; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G008300 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G008300
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationCmo_Chr06:4536595..4541107
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G008300
SyntenyCmoCh06G008300
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
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GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
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InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030156.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-10899.5Show/hide
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A0A6J1DMM8 GTP-binding protein YPTM2-like2.3e-10899.5Show/hide
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A0A6J1G9D5 GTP-binding protein YPTM2-like7.9e-109100Show/hide
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A0A6J1KZK2 GTP-binding protein YPTM27.9e-109100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a4.6e-9887.19Show/hide
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AT1G02130.1 RAS 53.3e-9987.19Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E4.0e-6559.9Show/hide
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein2.8e-8273.27Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C6.6e-10088.61Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.7e-10089.11Show/hide
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        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVK
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        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVNQ+SGCC
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        SS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATTAGCACCATCGGGGTTGACTTCAAAATCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAGCGTTTTAGAACAATAA
CCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTCTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTCAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCA
AGCGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAATAAGTCTGACCTTACGGCAAACAAAGTTGTGTCCCATGAGACAGCGAAGGCATTCGCGGATGAAATTGGGATTCCCTT
TATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCACGGCCGC
CAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCGTCTTAA
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GAAACTCGCCGGGAAAATTCACGCCTCTCCAGTACTGTGGTGAATTCTCTCTGATTCCGTCGATCTCCGCTGCTCATCGCCATGACTCCTGAATATGATTATTTGTTTAA
GCTCTTGCTTATTGGTGACTCTGGTGTTGGAAAATCTTGTCTTCTTCTGAGGTTTGCAGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCACCATCGGGGTTGACTTCAAAA
TCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAGCGTTTTAGAACAATAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGC
ATTATTGTTGTCTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTCAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCAAGCGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGG
CAATAAGTCTGACCTTACGGCAAACAAAGTTGTGTCCCATGAGACAGCGAAGGCATTCGCGGATGAAATTGGGATTCCCTTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGA
ACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCACGGCCGCCAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTG
AACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCGTCTTAAAAGAAAAAAGAGGAGAGATCTCTCTATGATTAGCACTGTAACCGTATGGTTGGTTGGTCACGACGCGCATGTAAAACTCT
TTGGATTAGCTTTTCTTCTAAAGCTTTGTTTTGTTTTCTTCTCTCCACTATTTACTTTCTTGATCAGCACTTTGTTTAAAATTCCCATTCTTTTCAATGTATTTGATTAT
CATAACCCAAAAGAAAAAGAACAAAAAAAAAAAGAAACCATCTGTACAAATTAGAAAAACATTATTGGTGAATGGCACTATTTTCCCTCTTATCTTTCCCATTCCTTAAT
GCCTCTTGGTGGAATTCATCAGGATCCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS