; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G000330 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G000330
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionF-box/kelch-repeat protein At1g23390-like
Genome locationCmo_Chr05:121580..122782
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G000330
SyntenyCmoCh05G000330
Gene Ontology termsGO:0005622 - intracellular (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR015915 - Kelch-type beta propeller


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029207.1 F-box/kelch-repeat protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-21296Show/hide
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XP_022962360.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X1 [Cucurbita moschata]9.4e-21797.25Show/hide
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XP_022962361.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X2 [Cucurbita moschata]4.7e-21696.25Show/hide
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XP_022996915.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like [Cucurbita maxima]2.2e-21094Show/hide
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XP_023547142.1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-21094.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BSR4 F-box/kelch-repeat protein At1g233901.1e-10957.36Show/hide
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        A
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A0A6J1HCW8 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X22.3e-21696.25Show/hide
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A0A6J1HEU1 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like isoform X14.5e-21797.25Show/hide
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A0A6J1K837 F-box/kelch-repeat protein At1g23390-like1.1e-21094Show/hide
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A0A6P4ADG8 F-box/kelch-repeat protein At1g233901.3e-9147.58Show/hide
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        + +EE  I GD+LE ++SHVPL+DL+ A  V+ SW+ A+S+SLL +NT+KPWL++H+QSTRSP ++TT AYDPRS +W+++ +P                
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              S ++  S LRSS S+LLYMLS S+FAFS DPLH  W  A PP+ WR DP+VA VG+ IVVAG    C  +DD     +EIYD  +  WE CDSM
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        P+ L DSA+STWLS+A D  KMYV+ K SG TY+F+P +KTW GP+++R +   + F   IG  G  M+VVGL G +EDV+S+ MWE+  E+   ++  E
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        MP  LVEKLK +S Y+ SI ++ MG+FV++HN  + REV+  E+ +G CRWGSV  A ++ D+ R + +V+SC +V +  L       L TRN
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LDE3 F-box/kelch-repeat protein At1g233901.1e-5837.78Show/hide
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        EEE +I GDILE I+S++PL+DL SA  V+ SW  A+  SL RL T+ PWL +++Q    P  + T  +AYDP+S  W+E+                   
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          +++SS + + S+ RSS S+LLY LS +RF+FS D  HL W+  APP  WR DP+VA VG  +++A  G  C  ++D     L   ++  G WE C+SM
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        P  L +SA+STWLSVA    KMYV+ KRSGVT SF+P T++W    ++   +  S++   IG     +I+ G+ G+  +   + +WE++   E       
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           MP   +EKL+G +   P  SI LN +GD V+VH   E   E+V  E++ G  C+W ++  A A  + S     ++V+CSNV    L+ A  + L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23390.1 Kelch repeat-containing F-box family protein7.7e-6037.78Show/hide
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        EEE +I GDILE I+S++PL+DL SA  V+ SW  A+  SL RL T+ PWL +++Q    P  + T  +AYDP+S  W+E+                   
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          +++SS + + S+ RSS S+LLY LS +RF+FS D  HL W+  APP  WR DP+VA VG  +++A  G  C  ++D     L   ++  G WE C+SM
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCCACGGTCCCACCTCTGGATGGAGGTCCAACAACCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCA
ATCCATTACTTCTCTCTTCTTAGATCCTCCCCCTCCTCCCTCCTCTACATGCTCTCCGCCTCCAGATTTGCCTTCTCCATGGATCCACTCCACCTCAACTGGGAAGTAGC
CGCCCCACCCATCGGGTGGCGCCCCGACCCTGTGGTTGCCGCGGTGGGCAACCATATAGTTGTGGCCGGTTCTGGAGCCTACTGCGGCATACAAGATGATGACACCATTC
CTCCCCTAGAAATCTACGACACCACCACTGGCACGTGGGAGTGGTGCGACTCCATGCCCACGGAGCTCATGGACTCGGCGGCCTCCACTTGGCTGTCAGTTGCGGCGGAC
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CGTGTTCTTCTCGGTGATTGGTTGTGGTGGAAAGGGTATGATAGTGGTGGGTTTGAGGGGAGAGGCGGAGGACGTGAGGAGCGTAGTGATGTGGGAATTATTAGTGGAAA
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TTTGTGCACAACCCTTTGGAGGCCAGGGAGGTCGTTGTGTACGAGGTGAAGGAGGGAGCATGCCGCTGGGGAAGCGTGACAGCAGCCGCCTTGGACCGCGACTCTTGCCG
CTTCCGGAACCTGGTGGTGTCCTGCTCCAACGTAACCCTCCCATACTTGGAACGCGCCCGGAACTCCACGCTTCTCACTCGGAACAAAACCCATGCATTTTAA
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ATCCACGGTCCCACCTCTGGATGGAGGTCCAACAACCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCA
ATCCATTACTTCTCTCTTCTTAGATCCTCCCCCTCCTCCCTCCTCTACATGCTCTCCGCCTCCAGATTTGCCTTCTCCATGGATCCACTCCACCTCAACTGGGAAGTAGC
CGCCCCACCCATCGGGTGGCGCCCCGACCCTGTGGTTGCCGCGGTGGGCAACCATATAGTTGTGGCCGGTTCTGGAGCCTACTGCGGCATACAAGATGATGACACCATTC
CTCCCCTAGAAATCTACGACACCACCACTGGCACGTGGGAGTGGTGCGACTCCATGCCCACGGAGCTCATGGACTCGGCGGCCTCCACTTGGCTGTCAGTTGCGGCGGAC
CAGAACAAAATGTACGTGAGCGTGAAAAGGTCGGGCGTAACGTACTCGTTTGATCCTCGGACAAAAACTTGGTGCGGACCGTACAACGTGCGTGGAGATGATGTGGAAAG
CGTGTTCTTCTCGGTGATTGGTTGTGGTGGAAAGGGTATGATAGTGGTGGGTTTGAGGGGAGAGGCGGAGGACGTGAGGAGCGTAGTGATGTGGGAATTATTAGTGGAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FVHNPLEAREVVVYEVKEGACRWGSVTAAALDRDSCRFRNLVVSCSNVTLPYLERARNSTLLTRNKTHAF