; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G005000 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G005000
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionB3 domain-containing protein At5g06250-like
Genome locationCmo_Chr06:2406026..2407883
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G005000
SyntenyCmoCh06G005000
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596592.1 B3 domain-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-14099.18Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHH KHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY

Query:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
        VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
Subjt:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS

Query:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        KILRLFGVDLECQTD+SEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
Subjt:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

XP_022938099.1 B3 domain-containing protein At5g06250-like [Cucurbita moschata]1.8e-141100Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY

Query:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
        VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
Subjt:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS

Query:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
Subjt:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

XP_023005128.1 B3 domain-containing protein At5g06250-like [Cucurbita maxima]3.2e-13597.13Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY

Query:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
        VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHH   HNHLPSPPYQS DCP AESSVQSQTVSVGNS
Subjt:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS

Query:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        KI+RLFGVDLECQTDVSEPEQPST+GGGSGLSGQDPTRHSFYTH
Subjt:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

XP_023539022.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-13597.55Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLI-HHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQS
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLI HHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLI-HHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQS

Query:  YVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGN
        YVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATR+FCSSNPYPS  HHHNHNHLPSPPYQS DCPHAESSVQSQTVSVGN
Subjt:  YVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGN

Query:  SKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        SKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPT HSFYTH
Subjt:  SKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

XP_038905859.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.0e-9374.1Show/hide
Query:  SSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP--------GGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTR
        ++A+A DH         PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP         GD+ADKGLLLSFEDESGK+WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+R
Subjt:  SSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP--------GGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTR

Query:  FVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTV
        FVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWK+RS  S A+TA A            T++FCS+NPY S HHHH H+H PSPPYQ S D PHAESSVQSQT+
Subjt:  FVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTV

Query:  SVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH
        SVGNSKILRLFGVDLECQTD+SEPE PSTL  GS   LS +DPTRH+FYTH
Subjt:  SVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X11.1e-9368.9Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCH-----------LHHPKSSAS---AVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP----------GGDTADKGLL
        MS+N+FS D H           + +PKSS S     DH         PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP           GD+ADKGLL
Subjt:  MSLNHFSSDCH-----------LHHPKSSAS---AVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP----------GGDTADKGLL

Query:  LSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSH
        LSFEDESGK+WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRS  S A++A A            TR+FCS+N YPS 
Subjt:  LSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSH

Query:  HHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH
          HH H HLPSPPYQ S D PHAESSVQSQTVS+GNSKILRLFGVDLECQTD+SEPE PS L  GS   LSG+DPTRH+FY H
Subjt:  HHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH

A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X21.1e-9368.9Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCH-----------LHHPKSSAS---AVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP----------GGDTADKGLL
        MS+N+FS D H           + +PKSS S     DH         PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP           GD+ADKGLL
Subjt:  MSLNHFSSDCH-----------LHHPKSSAS---AVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSP----------GGDTADKGLL

Query:  LSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSH
        LSFEDESGK+WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRS  S A++A A            TR+FCS+N YPS 
Subjt:  LSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA------------TRIFCSSNPYPSH

Query:  HHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH
          HH H HLPSPPYQ S D PHAESSVQSQTVS+GNSKILRLFGVDLECQTD+SEPE PS L  GS   LSG+DPTRH+FY H
Subjt:  HHHHNHNHLPSPPYQ-SYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS--GLSGQDPTRHSFYTH

A0A6J1FHX6 B3 domain-containing protein At5g06250-like8.5e-142100Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY

Query:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
        VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
Subjt:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS

Query:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
Subjt:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like1.2e-9067.88Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCH-------------LHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGD--------TADKGLLLSF
        MS+NHFS D H              ++PKSS S         + K PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAE+YFPLSP           +ADK LLL+F
Subjt:  MSLNHFSSDCH-------------LHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGD--------TADKGLLLSF

Query:  EDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA---------TRIFCSSNPYPSHHHHHNH
        EDESGK+WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVKEKRLDAGD VVFERHR DGDRLFIGWKRRS  S AETA A         TR+F S+NPYPSHH     
Subjt:  EDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA---------TRIFCSSNPYPSHHHHHNH

Query:  NHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
         HLPSPPYQS      ESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTD+SEPE PST+GG S +SG+DPTRH FY+H
Subjt:  NHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

A0A6J1L1C4 B3 domain-containing protein At5g06250-like1.6e-13597.13Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
        MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSY

Query:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS
        VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHH   HNHLPSPPYQS DCP AESSVQSQTVSVGNS
Subjt:  VLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNS

Query:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        KI+RLFGVDLECQTDVSEPEQPST+GGGSGLSGQDPTRHSFYTH
Subjt:  KILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560002.8e-4950.59Show/hide
Query:  MSLNH--FSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQ
        M++NH  FS +     P   A   + H  HH+ K  MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL   GD ADKGL+LSFEDE+G  WRFRYSYW SSQ
Subjt:  MSLNH--FSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQ

Query:  SYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRD---GDRLFIGWKRRSPVSTAETAA---ATRIFCSS------NPY-PSHHHHHNHNHLPSPPYQSY----
        SYVLTKGW+R+VKEKRLDAGDVV FER R     GDRLFIG +RR   + A+T A   A R+  ++       P+ P  +        P+ P  SY    
Subjt:  SYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRD---GDRLFIGWKRRSPVSTAETAA---ATRIFCSS------NPY-PSHHHHHNHNHLPSPPYQSY----

Query:  -------DCPHAESS---VQSQTVSVGN--SKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPST
               D  HA+ S     S + S G+  S+ LRLFGV+L+C     EPE  +T
Subjt:  -------DCPHAESS---VQSQTVSVGN--SKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPST

Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360802.1e-5254.08Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS
        MS+N +SSD H H    +       H       K  +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   D  +KGLLL FEDE GK WRFRYSYWNSS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS

Query:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS
        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                SS+   S+ H  ++  L     Q Y  PHA   +V+SQ   
Subjt:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS

Query:  VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS
         GNSK LRLFGV++ECQ D S+  +PST  G +
Subjt:  VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS

Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115802.1e-4949.58Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY
        MS+NH+ +   LHH   +  A+         +  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        G D  T +KG+LLSFEDESGK W+FRY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY

Query:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SYWNSSQSYVLTKGW+R+VK+K LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++        E    T  + S  + PY   H    + ++    Y  Y
Subjt:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY

Query:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEP
             HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP
Subjt:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEP

Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062503.8e-5447.81Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE

Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H  ++  +PP    
Subjt:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----

Query:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        Y  Y    A ++    T S   VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
Subjt:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

Q9M268 B3 domain-containing transcription factor NGA28.2e-4146.19Show/hide
Query:  MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRL
        MF+K +TPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   + ++KGLLL+FED SG  WRFRYSYWNSSQSYV+TKGW+RFVK+K+LDAGD+V F+R   + D+L
Subjt:  MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRL

Query:  FIGWKRRSPV-----STAETAAATRIFCSSNP-YPSHHHHHNHNH------LPSPPY-QSYDCPHAESSVQS---------QTVSVGN--SKILRLFGVD
        +I W+RR  +          A   R +   +P  P+++  HN  H      L    Y +S +  H  + ++S         Q  S+ +   K LRLFGVD
Subjt:  FIGWKRRSPV-----STAETAAATRIFCSSNP-YPSHHHHHNHNH------LPSPPY-QSYDCPHAESSVQS---------QTVSVGN--SKILRLFGVD

Query:  LEC---QTDVSEPEQPSTLGGGS
        +EC      V+  E+ S+  GGS
Subjt:  LEC---QTDVSEPEQPSTLGGGS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.5e-5354.08Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS
        MS+N +SSD H H    +       H       K  +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   D  +KGLLL FEDE GK WRFRYSYWNSS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS

Query:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS
        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                SS+   S+ H  ++  L     Q Y  PHA   +V+SQ   
Subjt:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHA-ESSVQSQTVS

Query:  VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS
         GNSK LRLFGV++ECQ D S+  +PST  G +
Subjt:  VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQPSTLGGGS

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein4.1e-4863.76Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS
        MS+N +SSD H H    +       H       K  +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL +   D  +KGLLL FEDE GK WRFRYSYWNSS
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHP--KSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL-SPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSS

Query:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA
        QSYVLTKGW+R+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S++
Subjt:  QSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.5e-5049.58Show/hide
Query:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY
        MS+NH+ +   LHH   +  A+         +  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+        G D  T +KG+LLSFEDESGK W+FRY
Subjt:  MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLS-------PGGD--TADKGLLLSFEDESGKMWRFRY

Query:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SYWNSSQSYVLTKGW+R+VK+K LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++        E    T  + S  + PY   H    + ++    Y  Y
Subjt:  SYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTA--------ETAAATRIFCS--SNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY

Query:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEP
             HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP
Subjt:  DC--PHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEP

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.9e-5347.94Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE

Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H      +   +++
Subjt:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSY

Query:  DCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
          P   SSV      VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
Subjt:  DCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein2.7e-5547.81Show/hide
Query:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S+D           H H   +S +      +H   K  +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL      S   DT  ++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSLNHFSSD----------CHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPL------SPGGDT--ADKGLLLSFEDE

Query:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGW+RFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S++  AA  + +  SS    S+H  H  ++  +PP    
Subjt:  SGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAA-TRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPP----

Query:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH
        Y  Y    A ++    T S   VG+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +      +T+    G  GQ+   + +Y+H
Subjt:  YQSYDCPHAESSVQSQTVS---VGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPEQ----PSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTTAAACCACTTCTCTTCAGACTGCCATCTCCACCACCCCAAATCCTCCGCCTCCGCCGTCGACCACCACCTCATCCACCACCACCACAAGCACCCCATGTTCGA
AAAGCCCTTGACTCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGCCTCGTCATCCCCAAGCAATATGCTGAAAAATATTTCCCACTTTCCCCCGGCGGCGACACGGCGGACAAGG
GCTTGCTTCTTAGCTTCGAAGATGAGTCCGGTAAGATGTGGCGCTTCCGTTACTCGTATTGGAATAGTAGCCAGAGCTATGTGCTCACTAAAGGGTGGACCCGCTTTGTC
AAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTCTTTGAACGCCACCGCCGTGATGGGGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAGCGGCGCTCGCCAGTGTCCACGGCGGA
GACGGCGGCGGCGACTAGAATCTTCTGTTCTTCAAACCCATATCCTTCTCATCATCATCATCATAATCATAATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTATGATTGTC
CTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGTCTGTTCGGGGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACGTGTCGGAACCCGAA
CAGCCCTCGACGCTCGGTGGCGGATCGGGTCTATCGGGTCAAGATCCAACCCGTCACAGCTTCTACACACACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTCCAAAATGTCCTTAAACCACTTCTCTTCAGACTGCCATCTCCACCACCCCAAATCCTCCGCCTCCGCCGTCGACCACCACCTCATCCACCACCACCACAAGCACCCC
ATGTTCGAAAAGCCCTTGACTCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGCCTCGTCATCCCCAAGCAATATGCTGAAAAATATTTCCCACTTTCCCCCGGCGGCGACACGGC
GGACAAGGGCTTGCTTCTTAGCTTCGAAGATGAGTCCGGTAAGATGTGGCGCTTCCGTTACTCGTATTGGAATAGTAGCCAGAGCTATGTGCTCACTAAAGGGTGGACCC
GCTTTGTCAAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTCTTTGAACGCCACCGCCGTGATGGGGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAGCGGCGCTCGCCAGTGTCC
ACGGCGGAGACGGCGGCGGCGACTAGAATCTTCTGTTCTTCAAACCCATATCCTTCTCATCATCATCATCATAATCATAATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTA
TGATTGTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGTCTGTTCGGGGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACGTGTCGG
AACCCGAACAGCCCTCGACGCTCGGTGGCGGATCGGGTCTATCGGGTCAAGATCCAACCCGTCACAGCTTCTACACACACTGACACTACGCTCCTTCTCTTCCTCATCAC
ATGAATTCCACTTTCCCACAAGATGTGAAGCAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLNHFSSDCHLHHPKSSASAVDHHLIHHHHKHPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPGGDTADKGLLLSFEDESGKMWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWTRFV
KEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSPVSTAETAAATRIFCSSNPYPSHHHHHNHNHLPSPPYQSYDCPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDVSEPE
QPSTLGGGSGLSGQDPTRHSFYTH