; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G004440 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G004440
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationCmo_Chr06:2130684..2133142
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G004440
SyntenyCmoCh06G004440
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596544.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-17197.83Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVF+T
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

KAG7028079.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.4e-17298.14Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

XP_022945126.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]3.8e-176100Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

XP_023005644.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]5.7e-17298.44Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDS
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDS
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDS

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-17298.45Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog6.3e-16190.37Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML++RTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTE+YHLKKESAVKYSR+N+GIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVIARTY+ HIYD+VEVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD FRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+V+RRHRLP+DGLRKEAMKTAKD+AKKKEKNVS+D I GKIGRIYIPDQKVGD+A+ DKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RD+GPASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog1.9e-16592.86Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        +D+GPASKK KEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-176100Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog7.2e-16592.55Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+A+PDKSKGVKRER EAKMK+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE
        +D+GPASKK KEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog2.7e-17298.44Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIARTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDS
        RD+ PASKK KEDSEKPKEDS
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSEKPKEDS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog4.1e-5642.12Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K+   E K ++ +
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD

Query:  NGPASKKQKED
        N   SK+ K++
Subjt:  NGPASKKQKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog2.8e-12169.23Show/hide
Query:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        +R P++ + KREL K APKLVETGKKTLILHGTKTS VLN VL +++HLK+++AVKYS++N+ I+PFE+GG++SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+ RTYDHHIYDLVEVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKHLKEVLLD+F+GEVVEN+NLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRDN
        LR+K+SG+ +PR+ELVEVGPSMDLVVRRHR P + L+KEAMKTA D AKK  KNV++D +HGK+G++YIPDQ++  ++L +  KG+KRER EAK KN+D+
Subjt:  LRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRDN

Query:  GPASKKQKEDSE
           SKKQK + E
Subjt:  GPASKKQKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog2.6e-5542.44Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D++E+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K+    A+    D
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD

Query:  NGPASKKQKED
        +   SK+ K++
Subjt:  NGPASKKQKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog6.3e-5743.09Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        KV  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y ++N   +PFE+   +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVI R YD+H+ D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD
         L +KKSG   PR+EL E+GPS+DLV+RR  L SD L K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K+   E  +   D
Subjt:  ALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRD

Query:  NGPASKKQKED
         G  SK+ K++
Subjt:  NGPASKKQKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog4.0e-12871.43Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSRRNE I+PFE+GG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+ R YDH +YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL D+FRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCAL++KKSGS+VPRMELVEVGPSMDLV+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ ++ L DKSKG KRER +AK+K+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSE
        ++    +KK K  SE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein2.8e-12971.43Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSRRNE I+PFE+GG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+ R YDH +YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL D+FRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIARTYDHHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN
        HCAL++KKSGS+VPRMELVEVGPSMDLV+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ ++ L DKSKG KRER +AK+K+
Subjt:  HCALRMKKSGSVVPRMELVEVGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKN

Query:  RDNGPASKKQKEDSE
        ++    +KK K  SE
Subjt:  RDNGPASKKQKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAAGTTAGAACTCCCAAGAATGGTAAAGTTAAACGAGAGCTTGAGAAACGTGCTCCCAAACTTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACTAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTAGGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAATGGCG
GCGATTCATCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCGATAATCTTGTAATAGCGAGAACCTATGAT
CATCACATCTATGATCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTTTCTCCACGGGTCGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTGAAGCATTTAAAAGAAGTTTTGCTTGATATGTTCCGTGGAGAGGTTGTGGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCACTGCGAATGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCTAGAATGGAACTAGTTGAA
GTCGGTCCTTCAATGGATTTGGTGGTTCGCCGGCACCGGCTGCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
TGTGAGTCAGGATGCAATTCATGGCAAGATTGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATGTGGCTCTACCCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAT
GCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGATAACGGGCCAGCCTCTAAAAAACAAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACCCTAACGTTCAGGACGACCACCTCAAAAAGTTCACCAAAATCGGCGTCAGCTTGCAGTCGCCGGAACGGTCGATATTTCTCTGCTAGTTGAGCAACAAAACCCTAA
ATCTCATCTCTGTTATCTCACTGGCCGTGGACCATGTTGAAAGTTAGAACTCCCAAGAATGGTAAAGTTAAACGAGAGCTTGAGAAACGTGCTCCCAAACTTGTTGAGAC
GGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACTAAAACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTA
GGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAATGGCGGCGATTCATCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGA
CCCGATAATCTTGTAATAGCGAGAACCTATGATCATCACATCTATGATCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACT
TTCTCCACGGGTCGGGTCAAAGCCTTTCATTACTTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTGAAGCATTTAAAAGAAGTTTTGCTTGATATGTTCCGTGGAG
AGGTTGTGGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGGACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCACTGCGAATGAAGAAGTCA
GGTTCAGTAGTTCCTAGAATGGAACTAGTTGAAGTCGGTCCTTCAATGGATTTGGTGGTTCGCCGGCACCGGCTGCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAAC
AGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAATGTGAGTCAGGATGCAATTCATGGCAAGATTGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATGTGGCTCTAC
CCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGATGCGAAGCGAAAATGAAAAACAGAGATAACGGGCCAGCCTCTAAAAAACAAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAA
GATTCAGAATAGTTCAACTAGTCTAATACTGTTCGACCCAATTCTCTTCTTACTAGAGTCGCTGTTATGAAATGCATAGTAGCTTGCCAATTATGTGGACAGAGCAGACA
CTATTTATTTGCGTGTATACAATTTTGCCTATGGTTTCCAATTTGATTTTACATGCAAACCTGCCTTTTATCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRRNEGIKPFENGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIARTYD
HHIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDMFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRMKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDLVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIHGKIGRIYIPDQKVGDVALPDKSKGVKRERCEAKMKNRDNGPASKKQKEDSEKPKEDSE