; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G002770 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G002770
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionthioredoxin H-type-like
Genome locationCmo_Chr05:1193035..1194012
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G002770
SyntenyCmoCh05G002770
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013766 - Thioredoxin domain
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598471.1 hypothetical protein SDJN03_08249, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-5899.16Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY SQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

KAG7029408.1 hypothetical protein SDJN02_07747, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-5898.32Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY SQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_022962291.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita moschata]3.1e-59100Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_022997534.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita maxima]4.7e-5594.12Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        +AQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY  QLAKNHPSVIFLEVDVDELK VAFKWDIEAL TFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPA AASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

XP_023547172.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-5797.48Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTA WCGPRRLIAPY SQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BB48 thioredoxin H1-like8.1e-3765Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        M +EG VIAC   SEW+A+L   +ESGKL+VV FTASWCGP R IAPY S+LAKNHP V+FL+VDVDEL  +A +W I A+PTF+F+K G+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAAST
        RAALL+KIEELKT  AAA++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAAST

A0A6J1GHE8 thioredoxin H-type-like5.6e-3865.29Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+EG VIAC   +EW+A L   +ESGKLIVV FTASWCGP R IAPY S+LAKNHP V+FL+VDVDEL  VA +W+I A+PTF+F+KRG+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAASTA
        ++ALL+KIEELKTP AA +++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1HCP9 thioredoxin H-type-like1.5e-59100Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPAAAASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1KBN3 thioredoxin H-type-like2.3e-5594.12Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
        +AQEGNVIACRSTSEWNAVLL+ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPY  QLAKNHPSVIFLEVDVDELK VAFKWDIEAL TFIFLKRGQKSHRIVGTDRA
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRA

Query:  ALLRKIEELKTPAAAASTA
        ALLRKIEELKTPA AASTA
Subjt:  ALLRKIEELKTPAAAASTA

A0A6J1KLL7 thioredoxin H-type-like5.6e-3865.83Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+EG VIAC   +EW+A L   +ESGKLIVV FTASWCGP R IAPY S+LAKNHP V+FL+VDVDEL  VA +W+I A+PTF+F+KRG+  H+IVG D
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAAST
        ++ALL+KIEELKTP AA ++
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAAST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65049 Thioredoxin H-type1.2e-2448.72Show/hide
Query:  EGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAA
        EGNV AC ST  W + L    ++ +L+ V FTA+WCGP R+I P   +L+K  P + FL+VDVDEL+ VA +WD+EA+PTFIF+K G+   ++VG  +  
Subjt:  EGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAA

Query:  LLRKIEELKTPAAAAST
        L RK+  L   AAAA+T
Subjt:  LLRKIEELKTPAAAAST

P29448 Thioredoxin H12.6e-2452.43Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG VIAC +   WN  L +  ES  L+VV FTASWCGP R IAP+ + LAK  P+V+FL+VD DELK VA  W I+A+PTF+FLK G+   ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AAL
          L
Subjt:  AAL

P29449 Thioredoxin H-type 11.4e-2546.61Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG V  C    EWN    +  E+ KL+VV FTASWCGP R IAP ++ +AK  P VIFL+VDVDELK V+ +W +EA+PTF+F+K G++  R+VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AALLRKIEELKTPAAAAS
          L + I +   PA   +
Subjt:  AALLRKIEELKTPAAAAS

Q43636 Thioredoxin H-type1.5e-2450.47Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        A+EG VI C +   WN  L +  ++  LIVV FTASWCGP R IAP++++LAK  P+V FL+VDVDELK VA +W +E++PTF+FLK G+   ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AALLRKI
          L + I
Subjt:  AALLRKI

Q96419 Thioredoxin H-type6.6e-2855.56Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA+E  VIAC +  EWN      ++SGKLIV+ FTASWCGP R+I PYVS+LAK  P V F +VDVD+LK VA ++ +EA+P+F+ LK GQ+  RIVG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  LL KI
Subjt:  RAALLRKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19730.1 Thioredoxin superfamily protein3.3e-2248.15Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNH-PSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        A+EG VI C +   W   L   +ES KLIV+ FTASWC P R+IAP  + LAK    S IF +VDVDEL+ VA ++ +EA+PTF+F+K G+   ++VG +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNH-PSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  L  KI
Subjt:  RAALLRKI

AT1G45145.1 thioredoxin H-type 56.6e-2346.3Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA EG VIAC +   WN  +    ES KLIV+ FTASWC P R IAP  +++AK   +V+F ++DVDEL+ VA ++ +EA+PTF+F+K G    R+VG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKI
        +  +  K+
Subjt:  RAALLRKI

AT3G08710.1 thioredoxin H-type 96.1e-2140.19Show/hide
Query:  GNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAAL
        GNV    +   W+  L      GK++V +F+A+WCGP +++AP+  +L++ H S++FL VDVDEL   +  WDI+A PTF FLK GQ+  ++VG ++  L
Subjt:  GNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAAL

Query:  LRKIEEL
         +K+  +
Subjt:  LRKIEEL

AT3G51030.1 thioredoxin H-type 11.8e-2552.43Show/hide
Query:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR
        ++EG VIAC +   WN  L +  ES  L+VV FTASWCGP R IAP+ + LAK  P+V+FL+VD DELK VA  W I+A+PTF+FLK G+   ++VG  +
Subjt:  AQEGNVIACRSTSEWNAVLLR--ESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDR

Query:  AAL
          L
Subjt:  AAL

AT5G42980.1 thioredoxin 31.8e-2547.46Show/hide
Query:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD
        MA EG VIAC +  +W   L    ES KLIV+ FTA+WC P R IAP  + LAK H  V+F +VDVDEL  VA ++ ++A+PTFIF+K G+    +VG  
Subjt:  MAQEGNVIACRSTSEWNAVL--LRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTD

Query:  RAALLRKIEELKTPAAAA
        +  ++  +E+ KT  AAA
Subjt:  RAALLRKIEELKTPAAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCAAGAAGGAAATGTGATTGCCTGTCGTAGTACTTCTGAATGGAATGCTGTATTGTTGAGAGAATCTGGAAAACTGATTGTGGTGCATTTTACTGCTTCCTGGTG
CGGGCCACGCCGATTAATTGCTCCATATGTCTCACAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATTTTCCTGGAAGTAGACGTCGATGAATTGAAACGTGTTGCTTTCAAGT
GGGATATTGAGGCATTACCGACGTTTATTTTCCTGAAAAGAGGGCAAAAATCTCACAGGATTGTTGGTACTGATAGAGCGGCGCTATTGAGGAAAATAGAAGAGCTTAAA
ACTCCAGCAGCTGCTGCTTCTACTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCAAGAAGGAAATGTGATTGCCTGTCGTAGTACTTCTGAATGGAATGCTGTATTGTTGAGAGAATCTGGAAAACTGATTGTGGTGCATTTTACTGCTTCCTGGTG
CGGGCCACGCCGATTAATTGCTCCATATGTCTCACAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATTTTCCTGGAAGTAGACGTCGATGAATTGAAACGTGTTGCTTTCAAGT
GGGATATTGAGGCATTACCGACGTTTATTTTCCTGAAAAGAGGGCAAAAATCTCACAGGATTGTTGGTACTGATAGAGCGGCGCTATTGAGGAAAATAGAAGAGCTTAAA
ACTCCAGCAGCTGCTGCTTCTACTGCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQEGNVIACRSTSEWNAVLLRESGKLIVVHFTASWCGPRRLIAPYVSQLAKNHPSVIFLEVDVDELKRVAFKWDIEALPTFIFLKRGQKSHRIVGTDRAALLRKIEELK
TPAAAASTA