CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh04G031280
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	Cmo_Chr04:21701269..21701862
RNA-Seq Expression	CmoCh04G031280
Synteny	CmoCh04G031280
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAG6602714.1 hypothetical protein SDJN03_07947, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7033401.1 hypothetical protein SDJN02_07457, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

5.6e-98

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XP_022953683.1 uncharacterized protein LOC111456137 [Cucurbita moschata]

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XP_022991024.1 uncharacterized protein LOC111487739 [Cucurbita maxima]

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XP_023528120.1 uncharacterized protein LOC111791129 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

2.0e-72

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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC111020211

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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT1G22680.1 unknown protein

6.0e-13

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         +K+    + RDPF  A VECSK   A T  E          G + K + +S S   G LN  SSC+R C VSESIVY P +  +S+D L+
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AT1G71970.1 unknown protein

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        SSRR    S SS SS SS SS S  S  FP DSPL S ATP+R     +PFSWE LPG PK  S       +      LLPLPP   IS      K    
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        +  +K++   + +DPF  A +ECSK+    +  + D             NSG + K +S+ S+ DRFG +N   SC+RTC V+ESIVY PR R  +S+D 
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        L
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCGTTCTTTCTCTTCTTCTTCTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCC
GCTCTCCGCCGCCACTCCCATCCGATCATTCTCCGGCAGCATTCCCTTTTCCTGGGAATATTTACCCGGAATCCCCAAGAAACAGTCTCCAGCGAGGCTTCGGCTAGATT
CCGCCTCTCCTCTGACCTCTCTCCTCCCCTTGCCTCCCATTTCCACCACTCTGCCGTCCTCCAAGCGCTTCGGATTTCACGACTGGAGGAAATCAAACCGCCAAAATTCA
CAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCGTCGAGTGCTCCAAAGAACCTTCCGCCGCCACCGCAGCTGAGCAAGACCCGACTGCCGAGCTCTGGAACAGCGGCAGCAATGG
CAAAGCGGTTTCGAGAAGCCTGAGCGACCGATTCGGATTCTTGAATCCGAACTCTTCTTGCAAACGAACCTGCGGCGTATCGGAATCCATCGTGTATCGTCCGAGAAGGG
GGAGGAGTTCGTTCGATCTGCTAAACCACCGCAACGGTGGGTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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QRDPFFDAFVECSKEPSAATAAEQDPTAELWNSGSNGKAVSRSLSDRFGFLNPNSSCKRTCGVSESIVYRPRRGRSSFDLLNHRNGG

CmoCh04G031280 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome