; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G003050 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G003050
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr05:1351227..1351613
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G003050
SyntenyCmoCh05G003050
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0065168.1 hypothetical protein E6C27_scaffold82G005050 [Cucumis melo var. makuwa]6.1e-4573.68Show/hide
Query:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSS--IMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        KNPAVS R KSNGAN+F+I+V+DDQ+D+RGGSP   ISPAR +SRIRR+LMRF+FY PSRGSS +++++    A K++NLEKFEPPKTSCSS+YSSYSHY
Subjt:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSS--IMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIG     ISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV

KAE8652124.1 hypothetical protein Csa_022629 [Cucumis sativus]6.8e-4473.08Show/hide
Query:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNE
        KNPAVS R KSNGANSF+++V+DDQ+D+RGGSP   ISPAR LSRIRR+ MRF+FY PSRGS+ ++++++   K+RNLEKFEPPKTSCSS+YSSYSHYNE
Subjt:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNE

Query:  AIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAM
        AIADCIEF NKSSQDQIG     ISDANAM
Subjt:  AIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAM

KAG6598497.1 hypothetical protein SDJN03_08275, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-6299.22Show/hide
Query:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASK+RNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
Subjt:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV

KAG7029433.1 hypothetical protein SDJN02_07772, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-6299.22Show/hide
Query:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQED+RGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
Subjt:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV

XP_022996993.1 uncharacterized protein LOC111492057 [Cucurbita maxima]1.5e-5995.31Show/hide
Query:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        MEKNPAVSIR KSNGANSFIINVEDDQED+RGGSPGVSISP RFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSS S SSSIMASK+RNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
Subjt:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPF9 Uncharacterized protein1.1e-4473.28Show/hide
Query:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNE
        KNPAVS R KSNGANSF+++V+DDQ+D+RGGSP   ISPAR LSRIRR+ MRF+FY PSRGS+ ++++++   K+RNLEKFEPPKTSCSS+YSSYSHYNE
Subjt:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNE

Query:  AIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV
        AIADCIEF NKSSQDQIG     ISDANAMV
Subjt:  AIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV

A0A5A7VC16 Uncharacterized protein3.0e-4573.68Show/hide
Query:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSS--IMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        KNPAVS R KSNGAN+F+I+V+DDQ+D+RGGSP   ISPAR +SRIRR+LMRF+FY PSRGSS +++++    A K++NLEKFEPPKTSCSS+YSSYSHY
Subjt:  KNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSS--IMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIG     ISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIG-----ISDANAMV

A0A6A1UVD7 Uncharacterized protein3.7e-1951.79Show/hide
Query:  ANSFIINVEDDQEDFRGGSP--------GVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNEAIADC
        A SF+I V   +   R  +P          + S  +  +R R+ILMR +F  PSRGS  S++S + AS+++N ++FEPPKTSCSS YSS+SHYNEAIADC
Subjt:  ANSFIINVEDDQEDFRGGSP--------GVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNEAIADC

Query:  IEFFNKSSQDQI
        IEFFNKSS D+I
Subjt:  IEFFNKSSQDQI

A0A6J1CRC4 uncharacterized protein LOC1110140421.2e-4174.07Show/hide
Query:  MEK--NPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYS
        MEK  NP V I  K NGA+ F+I+V  DQED+RGGS GVS+SPAR LSRIRR+ MRF+FYFPSRG   SSSS IMAS++RNLEKFEPPKTSCSSNYSSYS
Subjt:  MEK--NPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYS

Query:  HYNEAIADCIEFFNKSS-QDQIGI----SDANAMV
        HY+EAIADCIEFFNKSS Q+QIG+    SD NAMV
Subjt:  HYNEAIADCIEFFNKSS-QDQIGI----SDANAMV

A0A6J1KCK5 uncharacterized protein LOC1114920577.3e-6095.31Show/hide
Query:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
        MEKNPAVSIR KSNGANSFIINVEDDQED+RGGSPGVSISP RFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSS S SSSIMASK+RNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY
Subjt:  MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHY

Query:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
        NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV
Subjt:  NEAIADCIEFFNKSSQDQIGISDANAMV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75717.1 unknown protein2.6e-0947.3Show/hide
Query:  RFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSN-YSSYSHYNEAIADCIEFFNKSS
        +   ++ +ILMR + +     S     ++   S+  + E+FEPPK SCSS+ YSS+ HY+EAIADCIEFFNKSS
Subjt:  RFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSN-YSSYSHYNEAIADCIEFFNKSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAGAATCCAGCCGTTTCGATCAGGCAAAAATCAAACGGAGCAAACAGCTTCATCATTAACGTGGAGGATGATCAAGAGGATTTCAGAGGAGGAAGTCCCGGTGT
AAGCATCTCTCCGGCGAGATTTCTCAGCCGGATCCGCCGGATTCTGATGCGATTCATGTTTTATTTTCCTTCTCGAGGTTCGTCGCCGTCATCGTCGTCGTCAATAATGG
CGTCGAAGCGGAGAAATCTGGAGAAATTCGAGCCGCCGAAGACTTCCTGCAGTTCGAATTACTCGTCTTACTCGCATTACAACGAAGCTATTGCCGATTGCATCGAGTTC
TTCAACAAGTCGTCGCAGGATCAAATCGGAATCTCCGATGCAAATGCGATGGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAAGAATCCAGCCGTTTCGATCAGGCAAAAATCAAACGGAGCAAACAGCTTCATCATTAACGTGGAGGATGATCAAGAGGATTTCAGAGGAGGAAGTCCCGGTGT
AAGCATCTCTCCGGCGAGATTTCTCAGCCGGATCCGCCGGATTCTGATGCGATTCATGTTTTATTTTCCTTCTCGAGGTTCGTCGCCGTCATCGTCGTCGTCAATAATGG
CGTCGAAGCGGAGAAATCTGGAGAAATTCGAGCCGCCGAAGACTTCCTGCAGTTCGAATTACTCGTCTTACTCGCATTACAACGAAGCTATTGCCGATTGCATCGAGTTC
TTCAACAAGTCGTCGCAGGATCAAATCGGAATCTCCGATGCAAATGCGATGGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKNPAVSIRQKSNGANSFIINVEDDQEDFRGGSPGVSISPARFLSRIRRILMRFMFYFPSRGSSPSSSSSIMASKRRNLEKFEPPKTSCSSNYSSYSHYNEAIADCIEF
FNKSSQDQIGISDANAMV