CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh07G011060
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	protein N-terminal and lysine N-methyltransferase efm7
Genome location	Cmo_Chr07:5795968..5800124
RNA-Seq Expression	CmoCh07G011060
Synteny	CmoCh07G011060
Gene Ontology terms	GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR019410 - Lysine methyltransferase IPR029063 - S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6595391.1 Vacuolar cation/proton exchanger 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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Arabidopsis top hits

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AT5G01470.2 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein

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        DNI +NC  N I P+LPHIKHTWG+ FPIS+PDWDL+IASDILLYVKQY NLIK+L++LL  Y           + +     L +P+F+MSWRRRIGK+D
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Query:  ELLFFSGCENAGLEVKHLGSRVYCIQ
        E LFF+GCE AGLEVKHLG+RVYCI+
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AT5G01470.3 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein

6.1e-79

49.08

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        MDIALFSP+SLF  + +SS+ E T+ET Q++ ER HQFPG+                EL IREF FH+LNANLLWPGTFAFA+WL+Q+   I  R+C+E+
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Query:  GRYNYSIAWAVSKVLKSNRSTLEYHILVCQFLPMINFSSAHFHLENWHLFNYILLQKLGHIDIYKSSKLKEIGTGSLAIFLRKSFNLDVTTSDYDDQEIE
        G                                                                       GTG+LAIFL+K FNLD+TTSDY+DQEIE
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        DNI +NC  N I P+LPHIKHTWG+ FPIS+PDWDL+IASDILLYVKQY NLIK+L++LL  Y    K   + S  ++    L +P+F+MSWRRRIGK+D
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        E LFF+GCE AGLEVKHLG+RVYCI+
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Sequences

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TCTGGCCGGGGACATTTGCATTTGCAGAATGGTTGGTTCAAAACCCGTCTTGGATTCGAGGACGAAAATGCATTGAATTGGGAAGGTACAATTATTCAATCGCTTGGGCA
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GCACTTGTTCAATTACATATTACTTCAAAAGCTTGGCCATATAGACATTTATAAATCAAGTAAATTAAAAGAAATTGGCACTGGTTCGTTGGCGATATTTCTACGAAAGT
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GTATCTTCTCATGTCGTACAATTACAAGCGAAAGTGCGACAAAATGGCTTCTCAAAACGACGAGGGTGGTGAATCCTTGGCGAAGCCAATGTTTGTAATGAGCTGGAGGC
GCAGAATTGGAAAGGAGGATGAACTGCTGTTCTTCAGTGGCTGTGAAAATGCAGGTCTTGAAGTAAAACATTTGGGGTCCCGCGTCTATTGCATCCAATCTATCAAGTAA

mRNA sequence

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TCGTAAATGGCAATCCAATTGAATTTGAGTCACGTTTGATGGTTCACGAAGCAGTAAATTCGAGCTCCATTGATTTCGCTTGCGCCGCTCAGCCATACATAGCTTCATTC
TGTGCCTTCAATTCTGCATCTCTCTGCAAATTGCAAGAAGGAAATGGACATAGCTCTGTTTTCTCCGTCGTCGCTTTTCCCCGACGAGGACGAATCGTCTAATGATGAGG
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ATTATTCGAGAGTTTTCATTTCATGAGCTGAATGCAAATTTGCTCTGGCCGGGGACATTTGCATTTGCAGAATGGTTGGTTCAAAACCCGTCTTGGATTCGAGGACGAAA
ATGCATTGAATTGGGAAGGTACAATTATTCAATCGCTTGGGCAGTTAGCAAAGTTTTAAAATCCAATAGATCAACTTTGGAATATCATATTTTAGTATGTCAGTTCTTAC
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AAAGAAATTGGCACTGGTTCGTTGGCGATATTTCTACGAAAGTCATTTAATCTTGATGTTACAACATCGGACTATGATGATCAGGAAATTGAAGACAACATCGCCTATAA
TTGCAGTGTGAATGGAATTGCACCGGCCCTTCCTCACATAAAGCATACATGGGGAGAGAACTTTCCAATTAGTGATCCTGACTGGGATCTTGTCATTGCCAGCGATATTT
TATTGTATGTGAAACAGTATCAAAACTTGATAAAAACGCTATCGTATCTTCTCATGTCGTACAATTACAAGCGAAAGTGCGACAAAATGGCTTCTCAAAACGACGAGGGT
GGTGAATCCTTGGCGAAGCCAATGTTTGTAATGAGCTGGAGGCGCAGAATTGGAAAGGAGGATGAACTGCTGTTCTTCAGTGGCTGTGAAAATGCAGGTCTTGAAGTAAA
ACATTTGGGGTCCCGCGTCTATTGCATCCAATCTATCAAGTAAAATTTTTATCGTTATGTTAGTAATTACATTTGTAATAGTTAAACATGTTGGTTAATATTAGGAAGTT
ACTGAGAAACTATGCTGTTTTCTTACTTAAATTATCTCTCATACTTCTATTAAATTAGAAGTTTAGTAATTGAACTTTCAAATTTGTCG

Protein sequence

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VSKVLKSNRSTLEYHILVCQFLPMINFSSAHFHLENWHLFNYILLQKLGHIDIYKSSKLKEIGTGSLAIFLRKSFNLDVTTSDYDDQEIEDNIAYNCSVNGIAPALPHIK
HTWGENFPISDPDWDLVIASDILLYVKQYQNLIKTLSYLLMSYNYKRKCDKMASQNDEGGESLAKPMFVMSWRRRIGKEDELLFFSGCENAGLEVKHLGSRVYCIQSIK

CmoCh07G011060 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome