; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh06G016030 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh06G016030
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH62-like
Genome locationCmo_Chr06:11225025..11227751
RNA-Seq ExpressionCmoCh06G016030
SyntenyCmoCh06G016030
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029055.1 Transcription factor bHLH62 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-25996.93Show/hide
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XP_022936546.1 transcription factor bHLH62-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.6e-22688.25Show/hide
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XP_022972197.1 transcription factor bHLH62-like isoform X1 [Cucurbita maxima]3.6e-25595.1Show/hide
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XP_023540383.1 transcription factor bHLH62-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-25796.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CCI6 transcription factor bHLH78-like3.7e-19771.61Show/hide
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        ME+EFFMNDG +FYGM+       SS LF N+NWENSMDQSDLFESTLSSIVSSP NSHA         GGDN+MMRELIGRLGSIC+SG+ISPHSYIGG
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        ENHE  GKKIKP      EMDAAKGKAEAKD T       QKQ NDNSKPPEPPKDYIHVRA+RGQATDSHSLAERV       RREKISKRMKFLQDLV
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Query:  PGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLH-------------
        PGCNK+TGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKL+TVNPRMDFNMETLLPKDIFK   S PHT+YP DSS+PTF YEYQSM++PPLH             
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Query:  -----------SDQTQGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL
                   S Q   GY ++GNGIQISKFWEDELH+VVQMGY Q Q+QN + EMKSEL
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A0A6J1F7S5 transcription factor bHLH62-like isoform X27.7e-22788.25Show/hide
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A0A6J1FDI3 transcription factor bHLH62-like isoform X13.2e-26598.56Show/hide
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A0A6J1I462 transcription factor bHLH62-like isoform X11.7e-25595.1Show/hide
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        NSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERV       RREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNME
Subjt:  NSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNME

Query:  TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL
        TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYH+MGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY QTQLQNP  EMKSEL
Subjt:  TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL

A0A6J1I970 transcription factor bHLH62-like isoform X25.0e-21885.1Show/hide
Query:  MEKEFFMNDGSSFYGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGS-----GGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNN
        MEKEFFMNDGSSFYGMDSSVLFN NWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGG+     GGGDNLMMRELIGRLGSICSS              
Subjt:  MEKEFFMNDGSSFYGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGS-----GGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNN

Query:  NSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM
                                            G AER ARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM
Subjt:  NSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM

Query:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNND
        GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRK KSA TGEAKNVKAAGENH+PNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNND
Subjt:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNND

Query:  NSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNME
        NSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERV       RREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNME
Subjt:  NSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNME

Query:  TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL
        TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYH+MGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY QTQLQNP  EMKSEL
Subjt:  TLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQTQGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C670 Transcription factor bHLH763.4e-3836.47Show/hide
Query:  NLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDD
        N+A F AD G  ER A+FS FG   + +N Q  S    + +   +    + SG  S++ +    + S +  +  +          V      S    +DD
Subjt:  NLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDD

Query:  SREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHS
        ++ G + S+       GF    RKR                     GK  + E D  +   ++  +   + N   +P +  KD YIH+RA+RGQAT+SHS
Subjt:  SREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHS

Query:  LAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSS-SLPHTIYPIDSSV
        LAERV       RREKIS+RMKFLQDLVPGC+K+TGKAVMLDEIINYVQSLQ Q+EFLSMKL+ VNP +DFN+E+LL KD  + S+ + PH +  +    
Subjt:  LAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSS-SLPHTIYPIDSSV

Query:  PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT--QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY
        P  +Y  Q+  + P  S  +   GG  +     Q +  +E + H++V M +
Subjt:  PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT--QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY

Q9CAA9 Transcription factor bHLH491.7e-4237.63Show/hide
Query:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM
        +N P   PP    L + +  +  P     F AD G  ER ARFS F  GN +  VN  L ++E   L    + G G   G+                +++
Subjt:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM

Query:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEM--DAAKGKAEAKDAT
         V + ++  +  V     RSS     +     +VSE   +    G+ G + ++  +K    G+ KN +AA ++H     + +P+   D  +   ++ ++ 
Subjt:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEM--DAAKGKAEAKDAT

Query:  QKQNN----DNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA
         K++N       +  +PPKD YIHVRA+RGQAT+SHSLAERV       RREKIS+RMKFLQDLVPGCNK+TGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKLA
Subjt:  QKQNN----DNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA

Query:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY
        TVNP+MDFN+E LL KD  +   GSSS   T +P + S+  P   + +    +  +    T       GG+ +     Q +  WE +L +V+ + Y
Subjt:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY

Q9FJL4 Transcription factor bHLH781.2e-5943.83Show/hide
Query:  DSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGN-
        DSS L+  + E    QS +F+S LSS+VSSP  S++        GGGD  ++RELIG+LG+I ++   S   Y  GT   S + SCY TP++SPP   N 
Subjt:  DSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGN-

Query:  ---LSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRF
           + +     L  FSADPG AER ARFSCFG+++   NG+  +N      N  +      SGKL+RVSS  +           V  G   + K+     
Subjt:  ---LSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRF

Query:  SRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAK
         +  + EN  S    S S   TA + G K  ++                  + E  GK+ + E D  + + E     +   ++N+KPPEPPKDYIHVRA+
Subjt:  SRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAK

Query:  RGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVN-PRMDFNMETLLPKDIFKGSSS
        RGQATDSHSLAERV       RREKI +RMK LQDLVPGCNK+TGKA+MLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKL++VN  R+DFN++ L+ KD+   SS+
Subjt:  RGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVN-PRMDFNMETLLPKDIFKGSSS

Q9LK48 Transcription factor bHLH776.4e-4541.71Show/hide
Query:  FGNKNLAVNGQLCS---NETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSR--EGSSVSEQITAGE
        FGN N    G       N  QE+S  ++    +     S++S N  F +SG G +     G   ++++     S+ +T E++ S   +  SVS+++    
Subjt:  FGNKNLAVNGQLCS---NETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSR--EGSSVSEQITAGE

Query:  LGFKVNTRKRKSAHTGEAK-----------NVKAAGEN-HEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAER
           K N+RKRKS  +G  K           N K +GEN     GK+ K ++  +      K  ++  N D++KPPE PKDYIHVRA+RGQATDSHSLAER
Subjt:  LGFKVNTRKRKSAHTGEAK-----------NVKAAGEN-HEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAER

Query:  VRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAY
                RREKIS+RM  LQDLVPGCN+ITGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKLATVNPRM+FN    L  ++ +   SL  ++Y +  S      
Subjt:  VRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAY

Query:  EYQSM--NIPPLHSDQ---TQGGYHKMGNGIQISKFWE-DELHSVVQMGY
         Y S+  N+P     Q     G  H    G     FWE ++L S+VQMG+
Subjt:  EYQSM--NIPPLHSDQ---TQGGYHKMGNGIQISKFWE-DELHSVVQMGY

Q9SRT2 Transcription factor bHLH627.2e-6538.34Show/hide
Query:  MEKEFFMNDGSSF---------------------YGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSIC
        ME E FMN G S                        +D S+  N  WE S +QS +F+S LSS+VSSP  S++   +GG   GG+N++MRELIG+LG+I 
Subjt:  MEKEFFMNDGSSF---------------------YGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSIC

Query:  SSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNK--NLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKL
          G+I      G T +N    SCY TP++SPP    +       +A  S DPG AER ARFSCFG++  N   N     N    ++            K+
Subjt:  SSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNK--NLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKL

Query:  SRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMD
         RVSS+  F                            S  P  + S            GEL  K  T+ ++++ +  + + K   E  + + K+ K    
Subjt:  SRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMD

Query:  AAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVE
                     ++N D +K  +P KDYIHVRA+RGQATDSHSLAERV       RREKIS+RMK LQDLVPGCNK+TGKA+MLDEIINYVQSLQ QVE
Subjt:  AAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVE

Query:  FLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPH--TIYPIDSSVPTFAYEYQSMN------------IPPLHSDQTQGGY-------HKMGNGIQISKF
        FLSMKL++VN R+DFNM+ LL KDIF  S++L H   +  +DSS  T   ++ + N            I PL + +T+          H   +  Q S F
Subjt:  FLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPH--TIYPIDSSVPTFAYEYQSMN------------IPPLHSDQTQGGY-------HKMGNGIQISKF

Query:  WEDELHSVVQMGYVQTQLQ
         ED+LHS++ MG+ Q +LQ
Subjt:  WEDELHSVVQMGYVQTQLQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-4337.63Show/hide
Query:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM
        +N P   PP    L + +  +  P     F AD G  ER ARFS F  GN +  VN  L ++E   L    + G G   G+                +++
Subjt:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM

Query:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEM--DAAKGKAEAKDAT
         V + ++  +  V     RSS     +     +VSE   +    G+ G + ++  +K    G+ KN +AA ++H     + +P+   D  +   ++ ++ 
Subjt:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEM--DAAKGKAEAKDAT

Query:  QKQNN----DNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA
         K++N       +  +PPKD YIHVRA+RGQAT+SHSLAERV       RREKIS+RMKFLQDLVPGCNK+TGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKLA
Subjt:  QKQNN----DNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA

Query:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY
        TVNP+MDFN+E LL KD  +   GSSS   T +P + S+  P   + +    +  +    T       GG+ +     Q +  WE +L +V+ + Y
Subjt:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.4e-4437.37Show/hide
Query:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM
        +N P   PP    L + +  +  P     F AD G  ER ARFS F  GN +  VN  L ++E   L    + G G   G+                +++
Subjt:  YNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAP-----FSADPGLAERVARFSCF--GNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQM

Query:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKV--NTRKRK----SAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEA
         V + ++  +  V     RSS     +     +VSE   +    G+ G +   NT+KRK    ++   ++   + + E  + NG + + +  +     + 
Subjt:  GVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITA----GELGFKV--NTRKRK----SAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEA

Query:  KDATQKQNNDNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA
         ++ ++Q   +S   +PPKD YIHVRA+RGQAT+SHSLAERV       RREKIS+RMKFLQDLVPGCNK+TGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKLA
Subjt:  KDATQKQNNDNSKPPEPPKD-YIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLA

Query:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY
        TVNP+MDFN+E LL KD  +   GSSS   T +P + S+  P   + +    +  +    T       GG+ +     Q +  WE +L +V+ + Y
Subjt:  TVNPRMDFNMETLLPKDIFK---GSSSLPHTIYPIDSSV--PTFAYEYQSMNIPPLHSDQT------QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGY

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.1e-6638.34Show/hide
Query:  MEKEFFMNDGSSF---------------------YGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSIC
        ME E FMN G S                        +D S+  N  WE S +QS +F+S LSS+VSSP  S++   +GG   GG+N++MRELIG+LG+I 
Subjt:  MEKEFFMNDGSSF---------------------YGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSIC

Query:  SSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNK--NLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKL
          G+I      G T +N    SCY TP++SPP    +       +A  S DPG AER ARFSCFG++  N   N     N    ++            K+
Subjt:  SSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGNLSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNK--NLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKL

Query:  SRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMD
         RVSS+  F                            S  P  + S            GEL  K  T+ ++++ +  + + K   E  + + K+ K    
Subjt:  SRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMD

Query:  AAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVE
                     ++N D +K  +P KDYIHVRA+RGQATDSHSLAERV       RREKIS+RMK LQDLVPGCNK+TGKA+MLDEIINYVQSLQ QVE
Subjt:  AAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVE

Query:  FLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPH--TIYPIDSSVPTFAYEYQSMN------------IPPLHSDQTQGGY-------HKMGNGIQISKF
        FLSMKL++VN R+DFNM+ LL KDIF  S++L H   +  +DSS  T   ++ + N            I PL + +T+          H   +  Q S F
Subjt:  FLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPH--TIYPIDSSVPTFAYEYQSMN------------IPPLHSDQTQGGY-------HKMGNGIQISKF

Query:  WEDELHSVVQMGYVQTQLQ
         ED+LHS++ MG+ Q +LQ
Subjt:  WEDELHSVVQMGYVQTQLQ

AT3G23690.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.5e-4641.71Show/hide
Query:  FGNKNLAVNGQLCS---NETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSR--EGSSVSEQITAGE
        FGN N    G       N  QE+S  ++    +     S++S N  F +SG G +     G   ++++     S+ +T E++ S   +  SVS+++    
Subjt:  FGNKNLAVNGQLCS---NETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRFSRSSTPENDDSR--EGSSVSEQITAGE

Query:  LGFKVNTRKRKSAHTGEAK-----------NVKAAGEN-HEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAER
           K N+RKRKS  +G  K           N K +GEN     GK+ K ++  +      K  ++  N D++KPPE PKDYIHVRA+RGQATDSHSLAER
Subjt:  LGFKVNTRKRKSAHTGEAK-----------NVKAAGEN-HEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAER

Query:  VRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAY
                RREKIS+RM  LQDLVPGCN+ITGKAVMLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKLATVNPRM+FN    L  ++ +   SL  ++Y +  S      
Subjt:  VRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAY

Query:  EYQSM--NIPPLHSDQ---TQGGYHKMGNGIQISKFWE-DELHSVVQMGY
         Y S+  N+P     Q     G  H    G     FWE ++L S+VQMG+
Subjt:  EYQSM--NIPPLHSDQ---TQGGYHKMGNGIQISKFWE-DELHSVVQMGY

AT5G48560.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.5e-6143.83Show/hide
Query:  DSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGN-
        DSS L+  + E    QS +F+S LSS+VSSP  S++        GGGD  ++RELIG+LG+I ++   S   Y  GT   S + SCY TP++SPP   N 
Subjt:  DSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSPPMKGN-

Query:  ---LSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRF
           + +     L  FSADPG AER ARFSCFG+++   NG+  +N      N  +      SGKL+RVSS  +           V  G   + K+     
Subjt:  ---LSVGHHQNLAPFSADPGLAERVARFSCFGNKNLAVNGQLCSNETQELSNKSMAGAGVESGKLSRVSSNKSFNVSGIGSQMGVQKGNSMANKKVMNRF

Query:  SRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAK
         +  + EN  S    S S   TA + G K  ++                  + E  GK+ + E D  + + E     +   ++N+KPPEPPKDYIHVRA+
Subjt:  SRSSTPENDDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAK

Query:  RGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVN-PRMDFNMETLLPKDIFKGSSS
        RGQATDSHSLAERV       RREKI +RMK LQDLVPGCNK+TGKA+MLDEIINYVQSLQ QVEFLSMKL++VN  R+DFN++ L+ KD+   SS+
Subjt:  RGQATDSHSLAERVRAKALIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVN-PRMDFNMETLLPKDIFKGSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAGGAGTTCTTCATGAACGATGGAAGCAGTTTTTATGGGATGGATTCGAGTGTGTTGTTCAATTCCAATTGGGAAAATTCGATGGATCAGAGCGATCTCTTTGA
GTCTACTTTGAGTTCGATTGTGTCTTCTCCGGCGAATTCACACGCTGGGGCTGTAATCGGCGGTGGTAGTGGCGGCGGCGACAACTTGATGATGCGAGAATTGATCGGAA
GGCTTGGAAGTATTTGTAGTTCTGGTGAGATTTCGCCTCATTCTTACATTGGTGGGACGAACAATAATAGTACCAATACTTCTTGTTACAATACGCCTTTGAATTCCCCT
CCGATGAAGGGAAATTTATCTGTCGGTCACCATCAAAATCTAGCTCCATTTTCGGCTGATCCAGGTTTAGCTGAAAGGGTTGCGAGATTTTCTTGCTTTGGGAACAAGAA
TCTTGCAGTGAATGGGCAATTGTGTTCTAATGAAACTCAAGAATTGAGCAACAAGTCAATGGCTGGAGCTGGTGTGGAATCTGGCAAGCTTTCTAGGGTTTCAAGTAACA
AATCCTTCAATGTTAGTGGAATTGGATCTCAAATGGGAGTTCAGAAGGGAAATTCTATGGCTAACAAGAAAGTTATGAACAGGTTTTCGAGGTCTTCGACCCCCGAAAAT
GACGATTCGCGGGAGGGATCGTCGGTTTCGGAGCAGATTACAGCTGGGGAATTAGGATTCAAAGTTAACACTAGGAAAAGGAAATCAGCTCATACTGGTGAAGCAAAGAA
TGTGAAGGCTGCAGGGGAGAATCATGAACCAAATGGCAAGAAAATCAAACCAGAGATGGATGCTGCAAAGGGGAAGGCTGAGGCAAAAGATGCAACTCAGAAACAAAACA
ATGATAATTCAAAGCCTCCAGAGCCTCCAAAGGATTATATCCATGTTAGAGCTAAAAGGGGTCAAGCTACAGATAGCCATAGTTTAGCTGAAAGAGTGAGAGCCAAAGCA
CTCATTATCCGACGAGAGAAAATCAGCAAACGGATGAAGTTTCTTCAAGATCTCGTCCCCGGTTGCAATAAGATAACTGGGAAGGCAGTGATGCTTGATGAAATTATAAA
CTATGTTCAATCTTTGCAGCACCAAGTTGAGTTTCTTTCAATGAAATTGGCTACTGTCAATCCAAGGATGGATTTTAACATGGAAACTCTTTTGCCAAAGGATATCTTCA
AAGGTTCGAGTTCGTTACCGCATACGATTTACCCTATTGATTCGTCTGTGCCCACTTTTGCATATGAGTATCAATCTATGAACATTCCTCCTCTTCATAGTGATCAAACG
CAGGGTGGATACCACAAAATGGGGAATGGAATCCAAATTTCCAAGTTTTGGGAGGATGAACTCCACAGTGTAGTTCAGATGGGTTATGTACAAACCCAGCTGCAGAATCC
TCATGGTGAGATGAAAAGTGAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTAATCTGCTCTTCATTTTGAGCCCACGAACTAACGAAGAAATCATTTCATTGTTGTTGCTTCTTTATCTCAAAAATCTCTCCTCGCCATTGTTGTTCTTGTTTTCTTGC
AGAGAAAGATTCTGGGTAGGGTTTTTTTTTGTTCTGTTTTCTGTTGATTTTTTGGTTTTGGCACAGTTCTTCATCGGAAATTTGTGTGATTCTTCGTCGATATGGAGAAG
GAGTTCTTCATGAACGATGGAAGCAGTTTTTATGGGATGGATTCGAGTGTGTTGTTCAATTCCAATTGGGAAAATTCGATGGATCAGAGCGATCTCTTTGAGTCTACTTT
GAGTTCGATTGTGTCTTCTCCGGCGAATTCACACGCTGGGGCTGTAATCGGCGGTGGTAGTGGCGGCGGCGACAACTTGATGATGCGAGAATTGATCGGAAGGCTTGGAA
GTATTTGTAGTTCTGGTGAGATTTCGCCTCATTCTTACATTGGTGGGACGAACAATAATAGTACCAATACTTCTTGTTACAATACGCCTTTGAATTCCCCTCCGATGAAG
GGAAATTTATCTGTCGGTCACCATCAAAATCTAGCTCCATTTTCGGCTGATCCAGGTTTAGCTGAAAGGGTTGCGAGATTTTCTTGCTTTGGGAACAAGAATCTTGCAGT
GAATGGGCAATTGTGTTCTAATGAAACTCAAGAATTGAGCAACAAGTCAATGGCTGGAGCTGGTGTGGAATCTGGCAAGCTTTCTAGGGTTTCAAGTAACAAATCCTTCA
ATGTTAGTGGAATTGGATCTCAAATGGGAGTTCAGAAGGGAAATTCTATGGCTAACAAGAAAGTTATGAACAGGTTTTCGAGGTCTTCGACCCCCGAAAATGACGATTCG
CGGGAGGGATCGTCGGTTTCGGAGCAGATTACAGCTGGGGAATTAGGATTCAAAGTTAACACTAGGAAAAGGAAATCAGCTCATACTGGTGAAGCAAAGAATGTGAAGGC
TGCAGGGGAGAATCATGAACCAAATGGCAAGAAAATCAAACCAGAGATGGATGCTGCAAAGGGGAAGGCTGAGGCAAAAGATGCAACTCAGAAACAAAACAATGATAATT
CAAAGCCTCCAGAGCCTCCAAAGGATTATATCCATGTTAGAGCTAAAAGGGGTCAAGCTACAGATAGCCATAGTTTAGCTGAAAGAGTGAGAGCCAAAGCACTCATTATC
CGACGAGAGAAAATCAGCAAACGGATGAAGTTTCTTCAAGATCTCGTCCCCGGTTGCAATAAGATAACTGGGAAGGCAGTGATGCTTGATGAAATTATAAACTATGTTCA
ATCTTTGCAGCACCAAGTTGAGTTTCTTTCAATGAAATTGGCTACTGTCAATCCAAGGATGGATTTTAACATGGAAACTCTTTTGCCAAAGGATATCTTCAAAGGTTCGA
GTTCGTTACCGCATACGATTTACCCTATTGATTCGTCTGTGCCCACTTTTGCATATGAGTATCAATCTATGAACATTCCTCCTCTTCATAGTGATCAAACGCAGGGTGGA
TACCACAAAATGGGGAATGGAATCCAAATTTCCAAGTTTTGGGAGGATGAACTCCACAGTGTAGTTCAGATGGGTTATGTACAAACCCAGCTGCAGAATCCTCATGGTGA
GATGAAAAGTGAATTGTAAAAGAATGAAAGAACTGGTGAAATCCATGGCGGCCCCCCCACGGCGAGTGAGGCTTTGTGTACATAGAGAGGGATTCCAGTTGCATTTTTTT
GTTGTTTCTGAACATTATGTATCAGCCACTCATTCTTTTGGAGAGCTCTTCAAGAACTAATTGCAAGAACTAATTGCAGCAGCAGCAGCAAAGCTGATGGTGGCCTCAAG
TTTTTATCAGACCACATTTGAATGCTTTTCTCTTTATAGCCATTTGTAAAAGTAGTGTTGGAAAAGACTGAAAAGTTCTGATATCTCAATCCAACCCCCCTGTGTATTAC
CATTACTCATAAATCATAAATCTTATCATTGTTCTTCTCTCACAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKEFFMNDGSSFYGMDSSVLFNSNWENSMDQSDLFESTLSSIVSSPANSHAGAVIGGGSGGGDNLMMRELIGRLGSICSSGEISPHSYIGGTNNNSTNTSCYNTPLNSP
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DDSREGSSVSEQITAGELGFKVNTRKRKSAHTGEAKNVKAAGENHEPNGKKIKPEMDAAKGKAEAKDATQKQNNDNSKPPEPPKDYIHVRAKRGQATDSHSLAERVRAKA
LIIRREKISKRMKFLQDLVPGCNKITGKAVMLDEIINYVQSLQHQVEFLSMKLATVNPRMDFNMETLLPKDIFKGSSSLPHTIYPIDSSVPTFAYEYQSMNIPPLHSDQT
QGGYHKMGNGIQISKFWEDELHSVVQMGYVQTQLQNPHGEMKSEL