CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh05G007240
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	40S ribosomal protein S8
Genome location	Cmo_Chr05:3766188..3767862
RNA-Seq Expression	CmoCh05G007240
Synteny	CmoCh05G007240
Gene Ontology terms	GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process) GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR001047 - Ribosomal protein S8e IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6598870.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.3e-116

99.54

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

KAG7029811.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

5.1e-116

99.54

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        +GISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]

1.8e-116

100

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022937545.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]

1.1e-113

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS+KKEEE DA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGA+
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]

8.2e-114

97.26

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT+ASAKK+EEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S8

6.7e-114

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S8

6.7e-114

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1EP23 40S ribosomal protein S8

8.5e-117

100

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1FH17 40S ribosomal protein S8

5.2e-114

97.72

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT AS+KKEEE DA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGA+
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S8

8.5e-117

100

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O81361 40S ribosomal protein S8

2.0e-102

86.88

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+R+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE--EEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT A+AKK+  EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEG
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE--EEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEG

Query:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  KELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S8

1.1e-102

87.33

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A AKK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S8

7.4e-102

85.52

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEG---DAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-1

2.5e-97

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRK+R+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-2

1.9e-97

83.56

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+RILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein

1.8e-98

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRK+R+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+ +S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKE-EEGD----APTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein

1.3e-98

83.56

Show/hide

Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTK+SS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRK+RILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGGGAATTTCTCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGAGAAAGTATGAGCTCGGAAGGCAACCTGCCAAC
ACCAAGATATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGCGGGGGCAATGTGAAGTGGCGTGCTTTTAGGCTTGATACTGGAAACTACTCTTGGGGTAGT
GAGGCCGTGACTAGGAAGTCACGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCCAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTGGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTT
GATGCAGCACCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGACGGAAGAAGAAGACCGTAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCT
CCAACTGAAGAGGTAAAGAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTAAGCTCGATCCGCATATCGAAGAACAATTCAGCAGTGGT
CGATTGATGGCTTGTATCTCATCAAGACCAGGTCAATGTGGCCGAGCAGACGGATATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTTGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGA
AAGAAGGGAAAGGGAGCTGGTGCTGCATAAATTATTTTGTAATCGAGTTTTTCTTCAGCCCATGTTTCCTGTTCTTTTTATCTGTTCAAGCTATTTTGGTACTTC
GATTTTGTTGGTAATAGTTGCTACGTTTTGACCTTTTCGTGATCACAACAGTTTGTTTATTAGCATGAGTTTTCAAGTTTCAAAACCTTTTGTCCTACTCCTTTT
ATGTAAGCGAGTTGGTTTGGTGTTTGATCTACAATTTTTACAGAAAAGTTCTAATGGATTAGGGCGAATGGCAAACACCTGGGTTTCTAGAAAAATAAAAAATGA
AGTATTAGAAAAATTGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKISSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKSRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQV
DAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTVASAKKEEEGDAPTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQR
KKGKGAGAA

CmoCh05G007240 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome