; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G004250 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G004250
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionylmG homolog protein 2, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr05:1977162..1979083
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G004250
SyntenyCmoCh05G004250
Gene Ontology termsGO:0010020 - chloroplast fission (biological process)
GO:0090143 - nucleoid organization (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003425 - CCB3/YggT


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598598.1 YlmG-like protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.1e-12894.51Show/hide
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KAG7029531.1 YlmG-like protein 2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-13394.72Show/hide
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XP_022997245.1 ylmG homolog protein 2, chloroplastic [Cucurbita maxima]9.2e-12891.63Show/hide
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XP_023547092.1 ylmG homolog protein 2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-13093.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BDU1 ylmG homolog protein 2, chloroplastic1.6e-10979.47Show/hide
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A0A5D3BN87 YlmG-like protein 21.6e-10979.47Show/hide
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A0A6J1BR74 ylmG homolog protein 2, chloroplastic2.8e-11481.89Show/hide
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A0A6J1HB64 ylmG homolog protein 2, chloroplastic2.4e-13495.47Show/hide
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A0A6J1K921 ylmG homolog protein 2, chloroplastic4.5e-12891.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O78424 Uncharacterized protein ycf192.0e-0848.61Show/hide
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P51353 Uncharacterized protein ycf191.2e-0541.67Show/hide
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        L+   I NF  IY  L++++L L WFP  N        L+ + DPYL +FRG IPP+ G +D+SP+L  + L
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Q9C595 YlmG homolog protein 2, chloroplastic2.8e-5555.08Show/hide
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         ALP ELP  + +++ A          SS+ KW+RR
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Q9SRS3 YlmG homolog protein 1-1, chloroplastic1.6e-1351.95Show/hide
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        +V  GI+ +L IY+ +L+VR++L+WFPN P     +S +  LCDPYLN+FR IIPP+  TLD+SP+LAF VL    S
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Q9SUE0 YlmG homolog protein 1-2, chloroplastic1.6e-1345.71Show/hide
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        +FR  S   FA++   D  AG L      V  G+  +L IY+ +L+VR++L+WFPN P     +S +  LCDPYLN+FR IIPP+  TLD+SP+LAF VL
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            S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07430.1 YGGT family protein1.1e-1451.95Show/hide
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AT4G27990.1 YGGT family protein1.1e-1445.71Show/hide
Query:  NFRALSSHNFAAVLPGDSVAGLL------VTNGIQNFLSIYNTLLVVRLVLTWFPNTP--PAIVSPLSTLCDPYLNIFRGIIPPLGGTLDLSPILAFLVL
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            S
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AT5G21920.1 YGGT family protein2.0e-5655.08Show/hide
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        PN   S S AF+QTP   S + ++  +PP     K ++D H+S     EK   F HSLAS+NP   + + LSSE   FH   D          I   N+ 
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AT5G21920.2 YGGT family protein1.2e-5351.91Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTCCAGACGAGTCGTCGGTTCTAAACCCTAGACGAAGTTCCACGGCTTTTAGCTTCTTTCCAAATTGCATATCGTCGTTCTCACCGGCATTTTCTCAAACACCTTT
TGGAGCGTCCAGGAGAAGGCACGTCGATTTTGTTCCACCATGTAAATTTCTTCGCGATCTCCATGAGTCTTTCGCGTTAACTGCTGAAAAGTGCATCGTGTTTTTTCACT
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ATCCATGGTTTGAACTCCAGGAATTTCCGAGCTCTCTCCAGTCACAACTTTGCGGCAGTTTTGCCTGGGGATTCGGTGGCAGGACTTTTGGTCACGAATGGTATTCAGAA
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GGAAAATAAGGCTGATAGCGCTCGATAG
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GAAGTTCCACGGCTTTTAGCTTCTTTCCAAATTGCATATCGTCGTTCTCACCGGCATTTTCTCAAACACCTTTTGGAGCGTCCAGGAGAAGGCACGTCGATTTTGTTCCA
CCATGTAAATTTCTTCGCGATCTCCATGAGTCTTTCGCGTTAACTGCTGAAAAGTGCATCGTGTTTTTTCACTCTTTAGCTTCCGAGAATCCGTTTCTCAATAAATTGAT
GTCGTTGTCTTCTGAGTTACAGAGTTTTCATCACCAGTTTGATTTTCAGCTAGAATACGACCTGCTGCTTACGATCCATGGTTTGAACTCCAGGAATTTCCGAGCTCTCT
CCAGTCACAACTTTGCGGCAGTTTTGCCTGGGGATTCGGTGGCAGGACTTTTGGTCACGAATGGTATTCAGAATTTCTTGAGCATCTACAACACACTGTTGGTCGTCAGG
CTAGTTTTGACTTGGTTTCCGAACACACCTCCCGCCATTGTTAGTCCACTAAGCACGCTATGTGACCCATATTTGAACATATTTCGTGGGATTATCCCACCTCTTGGGGG
GACACTTGATTTGTCTCCAATATTGGCATTCCTGGTCTTAAACGCCTTTACCAGCACCGCCGCTGCTCTTCCTGCCGAACTTCCAGTCCCAAATTCGTCTCTCGCAAATG
CTACTCCTTCAAAAGGCTCATTTGATCTTACCTCATCCCAAAAGAAATGGATCAGAAGGCTTCAGGGAAGTGGGGAAAATAAGGCTGATAGCGCTCGATAGCCCTCGAAT
TCAGGTTTGTATCAGTTCATTCAGCTCAATTCATTTGAAACTGTGACACTTTCATGCTTAAAAACCTCTCTGTTGTAAAGTGCGGTTGATGGGATTACTATTTTGTGCCA
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TAAAAATTGCATGTAAATTTTATATTTTGTAGAATTTTCACACTATTTGTCTCCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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