CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh07G009610
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	Cmo_Chr07:4696174..4698544
RNA-Seq Expression	CmoCh07G009610
Synteny	CmoCh07G009610
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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GenBank top hits

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QJD22341.1 hypothetical chloroplast RF19 [Euphorbia larica]

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QJD22427.1 hypothetical chloroplast RF19 [Euphorbia smithii]

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QXP99976.1 Ycf1 [Artocarpus tonkinensis]

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YP_009176062.1 hypothetical chloroplast ycf1 [Ficus racemosa]

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A0A0N9YL66 Protein TIC 214

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A0A346QN17 Protein TIC 214

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A0A6M3RIT1 Protein TIC 214

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A0A6M3RJ47 Protein TIC 214

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SwissProt top hits

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A4GYX4 Protein TIC 214

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Q09WW0 Protein TIC 214

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Q0G9Q4 Protein TIC 214

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Q14FA0 Protein TIC 214

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Q68RU8 Protein TIC 214

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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT2G07739.1 Ycf1 protein

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ATCG01130.1 Ycf1 protein

3.3e-106

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        SIRSN      + KFL+
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ATMG00370.1 Ycf1 protein

3.0e-83

86.17

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Subjt:  LLFH-FFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKW

Sequences

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ATGTTGGGAATTGGTTATGAGAATCATACACGGCGTCAGCGAACTGACTTTCTTGCTTGCTTGCTCGGGCTCCCGCCCCTCTCCTTTCCAGTCGAGCTTCTTCGCCCCTT
CCCCGTAGGGTCTCAGAGCTCCGCCCCTTCACCTCCTCCTAAGCCTCAAGCAAGACAAGATGAGAGTTTACAGTCTTTGAATAAGGTCAAGCTCCGGAGCCTCTATTCAT
TCCCTGAAGCGGAACAAAGACACAGGGAACGGAATTGTGAGACCGACAGAAATTGCAATAGAAAAGAAAAAGGGAGGTTTGTGATGATTTTAAAATCTTTTATACTAGGT
AATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCG
AGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAG
CATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAAC
TCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTC
TATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTAGTCTGGATAC
AGCAAAATAATTCTATTAGATCTAATAAGTACCGGACAAAGTTTCTCATAATATGA

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NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRN
SMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNKYRTKFLII

CmoCh07G009610 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome