; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G002790 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G002790
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH155-like isoform X1
Genome locationCmo_Chr06:1402938..1406691
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G002790
SyntenyCmoCh06G002790
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR025610 - Transcription factor MYC/MYB N-terminal
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily
IPR043561 - Transcription factor LHW-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
K4PW38 Protein RICE SALT SENSITIVE 31.1e-0829.27Show/hide
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        AL + L+++C NS W Y+VFW              K+   N S+ L WEDG+C           + EC    + E+ V                    A 
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Query:  ADMFYLQYALGEGTVGSVASSGNHSWVFLE----NLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTE
        + M    Y  GEG +G VAS   H WVF E        ++   +S    P EW  Q+ASGI               QTI ++     G+LQLGS +++ E
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Query:  NLSMV
        +L  V
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P0C7P8 Transcription factor EMB14444.2e-6131.05Show/hide
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        L+Q+L+S+C+N+ W YAVFWK+ + +P +LT ED YC    + +  G M E                 ++H G      +G AVA M Y  ++LGEG VG
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Query:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------
         VA SG H W+F E L  S   +  ++ G   W  Q ++GIK               TIL+V V   GV+QLGSL  + E+ ++V +I+           
Subjt:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------

Query:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----
        D  S +   D N+ S            AS       DK +     ++V       S D P N T   F  E      G ++ V+P +   N  VT+    
Subjt:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----

Query:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE
                      D+  V           SR   P   H  + H     GT+     A   +S R    S     D   L  L       R NE  +F+
Subjt:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE

Query:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE
               S S  ++  +   H    K E    D    +  SF    ELLEALG   PA   T+    ELA   S++    T+ +  S    E   E+LL+
Subjt:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE

Query:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI
        A++    ++SN   N R  ISS    +S L+     Q+E          S V  V+  P L   +  ++     G    +S+  S++ + S+ ++    +
Subjt:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI

Query:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG
           K        ++R K   ++R RPRDRQLIQDRIKELR++VPNG+KCSI  LLE T+ HML+LQ V+  A+KL + A        S+ ++H+D+   G
Subjt:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG

Query:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ
         S      +WA +IG  LQVC I+VE+L+ +G MLI++LC++   FLEI+ ++R LEL IL+G  E+    +W  F+VE       HRMD+ W L+ + Q
Subjt:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ

Query:  RK
         K
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Q58G01 Transcription factor bHLH1553.1e-5628.3Show/hide
Query:  SALKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGT
        S  +++LKS C N+ W YAVFW++                     NH GS    RM+   E+    ++GTN+H        +G AVA M Y  Y+LGEG 
Subjt:  SALKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGT

Query:  VGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK---------
        VG VA SG H WVF EN    +    S +E    W  Q ++GIK               TIL+V V P GV+QLGSL  + E+++ V +I+         
Subjt:  VGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK---------

Query:  --DRVSAINSVDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRR--TRPETLHSEKG----
          D  + +   + N +          L A   P   G +D   +V       +      D  P  +  +  V  +    V  R   +  T  S  G    
Subjt:  --DRVSAINSVDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRR--TRPETLHSEKG----

Query:  ---------HKGELEGTTM--EEPFASLYQSIRDSEVEFSDLFC------------------LEPLLAPCSQLRNNETGLFEGNPHSYHSCSVDNVVGQ-
                 H+ ++ GT +  + P   +    +DS     +L                     E L+   S  R + T  F+    +    S  N V Q 
Subjt:  ---------HKGELEGTTM--EEPFASLYQSIRDSEVEFSDLFC------------------LEPLLAPCSQLRNNETGLFEGNPHSYHSCSVDNVVGQ-

Query:  --------------QFGHNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----
                        G N  S +      + ++F    ELLEALGSA    K TN    EL      S    T  +  S    +   E+LL+A++    
Subjt:  --------------QFGHNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----

Query:  -----TADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSARE--ENDCDITKHKNGMKSSN
               DD +S+ ++ + +++  +       K    +  ++ +   P   +  +   ++    + +S+  S++   S+ +  +   DI K KN      
Subjt:  -----TADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSARE--ENDCDITKHKNGMKSSN

Query:  FRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGS
         ++R K   ++R RPRDRQLIQDRIKELR++VPNG+KCSI  LLE+T+ HML+LQ VT  AEKL + A E         ++ +++   G+S   A ++G 
Subjt:  FRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGS

Query:  ELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQRKRN
         LQV  I+VE+L  +G +LI++LC++ G FLEI+ ++R L+L IL+G  E     +W  F+ E+       RMD+ W L+ + Q K N
Subjt:  ELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQRKRN

Q7XJU0 Transcription factor bHLH1571.3e-4127.61Show/hide
Query:  SALKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGT
        S  K +LKSLC +  W YAVFW+    N  IL +E+ Y                      E+ V                   A V DM      LG+G 
Subjt:  SALKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGT

Query:  VGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINSV
        VG VASSGNH W+F + LF          +   E+  Q+  G K ++     R   + QTI ++P+   GV+QLGS Q + E+  ++             
Subjt:  VGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINSV

Query:  DGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSC-MFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS
            T    +  + P  +  + + F SL D      C +F AE+            +F+      + P++     PE + SE     + + T  ++    
Subjt:  DGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSC-MFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS

Query:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFEGNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTNELAH
        + QS         DL+ L  L  P  Q                 +CS   + G                        D +L + LG     +  T  +A 
Subjt:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFEGNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTNELAH

Query:  DPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMITADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSN
         P    K   S L+ SS                    LSNNT ++ +++ V   SG++     + ++S+         +FP+ +             TS 
Subjt:  DPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMITADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSN

Query:  SLVVSAREENDCD---ITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGS
        SL +   E +         H+ G+K    ++R K   + R RP+DRQ+IQDRIKELR ++PNGAKCSI  LL+ T+ HM+++Q +   AE+LKQ      
Subjt:  SLVVSAREENDCD---ITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGS

Query:  NSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMD
           Y + L  E  +       WA ++G E  VCPI+VE+L  +G M I+++C++   FLEI Q++R L L ILKGV+E      WAHFIV+A     R+ 
Subjt:  NSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMD

Query:  VFWPLLHLLQ
        V + L+ L Q
Subjt:  VFWPLLHLLQ

Q9XIN0 Transcription factor LHW7.7e-5528.2Show/hide
Query:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG
        L++ L+S+C N+QW YAVFWKI  QN S+L WE                 EC    E   +     G  +   D+ G      + +   L      +GEG
Subjt:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG

Query:  TVGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINS
         VG  A +G+H W+ L N F  D+    +     E LLQ+++GI               QT+ + PV+P GV+QLGS   + ENL  V  +K  +  +  
Subjt:  TVGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINS

Query:  VDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS
        V G   S                                   EN+   +     +           VP VSR      +   +GHK       + E    
Subjt:  VDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS

Query:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETG-------------LFEGNPHSY----HSC--SVDNVVGQQFG-HNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCE
         + S   S+ +  +        +PC+ +  +E G                 NP ++     SC  +VD    QQ    ++ SK+  GS D F     D +
Subjt:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETG-------------LFEGNPHSY----HSC--SVDNVVGQQFG-HNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCE

Query:  LLEALGSALPAHKHTNELAHDPSS-SIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----TADDTLSNNTI-NARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDD
              S   +   T  L  + S   I         SS ++    +HLL+A++    ++   +S+ T  + + +   V  S ++       + S +    
Subjt:  LLEALGSALPAHKHTNELAHDPSS-SIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----TADDTLSNNTI-NARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDD

Query:  PALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVM
            + P S        Y + +S+      S + E    +       K +N R+R+K   N R RP+DRQ+IQDR+KELR+I+PNGAKCSI  LLE+T+ 
Subjt:  PALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVM

Query:  HMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVI
        HML+LQ V+  ++KLKQ              E +  + +G    WAF++GS+  VCPIVVED+       +++LC+  G FLEI+  +R L LTILKGVI
Subjt:  HMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVI

Query:  ERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQR
        E   +  WA F VEA R   RM++F  L+++L++
Subjt:  ERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.0e-6231.05Show/hide
Query:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGTVG
        L+Q+L+S+C+N+ W YAVFWK+ + +P +LT ED YC    + +  G M E                 ++H G      +G AVA M Y  ++LGEG VG
Subjt:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGTVG

Query:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------
         VA SG H W+F E L  S   +  ++ G   W  Q ++GIK               TIL+V V   GV+QLGSL  + E+ ++V +I+           
Subjt:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------

Query:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----
        D  S +   D N+ S            AS       DK +     ++V       S D P N T   F  E      G ++ V+P +   N  VT+    
Subjt:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----

Query:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE
                      D+  V           SR   P   H  + H     GT+     A   +S R    S     D   L  L       R NE  +F+
Subjt:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE

Query:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE
               S S  ++  +   H    K E    D    +  SF    ELLEALG   PA   T+    ELA   S++    T+ +  S    E   E+LL+
Subjt:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE

Query:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI
        A++    ++SN   N R  ISS    +S L+     Q+E          S V  V+  P L   +  ++     G    +S+  S++ + S+ ++    +
Subjt:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI

Query:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG
           K        ++R K   ++R RPRDRQLIQDRIKELR++VPNG+KCSI  LLE T+ HML+LQ V+  A+KL + A        S+ ++H+D+   G
Subjt:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG

Query:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ
         S      +WA +IG  LQVC I+VE+L+ +G MLI++LC++   FLEI+ ++R LEL IL+G  E+    +W  F+VE       HRMD+ W L+ + Q
Subjt:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ

Query:  RK
         K
Subjt:  RK

AT1G06150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.0e-6231.05Show/hide
Query:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGTVG
        L+Q+L+S+C+N+ W YAVFWK+ + +P +LT ED YC    + +  G M E                 ++H G      +G AVA M Y  ++LGEG VG
Subjt:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGTVG

Query:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------
         VA SG H W+F E L  S   +  ++ G   W  Q ++GIK               TIL+V V   GV+QLGSL  + E+ ++V +I+           
Subjt:  SVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK-----------

Query:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----
        D  S +   D N+ S            AS       DK +     ++V       S D P N T   F  E      G ++ V+P +   N  VT+    
Subjt:  DRVSAINSVDGNATS-----------VAS-------DKGVWPLCASVVPSPFG--SLDDPTNVTSCMFQAENH----GAIDDVKPLVSTFNQFVTN----

Query:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE
                      D+  V           SR   P   H  + H     GT+     A   +S R    S     D   L  L       R NE  +F+
Subjt:  -------------QDVPTV-----------SRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFASLYQSIR---DSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETGLFE

Query:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE
               S S  ++  +   H    K E    D    +  SF    ELLEALG   PA   T+    ELA   S++    T+ +  S    E   E+LL+
Subjt:  GNPHSYHSCSVDNVVGQQFGHNLVSKKEYGSAD----NFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLE

Query:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI
        A++    ++SN   N R  ISS    +S L+     Q+E          S V  V+  P L   +  ++     G    +S+  S++ + S+ ++    +
Subjt:  AMITADDTLSNNTINAR--ISSPVVGRSGLSAKICCQSES---------SAV--VVDDPAL--WIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDI

Query:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG
           K        ++R K   ++R RPRDRQLIQDRIKELR++VPNG+KCSI  LLE T+ HML+LQ V+  A+KL + A        S+ ++H+D+   G
Subjt:  TKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNG

Query:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ
         S      +WA +IG  LQVC I+VE+L+ +G MLI++LC++   FLEI+ ++R LEL IL+G  E+    +W  F+VE       HRMD+ W L+ + Q
Subjt:  AS-----WAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQ

Query:  RK
         K
Subjt:  RK

AT2G27230.1 transcription factor-related5.5e-5628.2Show/hide
Query:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG
        L++ L+S+C N+QW YAVFWKI  QN S+L WE                 EC    E   +     G  +   D+ G      + +   L      +GEG
Subjt:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG

Query:  TVGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINS
         VG  A +G+H W+ L N F  D+    +     E LLQ+++GI               QT+ + PV+P GV+QLGS   + ENL  V  +K  +  +  
Subjt:  TVGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINS

Query:  VDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS
        V G   S                                   EN+   +     +           VP VSR      +   +GHK       + E    
Subjt:  VDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRRTRPETLHSEKGHKGELEGTTMEEPFAS

Query:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETG-------------LFEGNPHSY----HSC--SVDNVVGQQFG-HNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCE
         + S   S+ +  +        +PC+ +  +E G                 NP ++     SC  +VD    QQ    ++ SK+  GS D F     D +
Subjt:  LYQSIRDSEVEFSDLFCLEPLLAPCSQLRNNETG-------------LFEGNPHSY----HSC--SVDNVVGQQFG-HNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCE

Query:  LLEALGSALPAHKHTNELAHDPSS-SIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----TADDTLSNNTI-NARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDD
              S   +   T  L  + S   I         SS ++    +HLL+A++    ++   +S+ T  + + +   V  S ++       + S +    
Subjt:  LLEALGSALPAHKHTNELAHDPSS-SIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----TADDTLSNNTI-NARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDD

Query:  PALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVM
            + P S        Y + +S+      S + E    +       K +N R+R+K   N R RP+DRQ+IQDR+KELR+I+PNGAKCSI  LLE+T+ 
Subjt:  PALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVM

Query:  HMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVI
        HML+LQ V+  ++KLKQ              E +  + +G    WAF++GS+  VCPIVVED+       +++LC+  G FLEI+  +R L LTILKGVI
Subjt:  HMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVI

Query:  ERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQR
        E   +  WA F VEA R   RM++F  L+++L++
Subjt:  ERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQR

AT2G27230.2 transcription factor-related5.5e-5628.2Show/hide
Query:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG
        L++ L+S+C N+QW YAVFWKI  QN S+L WE                 EC    E   +     G  +   D+ G      + +   L      +GEG
Subjt:  LKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQ---YALGEG

Query:  TVGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIKDRVSAINS
         VG  A +G+H W+ L N F  D+    +     E LLQ+++GI               QT+ + PV+P GV+QLGS   + ENL  V  +K  +  +  
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        V G   S                                   EN+   +     +           VP VSR      +   +GHK       + E    
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         + S   S+ +  +        +PC+ +  +E G                 NP ++     SC  +VD    QQ    ++ SK+  GS D F     D +
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Query:  LLEALGSALPAHKHTNELAHDPSS-SIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----TADDTLSNNTI-NARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDD
              S   +   T  L  + S   I         SS ++    +HLL+A++    ++   +S+ T  + + +   V  S ++       + S +    
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Query:  PALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVM
            + P S        Y + +S+      S + E    +       K +N R+R+K   N R RP+DRQ+IQDR+KELR+I+PNGAKCSI  LLE+T+ 
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Query:  HMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGSELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVI
        HML+LQ V+  ++KLKQ              E +  + +G    WAF++GS+  VCPIVVED+       +++LC+  G FLEI+  +R L LTILKGVI
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Query:  ERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQR
        E   +  WA F VEA R   RM++F  L+++L++
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AT2G31280.1 conserved peptide upstream open reading frame 72.2e-5728.3Show/hide
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        S  +++LKS C N+ W YAVFW++                     NH GS    RM+   E+    ++GTN+H        +G AVA M Y  Y+LGEG 
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Query:  VGSVASSGNHSWVFLENLFTSDLLSASIYEGPTEWLLQYASGIKDMLLLSTKRSNIHLQTILLVPVLPFGVLQLGSLQMLTENLSMVGYIK---------
        VG VA SG H WVF EN    +    S +E    W  Q ++GIK               TIL+V V P GV+QLGSL  + E+++ V +I+         
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Query:  --DRVSAINSVDGNATSVASDKGVWPLCASVVPSPFGSLDDPTNVTSCMFQAENHGAIDDVKPLVSTFNQFVTNQDVPTVSRR--TRPETLHSEKG----
          D  + +   + N +          L A   P   G +D   +V       +      D  P  +  +  V  +    V  R   +  T  S  G    
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Query:  ---------HKGELEGTTM--EEPFASLYQSIRDSEVEFSDLFC------------------LEPLLAPCSQLRNNETGLFEGNPHSYHSCSVDNVVGQ-
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Query:  --------------QFGHNLVSKKEYGSADNFFSFPDDCELLEALGSALPAHKHTN----ELAHDPSSSIKNTTSSLMCSSDFKEGDLEHLLEAMI----
                        G N  S +      + ++F    ELLEALGSA    K TN    EL      S    T  +  S    +   E+LL+A++    
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Query:  -----TADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSARE--ENDCDITKHKNGMKSSN
               DD +S+ ++ + +++  +       K    +  ++ +   P   +  +   ++    + +S+  S++   S+ +  +   DI K KN      
Subjt:  -----TADDTLSNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSARE--ENDCDITKHKNGMKSSN

Query:  FRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQDRIKELRQIVPNGAKCSIVGLLEKTVMHMLYLQRVTDQAEKLKQLAQEGSNSEYSTVLEHEDSQPNGASWAWAFDIGS
         ++R K   ++R RPRDRQLIQDRIKELR++VPNG+KCSI  LLE+T+ HML+LQ VT  AEKL + A E         ++ +++   G+S   A ++G 
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Query:  ELQVCPIVVEDLEYKGHMLIKILCDDMGLFLEISQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRG--FHRMDVFWPLLHLLQRKRN
         LQV  I+VE+L  +G +LI++LC++ G FLEI+ ++R L+L IL+G  E     +W  F+ E+       RMD+ W L+ + Q K N
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSALKQLLKSLCNNSQWIYAVFWKIKYQNPSILTWEDGYCNGSKLENHMGSMTECRMINEREEHVSSYYGTNIHNGDSGGCSVGAAVADMFYLQYALGEGTVGSVASS
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SNNTINARISSPVVGRSGLSAKICCQSESSAVVVDDPALWIFPESKVTETGRKYLTSLSTSNSLVVSAREENDCDITKHKNGMKSSNFRRRIKVTSNARQRPRDRQLIQD
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SQILRDLELTILKGVIERHSNNSWAHFIVEAPRGFHRMDVFWPLLHLLQRKRNPVSGRI