; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G009740 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G009740
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNTP_transf_2 domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr06:7660443..7678838
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G009740
SyntenyCmoCh06G009740
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016779 - nucleotidyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002934 - Polymerase, nucleotidyl transferase domain
IPR007110 - Immunoglobulin-like domain
IPR043519 - Nucleotidyltransferase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6597016.1 Terminal nucleotidyltransferase 4B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]0.0e+0099.47Show/hide
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        ILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSIDLS
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A0A6J1ICP4 uncharacterized protein LOC1114744420.0e+0094.89Show/hide
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        MFISLDCTKLELLGEGNSKSLPSKSTENLGASRRRKKGK RKSQNPVPK C+GDLSCNKFHKPQD DKECAHKGREDMMEST PILSKGNDTCREMSA+ 
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           VHDHIMSVGKNQG TRKKKKHKSKNSGGNNRLVEIIPSEGPTAKFSSPSFSSQDQVAELD+ FRKPFISNIKNDSSNNYDSLTSNSSPIVPSSEPNR
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        EYNSNQNVEVHEISG TESVCHVGPGESQFPKGIIENQCVSSTLVPSH PSLELKNIVKSDVNVNGSV+SCELREKSSLLDKLPRTFDIQEKSCLSRDQF
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        SGDICNTRTLNSSFNSHLPPATDRLHLDAGHNWHNHFRRSFTPAMHQPRSSSVKGGCNPILTRPLLMSLDWPPVLRSASGLASTMTSNHDFGFLPRRQST
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        FRQGFPTN NQISTEDEKYSGNLTDFPDLSNNQDLADECDGNWISEEELEMHAVSGLDYNQYFGGGVMYWNPSDHHGTGFSRPPSLSSDDSSWAW EADM
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        NRTVDDMVAFSSSYSNGL SPTATSFCSPFDPLGSGKQALGYVVQGPDLPTNMLHSSLTMNDSVTEEDAPRSLANLPSDVEGKTGDSHPFPMLPPIVIPN
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        MSRERSRSEFCHGFDHKSPCIPPTRREQSRVKRPPSPVVLCVPRAPIPPPPSPVSDSRKHRGFPTVRSGSSSPRHWGVKGWYPDGTNLEEACLHIDGAEV
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        VWPNWRNKSNSNCSTVQPLSLIAM QIALDQEHPDVAFPLFPPTTSCPVKKESLSLMHS LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPR
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        SRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQ
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        SSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLV  +            V K  +A            
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             VLLIVRFLQHEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRERGYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYS
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        ILESELISLNDNGDSSSDAT+SVLQKIIPSIDLS
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A0A6J1IFP5 uncharacterized protein LOC1114728920.0e+0098.06Show/hide
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        MFISLDCTKLELLGEGNSKSLPSKSTENLGASRRRKKGK RKSQNPVPK C+GDLSCNKFHKPQD DKECAHKGREDMMEST PILSKGNDTCREMSA+ 
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           VHDHIMSVGKNQG TRKKKKHKSKNSGGNNRLVEIIPSEGPTAKFSSPSFSSQDQVAELD+ FRKPFISNIKNDSSNNYDSLTSNSSPIVPSSEPNR
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        EYNSNQNVEVHEISG TESVCHVGPGESQFPKGIIENQCVSSTLVPSH PSLELKNIVKSDVNVNGSV+SCELREKSSLLDKLPRTFDIQEKSCLSRDQF
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        SGDICNTRTLNSSFNSHLPPATDRLHLDAGHNWHNHFRRSFTPAMHQPRSSSVKGGCNPILTRPLLMSLDWPPVLRSASGLASTMTSNHDFGFLPRRQST
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        FRQGFPTN NQISTEDEKYSGNLTDFPDLSNNQDLADECDGNWISEEELEMHAVSGLDYNQYFGGGVMYWNPSDHHGTGFSRPPSLSSDDSSWAW EADM
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        NRTVDDMVAFSSSYSNGL SPTATSFCSPFDPLGSGKQALGYVVQGPDLPTNMLHSSLTMNDSVTEEDAPRSLANLPSDVEGKTGDSHPFPMLPPIVIPN
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        MSRERSRSEFCHGFDHKSPCIPPTRREQSRVKRPPSPVVLCVPRAPIPPPPSPVSDSRKHRGFPTVRSGSSSPRHWGVKGWYPDGTNLEEACLHIDGAEV
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        VWPNWRNKSNSNCSTVQPLSLIAMSQIALDQEHPDVAFPLFPPTTSCPVKKESLSLMHS LNDEINSFCK VAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPR
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        SRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQ
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Query:  SSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGL
        SSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGL
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        SSYCLVLLIVRFLQHEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRERGYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYS
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        ILESELISLNDNGDSSSDAT+SVLQKIIPSIDLS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5XG87 Terminal nucleotidyltransferase 4A1.5e-2527.58Show/hide
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        VKR+   ++ LWP +   IFGS +TGL LPTSD+DLVV      PP++ LE          ++ + E C                 S+K ++   +PII 
Subjt:  VKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIM

Query:  LVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALV
        L                                                        +     V++DISF     TG++ +  +K   +++     L LV
Subjt:  LVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALV

Query:  LKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRER-------GYSIDPLHIDDP
        LK FL  R L++ ++GG+SSY L+L+ + FLQ H    +R  ++N G LL++F   +G  F+  +  I I+  G YI +E        GY    L I+DP
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Query:  LFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISL-----NDNGDSSSDATSSVLQKII
        L P N+VGR+ +   Q  + F  AY +L   +  L     N + +S+      V Q++I
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Q68ED3 Terminal nucleotidyltransferase 4B4.1e-2627.53Show/hide
Query:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC-----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHA
        L++EI+ F ++++     +K  +   V R+   ++ LWP +   IFGS  TGL LPTSD+DLVV      LP    L  ++EA                 
Subjt:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC-----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHA

Query:  ARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTP
           L   +    DS+K ++   +PII L                                                        + S   V++DISF   
Subjt:  ARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTP

Query:  SHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGS
           G++ + L+K  T+++P    L LVLK FL  R L++ ++GG+ SY L L+ V FLQ H    +   N N+G LL++F   +G  F+  +  I I+  
Subjt:  SHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGS

Query:  GVYIKRER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID
        G Y+ ++        GY    L+I+DPL P N+VGR+ +   Q  +AF  AY +L   +  +       ++ T S+L +II   D
Subjt:  GVYIKRER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID

Q6PB75 Terminal nucleotidyltransferase 4A1.5e-2527.58Show/hide
Query:  VKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIM
        VKR+   ++ LWP +   IFGS +TGL LPTSD+DLVV      PP++ LE          ++ + E C                 S+K ++   +PII 
Subjt:  VKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIM

Query:  LVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALV
        L                                                        +     V++DISF     TG++ +  +K   +++     L LV
Subjt:  LVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALV

Query:  LKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRER-------GYSIDPLHIDDP
        LK FL  R L++ ++GG+SSY L+L+ + FLQ H    +R  ++N G LL++F   +G  F+  +  I I+  G YI +E        GY    L I+DP
Subjt:  LKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRER-------GYSIDPLHIDDP

Query:  LFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISL-----NDNGDSSSDATSSVLQKII
        L P N+VGR+ +   Q  + F  AY +L   +  L     N + +S+      V Q++I
Subjt:  LFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISL-----NDNGDSSSDATSSVLQKII

Q7KVS9 Non-canonical poly(A) RNA polymerase protein Trf4-12.0e-2526.91Show/hide
Query:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLS
        L++EI  F ++V      +       VKR+   +  +WP++   IFGS  TGL LPTSD+DLVV    +    P++         GI E C         
Subjt:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLS

Query:  NQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGL
                +++ ++  ++PII L                                                        +     V++DISF   S  G+
Subjt:  NQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTPSHTGL

Query:  QTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQHEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKR
        Q++ L+KK    +P    L LVLK FL  R L++ ++GG+SSY L+L+ + FLQ           N G LL++F   +G  F+  ++ ISI+  G Y+ +
Subjt:  QTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQHEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKR

Query:  ER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID
        +        G+    L I+DPL P N++GR+ + + Q  +AF  AY +L   +  LN  G       +S+L +II   D
Subjt:  ER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID

Q8NDF8 Terminal nucleotidyltransferase 4B4.1e-2627.53Show/hide
Query:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC-----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHA
        L++EI+ F ++++     +K  +   V R+   ++ LWP +   IFGS  TGL LPTSD+DLVV      LP    L  ++EA                 
Subjt:  LNDEINSFCKHVAAENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVC-----LPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHA

Query:  ARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTP
           L   +    DS+K ++   +PII L                                                        + S   V++DISF   
Subjt:  ARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLIASSTSNMQSSKEESSAVSGEQDVNLLNDMASLEDSALQKCLVVKYDSSSSTKSVRIDISFKTP

Query:  SHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGS
           G++ + L+K  T+++P    L LVLK FL  R L++ ++GG+ SY L L+ V FLQ H    +   N N+G LL++F   +G  F+  +  I I+  
Subjt:  SHTGLQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQ-HEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGS

Query:  GVYIKRER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID
        G Y+ ++        GY    L+I+DPL P N+VGR+ +   Q  +AF  AY +L   +  +       ++ T S+L +II   D
Subjt:  GVYIKRER-------GYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILESELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSID

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00060.1 Nucleotidyltransferase family protein5.2e-31153.52Show/hide
Query:  MFISLDCTKLELLGEGNSKSLPSKST-ENLGASRRRKKGKIRKSQNPVPKPCVGDLSCNKFHK--PQDFDKECAHKGREDMMESTTPILSKG-NDTCREM
        M IS+D  K ELL +   K  PS S+ + LG++ R++KGK R  + P P+    D + N   K   +D  K   +K RE +     P  S   ND   E 
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Query:  SAEVHDHIMSVGKNQGPTRKKKKHKSK--------NSGGNNRLVEIIPSEGPTAKFSSPSFSSQDQVAELDNRFRKPFISNIKNDSSNNYDSLTSNSSPI
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          + E + E  S+   E H IS    SV                         P+  PS E         NVN     C  + +EK ++ ++  RT D  
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        E   +   +      F+       +           S  +SHLP ATDRLHLD GHN H + R+ F   +   R+ S++G    +L+RP+ MSLDWPP++
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         S  GL +  T N+D                             SG L D P+  N  +L +EC+ NW+ EE+ E+H VSG+DYNQYFGGGVMYWNPSDH
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        HWG++GW+ DG N EE      GAE+V P WRNKS +    +QPL        LIAMSQ+  DQEHPDVAFPL PP   +CP++ ESLSL+H  LNDEI+
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        SFCK VAAENM +KPYI WA+KRVTRSLQVLWPRSRTNIFGS+ATGLSLP+SDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYL+NQEWVK
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        +DSLKTVENTAIPIIMLVVEVP DLI S    +QS K+    ++ +QD N   +M   EDSA    L     + +  KSVR+DISFKTPSHTGLQT+ LV
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        K LTEQFPA  PLALVLK FLADR+LDQSYSGGLSSYCLVLLI RFLQHEHHL R INQN G LLMDFLYFFGNVFDPRQMR+S+QGSG+Y  RERGYSI
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        DP+HIDDPLFP NNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYS+LE+EL  +    DS       ++L KIIPSI
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AT5G53770.1 Nucleotidyltransferase family protein4.0e-2124.72Show/hide
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        S +   K  +L  +    +PII  V                                                            ++  D+SF      G
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Query:  LQTSGLVKKLTEQFPATIPLALVLKMFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIVRFLQHEHHLSRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQ-GSGVYI
         + +  ++    + P   PL L+LK+FL  R L++ YSGG+ SY L+ +++ FL++          N G LL+ F  F+G   +   + IS + G   + 
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Query:  KRERGY----SIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCIKAFSEAYSILES--ELISLNDN
        K  +G+        + I+DP  P N++G++ F   Q   AF+ A S L +   ++SL  N
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Sequences Show/hide sequences
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GCCCCCCGTCTTACGAAGTGCTTCTGGCTTGGCTTCAACAATGACGTCAAATCATGATTTTGGGTTTCTTCCTAGGAGACAATCTACTTTTCGGCAGGGGTTCCCTACTA
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TCGACCTCCTTCTCTTAGTTCTGATGATAGCTCATGGGCTTGGCGTGAAGCTGACATGAATCGGACTGTTGATGATATGGTTGCTTTCTCTTCTTCTTACAGTAATGGAT
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CATTCCTCACTGACTATGAATGATTCGGTGACAGAGGAGGATGCTCCTAGATCTTTGGCAAATTTGCCTAGTGATGTTGAAGGGAAGACAGGAGACTCACATCCATTTCC
AATGTTGCCGCCTATTGTTATTCCAAATATGTCTAGGGAAAGATCAAGATCTGAGTTCTGCCATGGTTTTGACCATAAAAGCCCATGCATCCCTCCCACTAGGAGAGAGC
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ACTGTTAGATCTGGTAGCTCAAGTCCAAGGCATTGGGGTGTAAAGGGTTGGTATCCTGATGGAACTAATTTGGAAGAAGCGTGCTTACATATTGATGGTGCTGAAGTTGT
CTGGCCTAATTGGAGAAATAAAAGTAATTCTAATTGCTCGACAGTTCAACCTTTATCATTAATAGCAATGTCCCAGATAGCTCTCGATCAGGAGCATCCAGATGTTGCGT
TTCCTCTCTTTCCCCCAACAACAAGCTGTCCTGTAAAAAAGGAATCTCTTTCTTTGATGCATAGCCGCCTAAATGATGAGATCAACTCTTTCTGCAAGCATGTTGCTGCA
GAAAACATGACTAAGAAGCCTTACATCACATGGGCTGTTAAACGGGTCACGCGGTCCCTTCAAGTCTTATGGCCCAGGTCCAGGACAAACATTTTTGGTTCAAATGCAAC
AGGTTTATCCCTTCCCACGAGTGATGTGGACCTTGTGGTTTGTCTGCCTCCAGTGAGAAATCTGGAACCTATTAAGGAAGCTGGGATCCTAGAAGGGCGTAATGGCATTA
AAGAAACCTGCCTTCAGCATGCAGCCAGATATCTTTCCAATCAGGAATGGGTAAAAAGTGATTCCTTAAAGACGGTGGAAAATACTGCTATACCTATTATCATGCTTGTT
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GGCTAGTTTAGAAGATTCTGCGCTGCAAAAATGTTTGGTGGTGAAATATGATTCCTCATCTAGCACCAAGTCAGTTCGTATTGACATCAGTTTCAAGACTCCATCACATA
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GAGCTGATATCCCTTAATGATAATGGTGATTCTAGTTCAGATGCAACTAGTAGTGTGCTGCAGAAAATAATCCCTAGCATTGATTTATCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NHFRRSFTPAMHQPRSSSVKGGCNPILTRPLLMSLDWPPVLRSASGLASTMTSNHDFGFLPRRQSTFRQGFPTNGNQISTEDEKYSGNLTDFPDLSNNQDLADECDGNWI
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TVRSGSSSPRHWGVKGWYPDGTNLEEACLHIDGAEVVWPNWRNKSNSNCSTVQPLSLIAMSQIALDQEHPDVAFPLFPPTTSCPVKKESLSLMHSRLNDEINSFCKHVAA
ENMTKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLV
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ELISLNDNGDSSSDATSSVLQKIIPSIDLS