; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh05G011360 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh05G011360
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCmo_Chr05:9047197..9047496
RNA-Seq ExpressionCmoCh05G011360
SyntenyCmoCh05G011360
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.1e-4590.91Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        S SSTAV G LGIQHS+ WIPNQ+ CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]8.1e-4590.91Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        S SSTAV G LGIQHS+ WIPNQ+ CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

XP_022946251.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]1.4e-49100Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

XP_022999036.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]1.6e-4897.98Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQA CKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

XP_023545341.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-4998.99Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQA CKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DA82 protein RALF-like 339.7e-4490.72Show/hide
Query:  SSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SSTAV G LGI HS+AWIP+Q+ CKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  SSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 333.9e-4590.91Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        S SSTAV G LGIQHS+ WIPNQ+ CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

A0A6J1G345 protein RALF-like 336.9e-50100Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.5e-4489.9Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        S SSTAV G LGI HS+ WIPNQ+ CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

A0A6J1KBV3 protein RALF-like 337.6e-4997.98Show/hide
Query:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQA CKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 334.5e-3072.73Show/hide
Query:  QHSVAWIPNQAICKGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        Q S  ++P ++ C G+IAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCSAITRCR
Subjt:  QHSVAWIPNQAICKGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.7e-2966.67Show/hide
Query:  FSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        F S A  G  G    V    +   CKGSI EC    EEFE DSE +RRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPY+RGCSAITRCRS
Subjt:  FSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.5e-2866.32Show/hide
Query:  PNQAICKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        P +  C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCSAITRCR
Subjt:  PNQAICKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 229.4e-2879.73Show/hide
Query:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        C GSIAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPY+RGCS ITRCR
Subjt:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 18.5e-2972.09Show/hide
Query:  VAWI---PNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        VAW     N + C GSIAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPY+RGCS I RCRS
Subjt:  VAWI---PNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.0e-3072.09Show/hide
Query:  VAWI---PNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS
        VAW     N + C GSIAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPY+RGCS I RCRS
Subjt:  VAWI---PNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 196.5e-1660.94Show/hide
Query:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRC
        G  ++  DSE +RR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 226.6e-2979.73Show/hide
Query:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        C GSIAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPY+RGCS ITRCR
Subjt:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.7e-2966.32Show/hide
Query:  PNQAICKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        P +  C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCSAITRCR
Subjt:  PNQAICKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 333.2e-3172.73Show/hide
Query:  QHSVAWIPNQAICKGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR
        Q S  ++P ++ C G+IAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCSAITRCR
Subjt:  QHSVAWIPNQAICKGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGCTTCTCCTCAACCGCCGTCCTCGGAAGCCTCGGGATCCAGCACAGCGTTGCATGGATTCCTAACCAGGCGATCTGCAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGA
GGAGTTCGAATTTGATTCCGAAATCAGCCGCCGTATCTTGGCCACCAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTACCTTGCTCCAGACGCGGTGCAT
CCTACTACAATTGCCAGCCTGGAGCTCAGGCCAATCCCTATACTCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCTTCTCCTCAACCGCCGTCCTCGGAAGCCTCGGGATCCAGCACAGCGTTGCATGGATTCCTAACCAGGCGATCTGCAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGA
GGAGTTCGAATTTGATTCCGAAATCAGCCGCCGTATCTTGGCCACCAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTACCTTGCTCCAGACGCGGTGCAT
CCTACTACAATTGCCAGCCTGGAGCTCAGGCCAATCCCTATACTCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SFSSTAVLGSLGIQHSVAWIPNQAICKGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYTRGCSAITRCRS