CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh06G016090
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	protein TPLATE-like
Genome location	Cmo_Chr06:11259870..11261331
RNA-Seq Expression	CmoCh06G016090
Synteny	CmoCh06G016090
Gene Ontology terms	GO:0006897 - endocytosis (biological process)
InterPro domains	IPR037501 - Protein TPLATE

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6597619.1 Protein TPLATE, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.8e-156

90.71

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKK  SEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH

Query:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

KAG7029060.1 Protein TPLATE [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

7.3e-158

91.33

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH

Query:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

XP_022972293.1 protein TPLATE-like [Cucurbita maxima]

3.2e-153

90.06

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKS  DDDDDDEEDSE EKKKKDSEENGKGPSTLSKL+AEEVEH
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH

Query:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA
        LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA
Subjt:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA

XP_023539878.1 protein TPLATE-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.2e-153

89.51

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLR ELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDD-DDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVE
        ITKEIEADPQGWLDDI DGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDD +D EDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKL+AEEVE
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDD-DDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVE

Query:  HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

XP_038883524.1 protein TPLATE [Benincasa hispida]

3.0e-151

87.31

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDY+GDY+EEDS+IIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSL TKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTM+CKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
        ITKEIEADPQGWLDD+TDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDD+++DD EDSEGE KKKDS+EN KGPSTLSKLTAEEVEH
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH

Query:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LAZ5 Uncharacterized protein

9.6e-148

84.66

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDY+GDYTEEDS+IIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTY YEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLS+KPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGF+GMMIFGASEVSRNVDLGDETTTM+CKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDE---EDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEE
        ITKEIE DPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDD++++++E   E+ EGE+KKK+ +ENGKGPSTLSKLTAEE
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDE---EDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEE

Query:  VEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        VEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  VEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

A0A1S3AYG8 protein TPLATE

1.5e-148

85.8

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDY+GDYTEEDS+IIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSL +KPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTM+CKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDE-EDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVE
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDD+D++++E E  +GE+KKK+ +ENGKGPSTLSKLTAEEVE
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDE-EDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVE

Query:  HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
Subjt:  HLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

A0A6J1GU42 protein TPLATE-like

7.9e-150

87.69

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDY+GDYTEEDS+IIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTY YEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDD-DDDDDDEEDSEGEKKKKDSEE-NGKGPSTLSKLTAEEV
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPP KTPKSDD +D+D+DEED EGEKKKKD EE NGKGPSTLSKLTAEEV
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDD-DDDDDDEEDSEGEKKKKDSEE-NGKGPSTLSKLTAEEV

Query:  EHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        EHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKA+
Subjt:  EHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

A0A6J1I9G6 protein TPLATE-like

1.5e-153

90.06

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKS  DDDDDDEEDSE EKKKKDSEENGKGPSTLSKL+AEEVEH
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEH

Query:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA
        LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA
Subjt:  LALQAAVLQEWHMLCKDRANKA

A0A6J1IWY3 protein TPLATE isoform X1

2.1e-150

87.2

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDY+GDYTEEDS+IIRQKRSLRPELGEPVIL                            SLPAIVE
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTY YEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDD----DDDEEDSEGEKKKKDSEE-NGKGPSTLSKLTA
        ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDD++D    D+DEED EGEKKKKD EE NGKGPSTLSKLTA
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDD----DDDEEDSEGEKKKKDSEE-NGKGPSTLSKLTA

Query:  EEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN
        EEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKA+
Subjt:  EEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

F4J8D3 Protein TPLATE

4.8e-112

66.37

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPV CSVTVGVS FERC  WVQVLYYPF   G  G+YDGDY EED  I++QKR  + ELGEPVIL                            SLPA+ E
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTY YEG+GF ATAAQQYGASPFLSGLKSLS+KPFH VCS+IIRT+AGFQLC AAKTW+GGFVGMMIFGASEVSRN+DLGDETTTM+CKFVVRAS+AS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGE------KKKKDSEE---------NGK
        ITK+IE+D QGW DD+TDGGVEYMPE+EVK  AAE+LKISMERIALLKAAQ P KT K +++ ++++EE+ E E      K+KK+ EE           K
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGE------KKKKDSEE---------NGK

Query:  GPSTLSKLTAEEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDR
           T SKLTAEE EH+ALQAAVLQEWH+LCKDR
Subjt:  GPSTLSKLTAEEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDR

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G01780.1 ARM repeat superfamily protein

3.4e-113

66.37

Show/hide

Query:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE
        DPV CSVTVGVS FERC  WVQVLYYPF   G  G+YDGDY EED  I++QKR  + ELGEPVIL                            SLPA+ E
Subjt:  DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVIL----------------------------SLPAIVE

Query:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS
        YTGTY YEG+GF ATAAQQYGASPFLSGLKSLS+KPFH VCS+IIRT+AGFQLC AAKTW+GGFVGMMIFGASEVSRN+DLGDETTTM+CKFVVRAS+AS
Subjt:  YTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFHSVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDAS

Query:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGE------KKKKDSEE---------NGK
        ITK+IE+D QGW DD+TDGGVEYMPE+EVK  AAE+LKISMERIALLKAAQ P KT K +++ ++++EE+ E E      K+KK+ EE           K
Subjt:  ITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLKAAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGE------KKKKDSEE---------NGK

Query:  GPSTLSKLTAEEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDR
           T SKLTAEE EH+ALQAAVLQEWH+LCKDR
Subjt:  GPSTLSKLTAEEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GATCCAGTTCTGTGCAGTGTGACAGTTGGTGTTTCACATTTTGAGAGATGTGCCCTCTGGGTTCAAGTCTTGTACTACCCCTTCTATGGAAGTGGTGGGGCTGGAGATTA
CGACGGTGATTACACGGAAGAAGACTCTAATATTATCAGACAAAAGAGAAGCTTAAGGCCAGAGCTAGGAGAACCTGTGATTTTGAGCTTACCTGCAATTGTAGAGTATA
CTGGCACTTACACTTATGAGGGAACTGGCTTCAAGGCTACTGCTGCGCAGCAATATGGAGCATCTCCTTTTTTGAGTGGATTGAAATCTTTGTCCACCAAGCCTTTCCAT
AGTGTTTGCTCATATATTATTCGAACTTTGGCAGGGTTTCAGCTTTGTTTGGCTGCAAAAACATGGTACGGGGGGTTTGTGGGCATGATGATATTCGGAGCTAGTGAAGT
AAGCAGAAACGTGGATCTAGGTGATGAGACAACGACCATGATTTGCAAATTCGTTGTCCGAGCATCTGATGCATCAATTACAAAGGAAATTGAAGCCGATCCTCAAGGAT
GGCTAGATGACATAACTGATGGAGGTGTCGAGTACATGCCCGAAGAGGAAGTCAAGGTGGCTGCTGCAGAGAGGCTGAAGATATCAATGGAGCGGATAGCTTTGCTCAAG
GCAGCTCAACCTCCACCAAAAACCCCAAAATCAGACGACGATGACGATGACGATGATGAAGAAGACAGTGAAGGAGAGAAGAAGAAGAAAGATAGTGAGGAAAACGGCAA
GGGACCATCAACGTTGTCGAAATTAACTGCAGAAGAGGTCGAGCACCTTGCACTTCAAGCTGCAGTCCTTCAGGAATGGCACATGTTATGTAAGGATAGAGCGAACAAAG
CTAATTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

DPVLCSVTVGVSHFERCALWVQVLYYPFYGSGGAGDYDGDYTEEDSNIIRQKRSLRPELGEPVILSLPAIVEYTGTYTYEGTGFKATAAQQYGASPFLSGLKSLSTKPFH
SVCSYIIRTLAGFQLCLAAKTWYGGFVGMMIFGASEVSRNVDLGDETTTMICKFVVRASDASITKEIEADPQGWLDDITDGGVEYMPEEEVKVAAAERLKISMERIALLK
AAQPPPKTPKSDDDDDDDDEEDSEGEKKKKDSEENGKGPSTLSKLTAEEVEHLALQAAVLQEWHMLCKDRANKAN

CmoCh06G016090 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome