; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G005000 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G005000
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCmo_Chr05:2404719..2407671
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G005000
SyntenyCmoCh05G005000
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR031851 - Protein of unknown function DUF4750


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1HD13 uncharacterized protein LOC111462391 isoform X22.4e-41100Show/hide
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A0A6J1HES4 uncharacterized protein LOC111462391 isoform X12.4e-41100Show/hide
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A0A6J1KB20 uncharacterized protein LOC111492244 isoform X27.9e-4096.74Show/hide
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A0A6J1KDG2 uncharacterized protein LOC111492244 isoform X17.9e-4096.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G36380.1 unknown protein1.6e-1663.08Show/hide
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        F++RP+LA+ F    I+L WFLAWKLVL HVPLVQEIFGLRKK+  PKP +R R++KFY ++ SQ
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCGTCGTCTTCCTCGTTTTCATCTTTCGAGAATTCTTTTTCTCAATGGGATTATCTCAATATATTCATACTACGCCCGATCCTTGCCGTCGTGTTCACGTTCTC
CTTGATTTCTCTTGGTTGGTTTTTGGCGTGGAAGCTCGTTCTTGTTCACGTCCCTCTGGTGCAAGAAATTTTTGGCTTGCGTAAGAAATCCGTCAAACCGAAGCCTCCAA
CCCGCCGACTATCGAAATTTTATAATAATTTGGATTCCCAAACTTCAGCTTCTGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCACTCCTCGTGCAATTGAGCTCTTCTAATGGAGTCGTCGTCTTCCTCGTTTTCATCTTTCGAGAATTCTTTTTCTCAATGGGATTATCTCAATATATTCATACTACGCC
CGATCCTTGCCGTCGTGTTCACGTTCTCCTTGATTTCTCTTGGTTGGTTTTTGGCGTGGAAGCTCGTTCTTGTTCACGTCCCTCTGGTGCAAGAAATTTTTGGCTTGCGT
AAGAAATCCGTCAAACCGAAGCCTCCAACCCGCCGACTATCGAAATTTTATAATAATTTGGATTCCCAAACTTCAGCTTCTGGCTGATGACTGTGATGGTGATTGCTTCA
TCGAGTTCTGACATGAGCAATGGCTTATGCTTTGTTTTATTGTGACTGTAAATTCGGGTTACTCGAGTTCTTCAAGTTGTATATATTCACTTCTCTTCTCAATTTCAAAG
TCTTTACTCTTGTAAATTTGGGTTGCATTTGTTGGACTAGTTATGGCTATTTTATCTTCATGAAGTTTTCTTTTTTCATTATTAATCGGGTTCGTTCTTAAAGAAACTGT
GAATAGTATTTATTCGAAAAGTCGGGCTGATACGGTACGTTGAGTGTGATTGTGGGTTTTGTCGTCATTTGGATTGGAGTGGAGTGCTCTAGTTTGTGTGTTTCCCAGGT
TAGGTCGAGTAATTAGGGGTCGGCTTGAGATTGATTGAAAAGGCAGCCCAGCCACCCTCTCCCTAGTTGCCTACCTACTCGTGCTCGTAGCTCGATCGGAGGCGAGTGTG
GTCCGGCAAAAAAGCATAAATCGTCCGTTTCGACGTGATACATGGCGGAAATAGCTTCATGGTATAGCATAGTCTTGCCAAGGCTGAGGTCGAGGGTGCAAGTCTCTCCT
TCCGCTCAAGGCTTCATCGTTCAAGGGGTGCATCGCCTTCGAAATCTAGTCTTTCCAATATTTTTTGTCTGTCTTTATTTGTCTACCTTTTCCATCTTTTAAGGATACAT
GGGGAGGACAAGATTGTTTTTCAAGCCACGTCTAAGACAAACATGACCATATATTCATGGGTTCTTTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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