; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G009330 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G009330
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein SRC1-like
Genome locationCmo_Chr06:6862599..6862895
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G009330
SyntenyCmoCh06G009330
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596975.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-4097Show/hide
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XP_022942109.1 protein SRC1-like [Cucurbita moschata]4.9e-42100Show/hide
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XP_022973362.1 protein SRC1-like [Cucurbita maxima]1.6e-3794.06Show/hide
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XP_022974702.1 protein SRC1-like [Cucurbita maxima]7.3e-3895.05Show/hide
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XP_023538905.1 protein SRC1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-3891.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B8E4 protein SRC15.1e-2171.84Show/hide
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A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP65.1e-2171.84Show/hide
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A0A6J1FQD3 protein SRC1-like2.4e-42100Show/hide
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A0A6J1I7B7 protein SRC1-like7.8e-3894.06Show/hide
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A0A6J1IAZ2 protein SRC1-like3.5e-3895.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC17.4e-1765.05Show/hide
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Q9SLJ2 Dehydrin HIRD119.3e-1256.07Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein6.6e-1356.07Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGGGATCATGGAGAAAATAGGCGAGAAGCTCCACATCGGAGGAGACCACAAGGGGGAGCACAAGGGCGAGCACCACGAGAAGGACAAGCACGAGCACGAGAAGAA
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AGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGGCGAGCACCACGAGGGCGGCCACAGCAGCAGCAGCGACAGCGACAGCGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGGGATCATGGAGAAAATAGGCGAGAAGCTCCACATCGGAGGAGACCACAAGGGGGAGCACAAGGGCGAGCACCACGAGAAGGACAAGCACGAGCACGAGAAGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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