; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G011100 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G011100
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionF-box protein PP2-B15-like
Genome locationCmo_Chr05:8847021..8848137
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G011100
SyntenyCmoCh05G011100
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599205.1 F-box protein PP2-B15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-16198.63Show/hide
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XP_023545312.1 F-box protein PP2-B15-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-16198.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DQK9 F-box protein VBF-like8.4e-11269.46Show/hide
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A0A6J1G464 F-box protein PP2-B15-like3.5e-15896.59Show/hide
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A0A6J1KF36 F-box protein PP2-B15-like3.0e-15794.88Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B158.5e-6142.71Show/hide
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Q3E6P4 F-box protein At2g022402.5e-5242.07Show/hide
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        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +V+ S +       SK+E +F LC +P+LIE GKKSF LE+ SGK
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         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T Y AY+V KT ++  GL  +P +V + L              
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Q9C7J9 F-box protein PP2-B136.8e-5844.21Show/hide
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Q9C7K0 F-box protein VBF5.2e-5843.71Show/hide
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Q9ZVQ6 F-box protein PP2-B103.1e-4739.3Show/hide
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        PEDC+S I+S T P DA   + VS TF S  +SD++W +FLP +Y  ++  S +       SK+E +F LC+ P+L +  KKS  LE+ SGK C  LSA 
Subjt:  PEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCS-PILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSAR

Query:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLK
         L+I W  +P  W W   P+SRF +VA+LR   W EI GRT T  LSP T Y AY+V K  +K YG   +          A++++ G V      +    
Subjt:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLK

Query:  MESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTG---EDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
         E++  G R                    +   +QREDGW EIELGEFF      D++ + MS LETK    K GL++Q I+IRP
Subjt:  MESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTG---EDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B156.1e-6242.71Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA
        +LPE CV+ ILS TTP D    + VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  ILI+ G+K F++E+ SGKI Y LS+
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL
        R+L+ITWS     WSW     SRF+E  +L  + W+EI G+ +TG LSPNT YGAYL++K + + YGLDL+PA+  +++G+  +    S +L   +    
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL

Query:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT----GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
        +ME +FYG R +R               +  R+   R+DGW EIELGEF T    G+DD+ + MS  E KG+QLK G+ +  I++RPK
Subjt:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT----GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK

AT1G56240.1 phloem protein 2-B134.8e-5944.21Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA
        +LPE CV+ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S         SK+E +  LC  +LI+  +K F++ +FSGKI Y LSA
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL
        R+++IT+S      SW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LSPNT YGAYL++K +   YGLDL+PA+  V+  +  Q+++ + +L   ++   
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL

Query:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
        +M+ LFYGNR ER      A  GD       R+ + R+DGW EIELGEF T  GEDDE + MS  E KG+QLK G+V+  I++RP
Subjt:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP

AT1G56250.1 phloem protein 2-B143.7e-5943.71Show/hide
Query:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA
        +LPE C++ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S       + SK+E +  LC  +LI+  +K F++ +FSGKI Y LSA
Subjt:  VLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL
        R+++IT S     WSW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LS NT YGAYL+VK ++  YGLDL+PA+  ++  +  Q S+ + +L   ++   
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL

Query:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
        +M+ LFYGNR ER      A  GD       R+ + R+DGW EIELGEF T  GEDDE + M+  E KG+QLK G+++  I++RPK
Subjt:  KMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK

AT2G02240.1 F-box family protein1.8e-5342.07Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLC-SPILIEGGKKSFELERFSGK
        G S   VLPEDC+S I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +V+ S +       SK+E +F LC +P+LIE GKKSF LE+ SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLC-SPILIEGGKKSFELERFSGK

Query:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLR
         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T Y AY+V KT ++  GL  +P +V + L              
Subjt:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLR

Query:  RKEQSNLKMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
           Q + K    F G R  R  +          ++  +    QREDGW E ELGEFF  E  + +  S +E K    KSGL++Q I+ RP
Subjt:  RKEQSNLKMESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP

AT2G02360.1 phloem protein 2-B102.2e-4839.3Show/hide
Query:  PEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCS-PILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSAR
        PEDC+S I+S T P DA   + VS TF S  +SD++W +FLP +Y  ++  S +       SK+E +F LC+ P+L +  KKS  LE+ SGK C  LSA 
Subjt:  PEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCS-PILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSAR

Query:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLK
         L+I W  +P  W W   P+SRF +VA+LR   W EI GRT T  LSP T Y AY+V K  +K YG   +          A++++ G V      +    
Subjt:  ELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLK

Query:  MESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTG---EDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
         E++  G R                    +   +QREDGW EIELGEFF      D++ + MS LETK    K GL++Q I+IRP
Subjt:  MESLFYGNRRERAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTG---EDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGGGAAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACATT
CCGATCAGCGGCGGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAAAAACTACGCCGAAATCGTGGCCGCCTCTGATATCTCCGGCGAATCGCCACTCTGTTCGAAGA
GAGAAGCTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTAATCGAAGGCGGAAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAGATCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAG
CTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCTCAGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCA
TGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTGTACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGACTTCAGAGAAAGGGTATGGGTTGGATTTGATGCCAGCCCAAGTTT
GTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTCAAAATGGAGTCTCTGTTTTATGGGAATCGGAGGGAG
AGAGCCATAAAGCTATTCGCTGCCGATTTGGGAGACAATTTTGATAGCAACGGAATTAGGGATGTCCGACAGAGAGAAGATGGGTGGTCGGAGATTGAATTGGGAGAGTT
CTTCACCGGAGAAGACGATGAACACCTCACCATGAGCTTCTTGGAGACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCCGGACTTGTTGTTCAAGCCATTCAAATCCGGCCTAAACATT
AA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGGATTTTTTTGACTGTGAACAAAAAAATGGCCGGAATTTCGAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTGTTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGG
GAAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACATTCCGATCAGCGGCGGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAAAAACTACGCCGAAATCGTGGCCGCCTCTGATATCT
CCGGCGAATCGCCACTCTGTTCGAAGAGAGAAGCTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTAATCGAAGGCGGAAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAG
ATCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAGCTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCT
CAGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCATGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTGTACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGACTTCAGAGAAAGGGTATG
GGTTGGATTTGATGCCAGCCCAAGTTTGTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTCAAAATGGAG
TCTCTGTTTTATGGGAATCGGAGGGAGAGAGCCATAAAGCTATTCGCTGCCGATTTGGGAGACAATTTTGATAGCAACGGAATTAGGGATGTCCGACAGAGAGAAGATGG
GTGGTCGGAGATTGAATTGGGAGAGTTCTTCACCGGAGAAGACGATGAACACCTCACCATGAGCTTCTTGGAGACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCCGGACTTGTTGTTC
AAGCCATTCAAATCCGGCCTAAACATTAACCAACACATCAATCCGAGCATACCGTTCCTGGATCGATACGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGISSIGVLPEDCVSAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPKNYAEIVAASDISGESPLCSKREAFFRLCSPILIEGGKKSFELERFSGKICYTLSARE
LAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKTSEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLKMESLFYGNRRE
RAIKLFAADLGDNFDSNGIRDVRQREDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPKH