| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6597486.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.4e-123 | 88.49 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR+ FERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYS SPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| KAG7028947.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 5.9e-125 | 89.21 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RN GARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_022939180.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata] | 6.3e-127 | 89.93 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_022973749.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 8.5e-116 | 84.53 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RN GARGE+YSPARSRSISQS FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| XP_023539925.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 9.1e-118 | 86.69 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRY DDD SRDRYHESRSYRDRRSPA SGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RNRGARGEYYSPARSRSISQS FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSR PRAVSRS SGSRSRS+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.0e-99 | 76.26 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRY DDD RDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TS SSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
R+RGAR EY SPARSRSIS S P D++DYS+SP PK+NGRS REV+ A S SR P+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.3e-103 | 79.14 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPR RKRY DDD RDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TS SSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RNRGAR EY SPARSRSIS+S PHD+RDYS+SP PKENGRS REV+I S SR RA SRS SGSRS+S+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1FLY4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.0e-127 | 89.93 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1IFJ5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.1e-116 | 84.53 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
RN GARGE+YSPARSRSISQS FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.6e-99 | 76.98 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRY DDD RDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
RF+EDA EAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TS SSGRS RRRSP RSPRRR SYSRSPSPARHDS
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
R+RGAR EY SPARSRSIS+S P D+RDYS+SP PKENGRS R V+IA S SR PRA SRS SGSRSRS+SPR
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.4e-57 | 54.12 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR+RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGF
R++EDA EA +++N VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +S
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGF
Query: LSCYRERNRGARGEYYSP-ARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
++ + YSP RSRSIS+S P ++R+Y N RS RE + SR LS SRSRS S
Subjt: LSCYRERNRGARGEYYSP-ARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 4.5e-27 | 40.43 | Show/hide |
Query: YRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFS
Y R Y R RS PP R+ Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F +
Subjt: YRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFS
Query: EDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
DA EA++ +N+ GREI +V A E+RK P+EMR + + R R RS GRS R+RS SRS SP R S S Y + +
Subjt: EDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLS
Query: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRS---SREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRS
R R RGE RS S P + + +P NG + + A RG RAVSRS SGSRSRS
Subjt: CYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRS---SREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRS
|
|
| Q8WXF0 Serine/arginine-rich splicing factor 12 | 1.5e-19 | 34.44 | Show/hide |
Query: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS---CSS
P + L +RN+ RPEDLR F R+GP+ DVY+P ++YT PRGF +V+F DA +A LN+ + GR+I I FA+ +RKTP +M+S CS
Subjt: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS---CSS
Query: GRSYRRRSPGRSPRR-------RNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPA---RSRSISQSCFPHDKRDYS
R RSP + R RNR S S +RH F + S +L + + S RN G+RG S + RS+SI +S ++ S
Subjt: GRSYRRRSPGRSPRR-------RNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPA---RSRSISQSCFPHDKRDYS
Query: QSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
+ + +GR S +IA S + P+ + S + ++ HS
Subjt: QSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.5e-33 | 42.75 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERN
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR T GRS R + RSP R YSRSP P R S R R+
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERN
Query: RGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK-----RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
RG Y SP R S+S P D+ R YS+SP + S S SR PR RS+S ++RS++P
Subjt: RGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK-----RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 3.5e-32 | 41.84 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDS
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ GR RRR+P R P RR RS SR SP P RH IS G S
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDS
Query: ARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GSRSRSHSP
+ G+RG +P R +S S S P +R S+SPR PK N S R ++ + SR PR RS + +RSRS SP
Subjt: ARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GSRSRSHSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.5e-33 | 41.84 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDS
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ GR RRR+P R P RR RS SR SP P RH IS G S
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDS
Query: ARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GSRSRSHSP
+ G+RG +P R +S S S P +R S+SPR PK N S R ++ + SR PR RS + +RSRS SP
Subjt: ARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GSRSRSHSP
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 4.4e-30 | 40.22 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRER
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ GR RRR+P PR +R SRSP P R R
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR-SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRER
Query: NRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
+R G+YYSP R +S P ++R +GR S + A GSRG RSL+ R +S S
Subjt: NRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.5e-30 | 39.74 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRG
R RSY+P SPPR R R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRG
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRG
Query: FGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSY--RRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFIS
FGFV+F DA +AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ G + RRR+P R P RR RS SR SP P RH IS
Subjt: FGFVKFRFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSY--RRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSSFIS
Query: TYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GS
G S + G+RG +P R +S S S P +R S+SPR PK N S R ++ + SR PR RS + +
Subjt: TYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERNRGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPR------PKENGRSS--REVNIACSGSRGPRAVSRSLS--GS
Query: RSRSHSP
RSRS SP
Subjt: RSRSHSP
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.7e-34 | 42.75 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERN
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR T GRS R + RSP R YSRSP P R S R R+
Subjt: IEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGFLSCYRERN
Query: RGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK-----RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
RG Y SP R S+S P D+ R YS+SP + S S SR PR RS+S ++RS++P
Subjt: RGARGEYYSPARSRSISQSCFPHDK-----RDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 1.0e-58 | 54.12 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR+RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRDRKRYDDDDDSRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGF
R++EDA EA +++N VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +S
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNQTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSCSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSSFISTYSTYLIGALEDSARTGF
Query: LSCYRERNRGARGEYYSP-ARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
++ + YSP RSRSIS+S P ++R+Y N RS RE + SR LS SRSRS S
Subjt: LSCYRERNRGARGEYYSP-ARSRSISQSCFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIACSGSRGPRAVSRSLSGSRSRSHS
|
|
