; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh07G010660 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh07G010660
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptioncopper ion transmembrane transporters
Genome locationCmo_Chr07:5444300..5445550
RNA-Seq ExpressionCmoCh07G010660
SyntenyCmoCh07G010660
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595352.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-19990.14Show/hide
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KAG7027360.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-22498.56Show/hide
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XP_022966589.1 uncharacterized protein LOC111466226 [Cucurbita maxima]2.8e-21695.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BKN8 uncharacterized protein LOC1034906412.1e-12462.95Show/hide
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A0A5A7TP38 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 332.1e-12462.95Show/hide
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A0A6J1DBJ9 uncharacterized protein LOC1110194831.7e-12663.77Show/hide
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        E D +T RRSSNR  R GSVSE E +S   D YP ++  PSSSNG KGKTY+G+FRNR  GRNL+SSK   S  S                         
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A0A6J1F003 uncharacterized protein LOC1114381635.9e-228100Show/hide
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A0A6J1HU81 uncharacterized protein LOC1114662261.4e-21695.43Show/hide
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        LRSGSVSEGEANSDYSDT++YY KSSMVPSSSNNGRKF  R+NGR+LESSKRELNSGQIGLDRRQRVPSPQMHNGNRQYGKGKDSRRSKGSYSEVYDMSL
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Query:  EQDGSYRFKLMKTQSN
        EQDGSYRFK MKT+SN
Subjt:  EQDGSYRFKLMKTQSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80792 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 339.1e-1644Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +    +   +  +   S   +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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Q6K7R9 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 486.1e-1239.81Show/hide
Query:  MGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAVSQLERPWEVVEKAPSLFSVGADE---------QVKVLADRFQRPGGFD
        MGGGPRT+PGG+SKWQ KRM  K A+   +  L  E+Q+Y  R R+E++A+            + P+  +   D+          ++ LADRF  PG  D
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Query:  LWTEKDGP
        LW E DGP
Subjt:  LWTEKDGP

Q9C8S9 Probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 487.0e-1644Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +    +   +  +   S   +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G63250.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein4.9e-1744Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +    +   +  +   S   +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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AT2G07750.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein6.5e-1744Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +    +   +  +   S   +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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AT2G37920.1 copper ion transmembrane transporters2.7e-6367.55Show/hide
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        T  + +TVIRMGGGPRT+PGGVSKWQWKRMQAKK KQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAV++LERPWE + K P+LFSV ADEQVKVLADRFQ+PGGF
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Query:  DLWTEKDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRSSNRKSRIGSVSEEEANSN
        DLWT++DGPQLFE+VD+LPSARFFPKGVVHSVKPY  +     SSS   +DG+E     +E   K   R   ++   G     E   N
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAATTTTCCCAATCTCACTCGCAATTTCAAACCCTCCTCGACCACCGCCGTTATTCTCTTTCTCTCAGTCCATAACTGGTTCAAACCGCCTTTTGTACCTTCCCAA
TGGGATACGGACCGCTACGAAGATCACGACGGTTATTCGAATGGGTGGAGGTCCAAGAACTTATCCAGGCGGAGTGTCGAAGTGGCAGTGGAAGCGGATGCAGGCTAAGA
AAGCTAAGCAGTTGCTCAAGGCCCGGTTGTGTCGCGAACGCCAGATATATGAGATGCGTAAGCGGGCTGAACTTAAGGCGGCTGTGTCCCAGTTGGAGAGGCCGTGGGAG
GTTGTGGAGAAGGCTCCCAGTTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAACAGGTGAAGGTTTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTCGATTTGTGGACGGAAAAAGA
TGGGCCTCAATTGTTTGAGACGGTTGATGAACTGCCTTCCGCAAGGTTTTTCCCGAAAGGGGTGGTTCACAGTGTAAAGCCGTACAGAAGTATAACAGGGTCGGAGGGTT
CTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGATGATTTAAAGACTCCCCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATCAAGAATTGGGTCAGTG
AGTGAAGAAGAAGCTAATTCAAATTACTCTGATTATTATCCGAGGAGTTCCTCGGTTCCATCAAGTAGCAATGGTCAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCAGGAA
TCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTCCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGAATTGAAACCAGTTTTCAAGTAGATGATTTTAATACTCACC
GGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTACTCGGATACAGATAATTATTATCAGAAGAGTTCTATGGTACCATCA
AGTAGTAATAATGGTCGTAAATTCAGATATCGGGATAATGGAAGAAGCCTCGAGTCTTCTAAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGT
TCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCGAGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGATATGAGTTTGGAGCAGGATG
GGAGTTACAGATTCAAACTGATGAAAACTCAGTCGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTTGTGGAGAAGGCTCCCAGTTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAACAGGTGAAGGTTTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTCGATTTGTGGACGGAAAAAGA
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CTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGATGATTTAAAGACTCCCCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATCAAGAATTGGGTCAGTG
AGTGAAGAAGAAGCTAATTCAAATTACTCTGATTATTATCCGAGGAGTTCCTCGGTTCCATCAAGTAGCAATGGTCAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCAGGAA
TCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTCCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGAATTGAAACCAGTTTTCAAGTAGATGATTTTAATACTCACC
GGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTACTCGGATACAGATAATTATTATCAGAAGAGTTCTATGGTACCATCA
AGTAGTAATAATGGTCGTAAATTCAGATATCGGGATAATGGAAGAAGCCTCGAGTCTTCTAAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGT
TCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCGAGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGATATGAGTTTGGAGCAGGATG
GGAGTTACAGATTCAAACTGATGAAAACTCAGTCGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPIFPISLAISNPPRPPPLFSFSQSITGSNRLLYLPNGIRTATKITTVIRMGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAVSQLERPWE
VVEKAPSLFSVGADEQVKVLADRFQRPGGFDLWTEKDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRSSNRKSRIGSV
SEEEANSNYSDYYPRSSSVPSSSNGQKGKTYEGKFRNREKGRNLQSSKRSPSLGSEAGNGIETSFQVDDFNTHRRSSNRKLRSGSVSEGEANSDYSDTDNYYQKSSMVPS
SSNNGRKFRYRDNGRSLESSKRELNSGQIGLDRRQRVPSPQMHNGNRQYGKGKDSRRSKGSYSEVYDMSLEQDGSYRFKLMKTQSN