; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G002570 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G002570
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationCmo_Chr06:1306889..1309065
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G002570
SyntenyCmoCh06G002570
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005874 - microtubule (cellular component)
GO:0016757 - transferase activity, transferring glycosyl groups (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29516 Tubulin beta-8 chain6.5e-25495.91Show/hide
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P37392 Tubulin beta-1 chain2.2e-25496.15Show/hide
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Q9ZPN7 Tubulin beta-4 chain2.5e-25394.84Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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TATTCCATTCCCTCGTCTCCACTTTTTCATGGTTGGGTTTGCTCCCCTCACATCCCGTGGATCCCAACAATACAGAGCTCTTACAGTGCCTGAGCTCACTCAGCAAATGT
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AACTTGTTGAAAACGCCGACGAGTGTATGGTACTTGACAACGAAGCTCTCTACGATATTTGCTTCCGTACCCTCAAGCTCTCCACCCCAAGCTTCGGTGATCTTAACCAT
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VADHDE