; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G004290 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G004290
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionF-box protein PP2-A15
Genome locationCmo_Chr06:2062258..2065786
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G004290
SyntenyCmoCh06G004290
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023540673.1 F-box protein PP2-A15 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-16798.62Show/hide
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A0A6J1L0D7 F-box protein PP2-A15 isoform X25.7e-16798.28Show/hide
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A0A6J1L396 F-box protein PP2-A15 isoform X18.0e-16998.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAN4 F-box protein PP2-A115.3e-7751.27Show/hide
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          SAK ++ITGIDDRRYW+ IP+++  F  VAY+QQIWWF+VDG + FPFPA  Y++ FRL LG+  KR G +    E  HGW +KPVRF++ST DGQ +
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        + +  L E            G W  Y  G+F+V KS  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGLCVDSV + PS  KD +
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Q9FJ80 F-box protein PP2-A141.5e-7146.94Show/hide
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        MGA+ S++  SE   G     GL D+PE+C+  +F+Y+ PPEIC LAR+N++F  A+ SDAVWE KLPSNY+ L+  +  ++ Q          KK+IYA
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Query:  LLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRR
         L RP  FD G K E WLD+ +G++ ++IS KAM ITGIDDRRYW  I ++E  F  + YL+QIWW E  G ++F F    Y+L F++ LG+  ++ GR+
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        TCS +  HGW +KPVRF++STSDGQ A  E  LDE            G W+ +  G+F+V+   S   ++FSM QIDCTH+KGGLC+D V I P
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Q9LEX0 F-box protein PP2-A134.8e-7854.14Show/hide
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        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FD G K E+W+D+ TGR+C+S
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        IS+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+E  F   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGW +KPVRF+++TSD QQA 
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            L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
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Q9LF92 F-box protein PP2-A152.3e-12571.92Show/hide
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        MG+SLSNL++ TNG  +GPGLGDIPESCVACVF+YLTPPEICNLA LNR+FRGAASSD+VWE KLP NYQDLLD LPPERY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
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          NK EVW+DR+TGR+CM+ISA+ M+ITGI+DRRYWNWIPTEE  F+VVAYLQQIWWFEVDG V+F  P  +Y+L+FR+HLGRF KRLGRR C FE THG
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        W +KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +  G  KRG WIEY+VGEF+V+ S  +TEI++SMKQIDCTHSKGGLCVDSVFI P   +K+H
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Q9LN77 F-box protein PP2-A127.9e-8151Show/hide
Query:  MGASLSNL-SEVTNGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALL
        MG + S+L +++++ S  G      PGLGD+PE+CVA +   L P EIC  ++LNRAFRGA+ +D VWESKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA L
Subjt:  MGASLSNL-SEVTNGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALL

Query:  SRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTC
        SR   FD   K +VW+D+ T  +C+SISAK ++ITGIDDRRYW+ IPT+E  F+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C
Subjt:  SRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTC

Query:  SFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV
        + E  HGW +KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+ +V +S  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGL +DSV + PS  KD +
Subjt:  SFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12710.1 phloem protein 2-A125.6e-8251Show/hide
Query:  MGASLSNL-SEVTNGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALL
        MG + S+L +++++ S  G      PGLGD+PE+CVA +   L P EIC  ++LNRAFRGA+ +D VWESKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA L
Subjt:  MGASLSNL-SEVTNGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALL

Query:  SRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTC
        SR   FD   K +VW+D+ T  +C+SISAK ++ITGIDDRRYW+ IPT+E  F+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C
Subjt:  SRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTC

Query:  SFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV
        + E  HGW +KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+ +V +S  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGL +DSV + PS  KD +
Subjt:  SFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV

AT1G63090.1 phloem protein 2-A113.8e-7851.27Show/hide
Query:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICM
        PGLGD+PESCVA +   L P EIC  ++LN AF GA+ +D VWESKLP +Y+ +L+ +      NL K+DI+  LSR   FD GNK + W+D+ TG +C+
Subjt:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICM

Query:  SISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQA
          SAK ++ITGIDDRRYW+ IP+++  F  VAY+QQIWWF+VDG + FPFPA  Y++ FRL LG+  KR G +    E  HGW +KPVRF++ST DGQ +
Subjt:  SISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQA

Query:  THEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKS-GSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV
        + +  L E            G W  Y  G+F+V KS  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGLCVDSV + PS  KD +
Subjt:  THEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKS-GSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV

AT3G53000.1 phloem protein 2-A151.7e-12671.92Show/hide
Query:  MGASLSNLSEVTNGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFD
        MG+SLSNL++ TNG  +GPGLGDIPESCVACVF+YLTPPEICNLA LNR+FRGAASSD+VWE KLP NYQDLLD LPPERY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
Subjt:  MGASLSNLSEVTNGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFD

Query:  GGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHG
          NK EVW+DR+TGR+CM+ISA+ M+ITGI+DRRYWNWIPTEE  F+VVAYLQQIWWFEVDG V+F  P  +Y+L+FR+HLGRF KRLGRR C FE THG
Subjt:  GGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHG

Query:  WGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP-SILKDH
        W +KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +  G  KRG WIEY+VGEF+V+ S  +TEI++SMKQIDCTHSKGGLCVDSVFI P   +K+H
Subjt:  WGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP-SILKDH

AT3G61060.1 phloem protein 2-A133.4e-7954.14Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMS
        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FD G K E+W+D+ TGR+C+S
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMS

Query:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQAT
        IS+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+E  F   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGW +KPVRF+++TSD QQA 
Subjt:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQAT

Query:  HEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
            L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
Subjt:  HEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP

AT3G61060.2 phloem protein 2-A132.4e-8054.14Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMS
        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FD G K E+W+D+ TGR+C+S
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMS

Query:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQAT
        IS+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+E  F   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGW +KPVRF+++TSD QQA 
Subjt:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEE--FNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHGWGVKPVRFEMSTSDGQQAT

Query:  HEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
            L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
Subjt:  HEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCTCCAAATTCTTCGATTCGAAACTGCTGAATTTTGAGGTTTTGATTTCGGAATCGGCGGCGATGGGAGCTTCGCTCTCGAACTTGAGTGAAGTGACCAATGGCTC
CACCATCGGTCCTGGCCTCGGCGACATACCGGAGAGTTGTGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTTACTCCGCCGGAGATTTGTAACCTCGCTCGGCTAAACAGGGCGTTTC
GCGGCGCCGCTTCATCGGATGCCGTTTGGGAATCGAAATTGCCCTCGAATTATCAAGATCTTCTCGATTTTTTGCCCCCCGAACGGTACCAAAATCTGTCCAAAAAGGAT
ATCTATGCTCTGCTATCTCGTCCAGTTCCATTCGATGGTGGAAATAAGGTGGAGGTGTGGCTGGATAGAATCACTGGAAGGATTTGCATGTCGATATCAGCTAAGGCCAT
GGCTATTACTGGAATTGATGACAGAAGATACTGGAATTGGATTCCCACTGAAGAGTTCAATGTTGTGGCATATCTGCAGCAAATTTGGTGGTTTGAAGTAGATGGGATGG
TAAAATTCCCATTTCCTGCTGATATCTATACACTGACCTTCAGACTTCACCTTGGAAGGTTCTATAAGCGGCTCGGTCGACGTACATGCAGCTTCGAGCATACTCACGGT
TGGGGCGTAAAGCCAGTACGGTTTGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCAACGCATGAATTCTGTTTAGACGAGCACGGGTTTATTGATGTAAGTGGACACCGTAA
GCGTGGGTGTTGGATAGAATACAAGGTAGGCGAATTTTTGGTCGACAAGTCGGGATCAGCCACGGAAATAAGATTTTCCATGAAACAGATTGACTGCACTCATTCGAAAG
GCGGGCTTTGTGTAGATTCTGTATTTATCGTTCCGAGTATCTTGAAAGATCATGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCAAAAAAAGTAGAATAAGAAAAGGTGTCTCCTTCGGCGTTACGTCATAGAACTTGATAACCCATTAACGAGGCGAGAGATCTCAAAGCCCGTCCTCCACGATCCGTA
GTTAGTGTCGCAGTGGGGCTTCCAAGTTCTCCAATGGCTGAAACCAAAAGGGAAAAGGAAATAAACAAAACTCATCCCAACGCTGTAAATTTCAACCGCCCACCACTCCT
CTCCTTCCACGACCATTTCCCTGCCCTGTTCTGAATTTCTCACGGCCCATTTCCGTGCCCACTTGTCGCACCGAACCCATCTGCGTGAGCCCTTGGATGAGCTCCAAATT
CTTCGATTCGAAACTGCTGAATTTTGAGGTTTTGATTTCGGAATCGGCGGCGATGGGAGCTTCGCTCTCGAACTTGAGTGAAGTGACCAATGGCTCCACCATCGGTCCTG
GCCTCGGCGACATACCGGAGAGTTGTGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTTACTCCGCCGGAGATTTGTAACCTCGCTCGGCTAAACAGGGCGTTTCGCGGCGCCGCTTCA
TCGGATGCCGTTTGGGAATCGAAATTGCCCTCGAATTATCAAGATCTTCTCGATTTTTTGCCCCCCGAACGGTACCAAAATCTGTCCAAAAAGGATATCTATGCTCTGCT
ATCTCGTCCAGTTCCATTCGATGGTGGAAATAAGGTGGAGGTGTGGCTGGATAGAATCACTGGAAGGATTTGCATGTCGATATCAGCTAAGGCCATGGCTATTACTGGAA
TTGATGACAGAAGATACTGGAATTGGATTCCCACTGAAGAGTTCAATGTTGTGGCATATCTGCAGCAAATTTGGTGGTTTGAAGTAGATGGGATGGTAAAATTCCCATTT
CCTGCTGATATCTATACACTGACCTTCAGACTTCACCTTGGAAGGTTCTATAAGCGGCTCGGTCGACGTACATGCAGCTTCGAGCATACTCACGGTTGGGGCGTAAAGCC
AGTACGGTTTGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCAACGCATGAATTCTGTTTAGACGAGCACGGGTTTATTGATGTAAGTGGACACCGTAAGCGTGGGTGTTGGA
TAGAATACAAGGTAGGCGAATTTTTGGTCGACAAGTCGGGATCAGCCACGGAAATAAGATTTTCCATGAAACAGATTGACTGCACTCATTCGAAAGGCGGGCTTTGTGTA
GATTCTGTATTTATCGTTCCGAGTATCTTGAAAGATCATGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKFFDSKLLNFEVLISESAAMGASLSNLSEVTNGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDAVWESKLPSNYQDLLDFLPPERYQNLSKKD
IYALLSRPVPFDGGNKVEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEEFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRTCSFEHTHG
WGVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHGFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKDHV