CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh04G027500
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	40S ribosomal protein S15a
Genome location	Cmo_Chr04:19907389..19909784
RNA-Seq Expression	CmoCh04G027500
Synteny	CmoCh04G027500
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000630 - Ribosomal protein S8 IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily

Homology

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GenBank top hits

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EXB65311.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Morus notabilis]

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KAG7033038.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022922996.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita moschata]

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XP_022990484.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Cucurbita maxima]

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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1E5M9 40S ribosomal protein S15a-1

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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like

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A0A6J1JS60 40S ribosomal protein S15a-1

3.9e-64

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W9R286 40S ribosomal protein S15a-1

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SwissProt top hits

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O80646 40S ribosomal protein S15a-3

8.6e-61

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P42798 40S ribosomal protein S15a-1

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Q00332 40S ribosomal protein S15a

9.8e-65

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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a

6.3e-64

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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-4

4.4e-65

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AT1G07770.1 ribosomal protein S15A

2.4e-66

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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A

2.4e-66

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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein

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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D

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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein

2.4e-66

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTTCGTGTGAGTGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGTGGGAAGCGCCAGGTCATGATAAGGCCATCTTCTAAAGTTATCATCAAGTT
TCTTAATGTCATGCAAAAGCATGGATACATTGGTGAGTTTGAGTACGTTGACGATCATAGGTCAGGGAAAATTGTTGTTGAACTGAATGGGAGACTCAACAAATGTGGTG
TCATCAGTCCTCGTTTTGATATTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCACGGTTGCTTCCCTCGAGACAGTTTGGTTTCATTGTGTTGACAACTTCTGCGGGAATC
ATGGACCACGAAGAGGCCCGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAATTAGCATTTGGAATGACATTATATTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CTTTCTCTCTTCTCTCCGCTTGAACCCTGGAAAGAAGCCCTAGTTCCCGCCCCTGCTCGTCGAACTTCTCGAAGTCGCCTCTGCAATTGCCTAACAATGGTTCGTGTGAG
TGTTCTGAATGATGCTCTTAAAAGCATGTATAATGCTGAGAAACGTGGGAAGCGCCAGGTCATGATAAGGCCATCTTCTAAAGTTATCATCAAGTTTCTTAATGTCATGC
AAAAGCATGGATACATTGGTGAGTTTGAGTACGTTGACGATCATAGGTCAGGGAAAATTGTTGTTGAACTGAATGGGAGACTCAACAAATGTGGTGTCATCAGTCCTCGT
TTTGATATTGGTGTCAAGGAGATTGAAGGTTGGACTGCACGGTTGCTTCCCTCGAGACAGTTTGGTTTCATTGTGTTGACAACTTCTGCGGGAATCATGGACCACGAAGA
GGCCCGAAGAAAGAACGTTGGTGGTAAATTAGCATTTGGAATGACATTATATTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIIKFLNVMQKHGYIGEFEYVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDIGVKEIEGWTARLLPSRQFGFIVLTTSAGI
MDHEEARRKNVGGKLAFGMTLY

CmoCh04G027500 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome