| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6597332.1 Nuclear transport factor 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.5e-152 | 98.95 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
MLPISSLSNSPTMATAAGAS+FTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Subjt: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Query: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Subjt: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Query: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQGGR
EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG +
Subjt: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQGGR
|
|
| KAG7028798.1 hypothetical protein SDJN02_09979 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 6.0e-144 | 98.53 | Show/hide |
Query: AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYF
AAGAS+FTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIES PLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYF
Subjt: AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYF
Query: GNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTS
GNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTS
Subjt: GNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTS
Query: ESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQGGR
ESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG +
Subjt: ESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQGGR
|
|
| XP_022937376.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 3.5e-152 | 100 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Subjt: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Query: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Subjt: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Query: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
Subjt: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
|
|
| XP_022974541.1 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein [Cucurbita maxima] | 2.5e-142 | 97.83 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMAT-AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
MLPISSLSNSPTMAT AAGASLF TKRWLSDALL TPSALMFPILS SLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
Subjt: MLPISSLSNSPTMAT-AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
Query: VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
Subjt: VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
Query: SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE CNELELEGRVIRV
Subjt: SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
|
|
| XP_023539751.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 4.3e-150 | 98.61 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMAT---AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEG
MLPISSLSNSPTMAT AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEG
Subjt: MLPISSLSNSPTMAT---AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEG
Query: QAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLY
Q VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLY
Subjt: QAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLY
Query: PDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
PDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
Subjt: PDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L496 Uncharacterized protein | 1.4e-111 | 78.85 | Show/hide |
Query: ATAAGASLFTT-------KRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPV
A A GAS F T K WLSD+LL TPS + PILSRSLAIES LRA SE+WRP + ISAAVVQ + AVT GVEEGV +ET V+GGSPV
Subjt: ATAAGASLFTT-------KRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPV
Query: ESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYV
ESG TKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQDYG+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP++EY+L+V
Subjt: ESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYV
Query: SNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
NLSWSVTSE L QAFQEYGNVVGARVIYD ETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE NELELEGRVIRVSLA+GKQA G
Subjt: SNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
|
|
| A0A1S4DSH7 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein | 5.7e-108 | 79.55 | Show/hide |
Query: ATAAGASLFTT-------KRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPV
A A GAS FTT K W SD+LL TPS + PILSRSL IES PLRA SERWRP L ISAAVVQ + AV GVEEGV +ET AV+GGSPV
Subjt: ATAAGASLFTT-------KRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPV
Query: ESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYV
ESG TKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP++EY+L+V
Subjt: ESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYV
Query: SNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
NLSWSVTSE L QAFQEYGNVVGARVIY+ ETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEA NE+ELEGRVIRV
Subjt: SNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
|
|
| A0A6J1DUT6 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.4e-109 | 79.77 | Show/hide |
Query: TKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVD
+K WLSD+LL PS M P+LSR LA+ESA LRAFSE+WRP LGISAAVVQ + AVT EEGVA+ E+G G+AV GGSPVE+G TKLYFGNLPYSVD
Subjt: TKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVD
Query: SSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQ
SSQLA IVQ++GV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP++EY+L+V NLSWSVTSESL QAFQ
Subjt: SSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQ
Query: EYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
EYGNVVGARVIY+ ETG+SRGYGFVSYSTK EME ALEA NE+ELEGRVIRVSLA+GKQAQG
Subjt: EYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
|
|
| A0A6J1FA65 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like | 1.7e-152 | 100 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Subjt: MLPISSLSNSPTMATAAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAV
Query: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Subjt: DGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPDS
Query: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
Subjt: EYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGKQAQG
|
|
| A0A6J1IBM8 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein | 1.2e-142 | 97.83 | Show/hide |
Query: MLPISSLSNSPTMAT-AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
MLPISSLSNSPTMAT AAGASLF TKRWLSDALL TPSALMFPILS SLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
Subjt: MLPISSLSNSPTMAT-AAGASLFTTKRWLSDALLTTPSALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQA
Query: VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
Subjt: VDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPKGLLYPD
Query: SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE CNELELEGRVIRV
Subjt: SEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.5e-36 | 40.1 | Show/hide |
Query: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGK-----TKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYM
EEG + + GE V+ E + KL+ GNLPY VDS LA + + GV E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E +
Subjt: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGK-----TKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYM
Query: GRLLRVNFS----DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIR
GRLL VN + ++P+ + S Y +YV N+ W + L Q F E+G VV ARV+YD ETG+SRG+GFV+ ++++EM A+ + L+GR IR
Subjt: GRLLRVNFS----DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIR
Query: VSLAQGK
V++A+ +
Subjt: VSLAQGK
|
|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 3.2e-39 | 39.82 | Show/hide |
Query: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLR
EE +E E E ++V+GG +LY GNLP+S+ SSQL++I + G +E++YDR T +SRGFAFVTM S+E+ + I DG+ GR ++
Subjt: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLR
Query: VNFSDKPK--PKGLL----------YPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGR
VNF + P+ + ++ + DS ++LYV+NLSW++TS+ L AF + + A+VIYD +G+SRG+GF+++S+ M +AL+ NE+ELEGR
Subjt: VNFSDKPK--PKGLL----------YPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGR
Query: VIRVSLAQGKQAQGGRPVAGT
+R+++A K PV T
Subjt: VIRVSLAQGKQAQGGRPVAGT
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 7.8e-38 | 45.24 | Show/hide |
Query: KAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGT
+ AV++G E V+DE EG GQ P E + KL+ GNLPY VDS +LA I GV E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMS++E+ K +E L+G
Subjt: KAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGT
Query: AYMGRLLRVNFSDKPKPKGL--LYPDSEYE----LYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELE
GR L VN K P+G P ++E +YV NL W V + L Q F E+G VV ARV+ D ETG+SRG+GFV+ S++SE+ A+ A + L+
Subjt: AYMGRLLRVNFSDKPKPKGL--LYPDSEYE----LYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELE
Query: GRVIRVSLAQ
GR +RV++A+
Subjt: GRVIRVSLAQ
|
|
| Q08935 29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic | 3.6e-35 | 41.33 | Show/hide |
Query: DGGSPVE-----SGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPK----
DG VE S K++ GNLP+S DS+ LA++ + G E++EV+YD+ TG+SRGF FVTMSS E+ + +G GR LRVN P+
Subjt: DGGSPVE-----SGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPK----
Query: ------PKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGK
+G DS +YV NL+W V ++L F E G VV A+V+YD ++G+SRG+GFV+YS+ E+ A+E+ + ++L GR IRVS A+ +
Subjt: ------PKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGK
|
|
| Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic | 2.1e-35 | 42.05 | Show/hide |
Query: DETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFS-
DE+ E +G G P + KL+ GNLPY VDS LA + + G E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E + GR L VN +
Subjt: DETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFS-
Query: ---DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQ
+P+ + +Y D+ + +YV NL W V S L + F E+G VV ARV+ D ETG+SRG+GFV S ++E+ A+ A + LEGR I+V++A+
Subjt: ---DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-67 | 57.92 | Show/hide |
Query: RPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSI
+P L S + +R ++ + + +E ++G +D P + TKLYFGNLPY+VDS+ LA I+QD+ EL+EVLY+R+TG+SRGFAFVTMS++
Subjt: RPALGISAAVVQRKAAVTFGVEEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSI
Query: EDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKP-KGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE
EDCN +I+NLDGT Y+GR L+VNF+DKPKP K LYP++E++L+V NLSW+VTSESLA AF+E G+VVGARV++D +TG+SRGYGFV YS+K+EMETALE
Subjt: EDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKP-KGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE
Query: ACNELELEGRVIRVSLAQGKQ
+ + ELEGR IRV+LAQGK+
Subjt: ACNELELEGRVIRVSLAQGKQ
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-34 | 35.93 | Show/hide |
Query: ALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVT--FGVEE-GVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDY
+L+ P LS L +S + + +W A+ R A+T F VEE G AD + + + D KL+ GNLP++VDS+QLA + +
Subjt: ALMFPILSRSLAIESAPLRAFSERWRPALGISAAVVQRKAAVT--FGVEE-GVADETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDY
Query: GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPK-----------------------GLLYPDSEYELYVSNLSW
G E++EV+YD+ TG+SRGF FVTMSS+ + + +G GR LRVN + P PK G S +YV NLSW
Subjt: GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFSDKPKPK-----------------------GLLYPDSEYELYVSNLSW
Query: SVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGK
V +L F E G VV ARVIYD ++G+S+G+GFV+Y + E++ A+++ + +L+GR IRVS A+ +
Subjt: SVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQGK
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 9.8e-36 | 34.74 | Show/hide |
Query: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESG--KTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRL
EE +E +EGE + + ++ + +LY GNLPY++ SS+L+ I + G ++++YD+ T +SRGF FVTM SIE+ + ++ + + GR
Subjt: EEGVADETAEEGEGQAVDGGSPVESG--KTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRL
Query: LRVNFSDKP------------KPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELE
++VNF + P + Y DS +++Y NL W++TS+ L AF + V+GA+VIY+ TG+SRG+GF+S+ + +++AL N +E+E
Subjt: LRVNFSDKP------------KPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELE
Query: GRVIRVSLAQGKQ
GR +R++LA ++
Subjt: GRVIRVSLAQGKQ
|
|
| AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein | 6.3e-35 | 39.81 | Show/hide |
Query: EGVADE----TAEEGEGQAVDGG------SPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG
EG A E +E EG +G P S + KL+ GNL Y V+S LA + + G E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMSS+++ +E +
Subjt: EGVADE----TAEEGEGQAVDGG------SPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG
Query: TAYMGRLLRVNFS----DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEG
GRLL VN + +P+ +Y + + +YV NL W V + L Q F E+G VV ARV+YD ETG+SRG+GFV+ S E+ A+ A + LEG
Subjt: TAYMGRLLRVNFS----DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEG
Query: RVIRVSLAQGKQAQGG
R IRV++A+ + + G
Subjt: RVIRVSLAQGKQAQGG
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 1.5e-36 | 42.05 | Show/hide |
Query: DETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFS-
DE+ E +G G P + KL+ GNLPY VDS LA + + G E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E + GR L VN +
Subjt: DETAEEGEGQAVDGGSPVESGKTKLYFGNLPYSVDSSQLADIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRLLRVNFS-
Query: ---DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQ
+P+ + +Y D+ + +YV NL W V S L + F E+G VV ARV+ D ETG+SRG+GFV S ++E+ A+ A + LEGR I+V++A+
Subjt: ---DKPKPKGLLYPDSEYELYVSNLSWSVTSESLAQAFQEYGNVVGARVIYDDETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEACNELELEGRVIRVSLAQ
|
|
