CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh05G011090
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	TPR_REGION domain-containing protein
Genome location	Cmo_Chr05:8842464..8846187
RNA-Seq Expression	CmoCh05G011090
Synteny	CmoCh05G011090
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domains	IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily IPR019734 - Tetratricopeptide repeat

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7030139.1 hypothetical protein SDJN02_08486, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.0e-147

97.41

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFH+SFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD-----RFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGH
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD     RFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGH
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD-----RFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGH

Query:  PENLVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        PENLVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  PENLVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_022946000.1 uncharacterized protein LOC111450218 isoform X1 [Cucurbita moschata]

8.6e-150

100

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_022999589.1 uncharacterized protein LOC111493913 isoform X3 [Cucurbita maxima]

4.4e-146

97.74

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNS KPLENLHSPSS PMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_023545315.1 uncharacterized protein LOC111804759 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.5e-146

97.36

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAIS+LKPSISMSRSFHISFTAPSLPNS KPLENLHSP+SFPM+IKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRF+EGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_038889663.1 uncharacterized protein LOC120079523 [Benincasa hispida]

1.2e-135

91.32

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLK SIS+S S HI F APS PNS K LE  HSPSS PMRI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRD R VMREAYNMFKDGGHPE L+
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAAL +VHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LGH0 TPR_REGION domain-containing protein

3.5e-133

90.19

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA  SSLK SIS+S S H SFTAPS  NS K +E  HSPSS PMRI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKK+DAAKQ IVAACQS Y QRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A5D3BC02 TPR_REGION domain-containing protein

3.0e-132

89.43

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA  S LK SIS+S S H SFTAPS  NS K +EN HSP+S P+RI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFK+GGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKK+DAAKQHIVAACQS YGQRSDDYMAALAKVHCL RNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A6J1DQ08 uncharacterized protein LOC111023257

1.9e-131

89.43

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA ISSLKP+ISM RS   SFTAPSLPNSI   E   SP+S PMRIKLN +P  SLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFR+GDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCF+CEAQLYGVDE+RRRFLEVGRD R VMREAY+MFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHE+EK LDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A6J1G2K4 uncharacterized protein LOC111450218 isoform X1

4.1e-150

100

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A6J1KHI1 uncharacterized protein LOC111493913 isoform X3

2.1e-146

97.74

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNS KPLENLHSPSS PMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q1C3L9 Lipoprotein NlpI

6.0e-05

29.33

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +PND   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL

Q1CM50 Lipoprotein NlpI

6.0e-05

29.33

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +PND   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL

Q7CKI5 Lipoprotein NlpI

6.0e-05

29.33

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +PND   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G05625.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein

2.5e-99

67.42

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGG--NNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVS
        M+    + P I  SR+    FTA S   ++ P  + H              PP +LSRRLF+PSVS IWDA+TGG  +NPR+A+ A+RRGM LFR+GDV+
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGG--NNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVS

Query:  GSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPEN
        GS+AEFD+AI LDPRQKAYLWQRGLSLYY+DRFEEGAEQFR+DVAQNPNDTEESIWCF+CEA+L+GVD AR +FLEVGRD R VMREAYN+FK+GG PE 
Subjt:  GSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPEN

Query:  LVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        LV  FSSG+ +EYFYASLYAGLY+EAE K + AK H+ AAC SPYGQRSDDYMA+LAKVHCLCRNWS
Subjt:  LVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGCAATTTCCAGTCTCAAACCCTCCATCTCCATGTCTCGTTCGTTTCACATATCTTTCACCGCGCCTTCTTTACCAAATTCAATTAAACCCCTCGAAAATCTCCA
CTCTCCGAGCTCGTTTCCAATGAGAATCAAGCTCAATCACGTTCCTCCATTATCATTATCTAGAAGATTGTTCGTTCCTTCCGTCTCTGGAATTTGGGACGCCCTAACAG
GGGGAAACAACCCTCGCGACGCTGTTACTGCTATTCGACGCGGAATGCTTCTCTTCAGAGAGGGCGATGTTTCAGGATCTTTAGCAGAATTCGACAAGGCAATTGAATTG
GATCCTCGTCAAAAGGCATATCTTTGGCAAAGAGGGCTTTCACTTTACTATCTTGATAGATTTGAAGAGGGAGCCGAGCAGTTCCGACTAGACGTTGCACAAAATCCGAA
CGACACAGAGGAATCTATTTGGTGCTTTGTTTGTGAGGCTCAATTGTATGGAGTTGATGAAGCAAGAAGGCGATTTCTTGAGGTAGGTAGAGATCCACGATCAGTCATGA
GGGAAGCTTATAATATGTTTAAAGATGGTGGCCATCCTGAGAATCTTGTTGCTGCCTTCTCAAGTGGCCGTGAGAATGAATACTTTTATGCTTCTCTATATGCTGGGCTT
TATCACGAAGCAGAGAAAAAATTGGATGCTGCCAAACAGCATATAGTTGCAGCTTGCCAGTCTCCATATGGACAGAGGTCTGATGATTACATGGCCGCTCTTGCCAAAGT
TCACTGCCTCTGTCGAAACTGGAGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TCTTCATCATCTGAAAAATGGACGGTGCAGAGCCATCGTCTCCAAATTCTCACAACTACTCCCCTGCCGAGCACAATCTTCTTCAACTTCATCGCGTTCTTCACCAATGG
CTGCAATTTCCAGTCTCAAACCCTCCATCTCCATGTCTCGTTCGTTTCACATATCTTTCACCGCGCCTTCTTTACCAAATTCAATTAAACCCCTCGAAAATCTCCACTCT
CCGAGCTCGTTTCCAATGAGAATCAAGCTCAATCACGTTCCTCCATTATCATTATCTAGAAGATTGTTCGTTCCTTCCGTCTCTGGAATTTGGGACGCCCTAACAGGGGG
AAACAACCCTCGCGACGCTGTTACTGCTATTCGACGCGGAATGCTTCTCTTCAGAGAGGGCGATGTTTCAGGATCTTTAGCAGAATTCGACAAGGCAATTGAATTGGATC
CTCGTCAAAAGGCATATCTTTGGCAAAGAGGGCTTTCACTTTACTATCTTGATAGATTTGAAGAGGGAGCCGAGCAGTTCCGACTAGACGTTGCACAAAATCCGAACGAC
ACAGAGGAATCTATTTGGTGCTTTGTTTGTGAGGCTCAATTGTATGGAGTTGATGAAGCAAGAAGGCGATTTCTTGAGGTAGGTAGAGATCCACGATCAGTCATGAGGGA
AGCTTATAATATGTTTAAAGATGGTGGCCATCCTGAGAATCTTGTTGCTGCCTTCTCAAGTGGCCGTGAGAATGAATACTTTTATGCTTCTCTATATGCTGGGCTTTATC
ACGAAGCAGAGAAAAAATTGGATGCTGCCAAACAGCATATAGTTGCAGCTTGCCAGTCTCCATATGGACAGAGGTCTGATGATTACATGGCCGCTCTTGCCAAAGTTCAC
TGCCTCTGTCGAAACTGGAGTTGAAGTTAGTACAATTTTCAGCTAATTGCTTTGATGCCATATTCTACAATTTCTCTCTTTTCCTTCCCGTGTTCACTCTAGCGTTTTAG
ATCGGAATTCAAATTCTAACGATATCATATGAGGATGCCTGAACCAAATTGGTTCGGATCGTAATCTATCCATTTCAAGTGGGTTGAAAAAAAAAAGAAGGTGCATTTTG
GTCTTTTTTTCGTTGAATCCAACATGGGAGTGGAGAGGATTCAAGCCTCGGGTCTCTTAGTCAGATTATATATTTTAACTTGTTAATTTATGTTCGAATTGACTCTAACT
TGTTGTGAGAGTGAGTAAGATTCAAGTCCTCGATCTCTTAGTCAAGAATATATGCCATAATTAGTTAACTTATATTCGAGCCGGCTGTTTTTTGTTGTGAAAGTGTGAAA
GATTCAAGTCTCAAATTTCTTA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSIKPLENLHSPSSFPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVTAIRRGMLLFREGDVSGSLAEFDKAIEL
DPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPNDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRSVMREAYNMFKDGGHPENLVAAFSSGRENEYFYASLYAGL
YHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

CmoCh05G011090 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome