e-5768.21Show/hide
Query:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF--KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP A  +KK D KAQALK AKAVKSG +   KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF--KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIK AVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALD+ANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q07761 60S ribosomal protein L23a1.3e-5768.72Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP KAD SKK+DPKAQA K AKAVKSG T  KK++KIRT VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA  RNKLDQY ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTF-KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        +ADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q8LD46 60S ribosomal protein L23a-11.1e-5667.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALKAAKAVKSG  FKK  KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9AT35 60S ribosomal protein L23a9.0e-5969.23Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPT-FKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KK+D KAQALK AKAVKSG T FKK KKIRTSVTFHRP+TL KDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPT-FKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RA+KKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Q9M3C3 60S ribosomal protein L23a-23.2e-5667.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALKAAKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39460.1 ribosomal protein L23AA7.8e-5867.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALKAAKAVKSG  FKK  KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT2G39460.2 ribosomal protein L23AA7.8e-5867.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D++KKADPKA+ALKAAKAVKSG  FKK  KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKA-KKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.1 ribosomal protein L23AB2.3e-5767.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALKAAKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.2 ribosomal protein L23AB2.3e-5767.69Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D +KKADPKA+ALKAAKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKK-AKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

AT3G55280.3 ribosomal protein L23AB3.6e-5565.98Show/hide
Query:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        M+P K D +KKADPKA+ALKAAKAVKSG       KIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAP-KADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKK  +                                           RPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCAAAAGCTGACAGCTCCAAGAAGGCCGATCCTAAGGCTCAAGCCTTGAAAGCTGCGAAGGCAGTTAAATCAGGTCCAACATTTAAGAAAGCAAAGAAGATCAG
GACATCTGTCACATTTCACCGGCCGAAGACATTGAAGAAGGATAGAAATCCCAAGTATCCACGTATTAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAGATTCTTA
AATATCCTTTGACTACTGAGTCTGCAATGAAGAAGATCGAAGACAACAATACTTTGGTTTTCATTGTGGACATTCGTGCTGATAAGAAGAAGATCAAGGATGCCGTGAAG
AAGATGTATGACATCCAGACCAAGAAAGCAGTCTCATTTTATCACCATATGTTTGCGAGTCACCTTATGAATAAAATTAAACACTTTGATGATGATGATCGTATAACTGT
AATTTATATTGAAGTTGTGTTACACCTTGATGACTGTGTTTTATATAATAATTGCAGGCCTGATGGAACCAAGAAGGCGTATGTTAGGCTGACTCCCGATTACGATGCTT
TGGATGTTGCAAACAAGATTGGAATCATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTCTTCGCAACTGCGGAAACCTAGCCTTCCAGATAGCAGCTGTTCGTCTGGGTTGGAGTAGTGATTAGGTAGAGGATTCTGCAATGGCTCCAAAAGCTGACAGCTCCAA
GAAGGCCGATCCTAAGGCTCAAGCCTTGAAAGCTGCGAAGGCAGTTAAATCAGGTCCAACATTTAAGAAAGCAAAGAAGATCAGGACATCTGTCACATTTCACCGGCCGA
AGACATTGAAGAAGGATAGAAATCCCAAGTATCCACGTATTAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAGATTCTTAAATATCCTTTGACTACTGAGTCTGCA
ATGAAGAAGATCGAAGACAACAATACTTTGGTTTTCATTGTGGACATTCGTGCTGATAAGAAGAAGATCAAGGATGCCGTGAAGAAGATGTATGACATCCAGACCAAGAA
AGCAGTCTCATTTTATCACCATATGTTTGCGAGTCACCTTATGAATAAAATTAAACACTTTGATGATGATGATCGTATAACTGTAATTTATATTGAAGTTGTGTTACACC
TTGATGACTGTGTTTTATATAATAATTGCAGGCCTGATGGAACCAAGAAGGCGTATGTTAGGCTGACTCCCGATTACGATGCTTTGGATGTTGCAAACAAGATTGGAATC
ATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKADSSKKADPKAQALKAAKAVKSGPTFKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVK
KMYDIQTKKAVSFYHHMFASHLMNKIKHFDDDDRITVIYIEVVLHLDDCVLYNNCRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII