; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G006030 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G006030
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionoxidative stress 3
Genome locationCmo_Chr05:3019086..3019858
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G006030
SyntenyCmoCh05G006030
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598765.1 hypothetical protein SDJN03_08543, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-7093.87Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG------SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKF
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG      SSSSSSLCDDDALSSF SSSSSSSSLLS+REVCEEQQLLCIKKGLSKF
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG------SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKF

Query:  YEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        YEGKSRTFSSLSDVKCV+DLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVS+MDISLRPE
Subjt:  YEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

KAG7029705.1 hypothetical protein SDJN02_08047 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-7094.48Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG------SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKF
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG      SSSSSSLCDDDALSSF SSSSSSSSLLS+REVCEEQQLLCIKKGLSKF
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG------SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKF

Query:  YEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        YEGKSRTFSSLSDVKCV+DLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
Subjt:  YEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

XP_022961691.1 uncharacterized protein LOC111462384 [Cucurbita moschata]5.3e-75100Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT

Query:  FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
Subjt:  FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

XP_022996858.1 uncharacterized protein LOC111491976 [Cucurbita maxima]3.9e-7096.18Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG-SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSR
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLL FSVVSCSEDSTSSIG SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLL IKKGLSKFYEGKSR
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG-SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSR

Query:  TFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        TFSSLSDVKCV++LAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGR SLATLVSKMDISLRPE
Subjt:  TFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

XP_023546661.1 uncharacterized protein LOC111805706 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-6793.12Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG---SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEG
        MEFRKLTVDADFATSLFNRK+EKCFIPHLLHFS VSCSEDSTSSIG   SSSSSSLCDDDALSSF SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLL IKKGLSKFYEG
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG---SSSSSSLCDDDALSSF-SSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEG

Query:  KSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        KSRTFSSLSDVKCV+DLAKG+NDYRKKYSRITPKATI KKHGRASLATL SKMDISLRPE
Subjt:  KSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLW5 Uncharacterized protein3.4e-1163.74Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSS------SSSSSLLSQREVCEEQ
        ME RKLTVDADFATS+    +NRKEEK  I H      V+ SE STSSIGS SSSS+CD+DALSSFSSS      SS+SSLLSQ E+ E+Q
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSS------SSSSSLLSQREVCEEQ

A0A1S3BBN3 uncharacterized protein LOC1034881655.1e-3968.1Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSS---------SSLLSQREVCEEQQLLCIK
        ME RKLTVDADFATS+    +NRKEEK  I H      V+ SE STSSIGS SSSS+CDDD LSSFSSSSSS         SSLLSQ E+ E+Q  + IK
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSS---------SSLLSQREVCEEQQLLCIK

Query:  KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMD
        KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVK ++DLAK E D+RKK +RI+PKATISKKHGR+  ATLVSK D
Subjt:  KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMD

A0A5A7VFF0 Uncharacterized protein1.1e-3868.1Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSS---------SSLLSQREVCEEQQLLCIK
        ME RKLTVDADFATS+    +NRKEEK  I HL     V+ SE STSSIGS SSSS+CDDD LSSFSSSSSS         SSLLSQ E+ E+Q  + IK
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSL----FNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSS---------SSLLSQREVCEEQQLLCIK

Query:  KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMD
        KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVK + DLAK + D+RKK +RI+PKATISKKHGR+  ATLVSK D
Subjt:  KGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMD

A0A6J1HB27 uncharacterized protein LOC1114623842.6e-75100Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRT

Query:  FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
Subjt:  FSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

A0A6J1KC75 uncharacterized protein LOC1114919761.9e-7096.18Show/hide
Query:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG-SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSR
        MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLL FSVVSCSEDSTSSIG SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLL IKKGLSKFYEGKSR
Subjt:  MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIG-SSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSR

Query:  TFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE
        TFSSLSDVKCV++LAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGR SLATLVSKMDISLRPE
Subjt:  TFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.5e-0639.64Show/hide
Query:  STSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQ------REVCEEQQLLCIKK-GLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSR---ITPK
        S++ + SSSS S+C  D     SSSSSSSS  S        ++  +  ++ +KK GLSK+Y+GKS++F+SL++V  + DL K  +  +    R     PK
Subjt:  STSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQ------REVCEEQQLLCIKK-GLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAKGENDYRKKYSR---ITPK

Query:  ATISKKHGRAS
        ATIS K  R S
Subjt:  ATISKKHGRAS

AT5G56550.1 oxidative stress 33.9e-0740.77Show/hide
Query:  SCSEDSTSSIGSSSS--SSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAK---GENDY--RKKYSRIT
        S  ED++SS   SSS  S   +DD     SSSSS+  L    ++ +    L IK+GLSKFYEGKS++F+SL +VK ++DL K      +Y  ++K SR T
Subjt:  SCSEDSTSSIGSSSS--SSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCVDDLAK---GENDY--RKKYSRIT

Query:  -------------PKATISKKHGRASLATL
                     PKATISKK  R   + L
Subjt:  -------------PKATISKKHGRASLATL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTCAGGAAGTTGACAGTTGATGCAGATTTTGCTACAAGTCTTTTTAATAGAAAGGAAGAGAAATGTTTTATCCCTCATCTTCTTCACTTTAGCGTCGTATCGTG
TTCGGAAGATTCAACTAGTTCAATTGGATCATCGTCGTCGTCAAGCCTCTGTGACGACGATGCGTTATCGTCATTTTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGTCTTTGTTATCTC
AAAGAGAAGTTTGTGAGGAACAACAGCTGCTTTGTATCAAAAAAGGGTTGTCAAAATTTTATGAAGGGAAATCACGAACCTTCTCATCCTTATCCGACGTGAAATGCGTA
GACGACTTAGCAAAGGGAGAGAATGATTATAGAAAGAAATACTCTCGAATTACTCCCAAGGCTACCATATCAAAGAAGCATGGAAGAGCCTCTCTTGCAACCTTAGTGTC
TAAGATGGACATTTCACTTCGCCCCGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTTCAGGAAGTTGACAGTTGATGCAGATTTTGCTACAAGTCTTTTTAATAGAAAGGAAGAGAAATGTTTTATCCCTCATCTTCTTCACTTTAGCGTCGTATCGTG
TTCGGAAGATTCAACTAGTTCAATTGGATCATCGTCGTCGTCAAGCCTCTGTGACGACGATGCGTTATCGTCATTTTCATCTTCTTCTTCTTCGTCGTCTTTGTTATCTC
AAAGAGAAGTTTGTGAGGAACAACAGCTGCTTTGTATCAAAAAAGGGTTGTCAAAATTTTATGAAGGGAAATCACGAACCTTCTCATCCTTATCCGACGTGAAATGCGTA
GACGACTTAGCAAAGGGAGAGAATGATTATAGAAAGAAATACTCTCGAATTACTCCCAAGGCTACCATATCAAAGAAGCATGGAAGAGCCTCTCTTGCAACCTTAGTGTC
TAAGATGGACATTTCACTTCGCCCCGAGTAAAGGGAAGCTCGAACTATTTATCGTTAGTGTCAAGTTTAATGGGCGGTTCTAAAATTTACTTGATACGGGAAAATGATGA
AATGTTTTTTTCTTCTTTTGTTGATATACTTCGAGTATAAGATAGAATATGTGCAAGTTTTATAATTTTGATTTTGGGCTTTCGAGCTAAAGCTAGAGTAAAAGTATTTT
ATCTTAATGGGACCAACTACGAATATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEFRKLTVDADFATSLFNRKEEKCFIPHLLHFSVVSCSEDSTSSIGSSSSSSLCDDDALSSFSSSSSSSSLLSQREVCEEQQLLCIKKGLSKFYEGKSRTFSSLSDVKCV
DDLAKGENDYRKKYSRITPKATISKKHGRASLATLVSKMDISLRPE