; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh07G009350 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh07G009350
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRNA polymerase sigma factor
Genome locationCmo_Chr07:4496787..4498395
RNA-Seq ExpressionCmoCh07G009350
SyntenyCmoCh07G009350
Gene Ontology termsGO:0071482 - cellular response to light stimulus (biological process)
GO:2000142 - regulation of DNA-templated transcription, initiation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0016987 - sigma factor activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595231.1 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-3597.5Show/hide
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XP_022143971.1 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic [Momordica charantia]4.3e-1679.31Show/hide
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A0A1S4E3S8 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic isoform X15.7e-1472.41Show/hide
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A0A5A7V893 RNA polymerase sigma factor sigF5.7e-1472.41Show/hide
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A0A5D3CAF4 RNA polymerase sigma factor5.7e-1472.41Show/hide
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A0A6J1CRW8 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic2.1e-1679.31Show/hide
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A0A6J1HG61 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic-like8.1e-45100Show/hide
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Q9LD95 RNA polymerase sigma factor sigF, chloroplastic5.5e-0648.21Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36990.1 RNApolymerase sigma-subunit F3.9e-0748.21Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AAACCTCTCCTTAACAGACGTATTTTAAAATCTTGAGGCTGACGGCTATACGTAACGCGGGCCAAAGCGGATAATATTTGTTAGCGGTGGACTTGAGTTGTTACAAGAAC
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