; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G000190 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G000190
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationCmo_Chr08:98637..100328
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G000190
SyntenyCmoCh08G000190
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025226.1 hypothetical protein SDJN02_11721 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-8993.55Show/hide
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XP_022959638.1 uncharacterized protein LOC111460657 isoform X2 [Cucurbita moschata]7.9e-9496.76Show/hide
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XP_023004850.1 uncharacterized protein LOC111498029 isoform X1 [Cucurbita maxima]5.5e-8789.95Show/hide
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XP_023514680.1 uncharacterized protein LOC111778908 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-8889.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557802.4e-6471.29Show/hide
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A0A6J1H536 uncharacterized protein LOC111460657 isoform X11.0e-99100Show/hide
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A0A6J1H6I7 uncharacterized protein LOC111460657 isoform X23.8e-9496.76Show/hide
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A0A6J1KTA1 small acidic protein-like isoform X21.5e-8287.3Show/hide
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A0A6J1KVR6 uncharacterized protein LOC111498029 isoform X12.7e-8789.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein3.9e-2241.94Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)3.9e-3046.63Show/hide
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AT2G33510.2 unknown protein6.0e-3145.05Show/hide
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         H
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTGGACCACGAACAACGTCATCATCAGCTCCACACTACCTTGGACCTCAACTCTCACATCTCCCTCCCTCCTTTCTGGGAACAATGCCTCCATTTGAAGTTCCGTTCGG
TCTTCCAGACAGGGGAAGTCTACTACACAAACTGCCGGACCGGAATGAGAGTAAAGGAAGATCCGAGGATGGCGAAAGATTTATACTCCGAAGACGACGACGATGATGAC
GAGAGCTCCTCGGACGAGGGCAGCGAGGAATCGTGTTCTTCGTCATCTTACAGCGGTAGTAGACAGCAATACCCGAGGGAAAACGAGGAGGAGGTGCTGGTGGTGGCGGG
ATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTCGAAGGTTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGGACCCACGACAATAATGGCT
TCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCAACAACTCCCACGCGCACCTTCACTTCCTTTGCTTTTGCTCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTAAAAGAATTACGATTCCACTCCCTCGTCTTCCAATAATA
TGCCCTTTCTTCTTCTTCTTCCTTCTTATTCGCCATGAAATCTCCCGATACGGCGGCGACTACCCATTCTCTCCAGCACTCTTTCCGCACCTTCTCCCTCAACCACCGTC
TCGCATCTTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCTTTCTTGGACCACGAACAACGTCATCATCAGCTCCACACTACCTTGGACCTCAACTCTCACATCTCCCTCCCTCCTTTC
TGGGAACAATGCCTCCATTTGAAGTTCCGTTCGGTCTTCCAGACAGGGGAAGTCTACTACACAAACTGCCGGACCGGAATGAGAGTAAAGGAAGATCCGAGGATGGCGAA
AGATTTATACTCCGAAGACGACGACGATGATGACGAGAGCTCCTCGGACGAGGGCAGCGAGGAATCGTGTTCTTCGTCATCTTACAGCGGTAGTAGACAGCAATACCCGA
GGGAAAACGAGGAGGAGGTGCTGGTGGTGGCGGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTCGAAGGTTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTT
GTTCATTTCGATCGGACCCACGACAATAATGGCTTCCCATGACAAGGAACCATATATATTTGTGAAAAAGAAAATCAAACTGTAATTGGGTTATATGACCTGACAAAAAA
TACTTGATTCTTTTCCTTGGGGTTAAAAGCAAATGGGGTTTGAATTTTTCTTGTGCTCTAGCTCGCGTCATGTCCAGGATGTGTATGATGTCTCAGTGTGTGTTGATGCG
TATGGATTGAAAAGTTGGATTAATTGAGAAGAGAAAGAAAGAGAATCTCTGGCATGGGCTGCCATGGATATGCCTGAGAGAGGTACGAAAAAATGTGCAGGTCTGAATGG
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CTTTTTTTAATTTTTTTTATGGGTAGACTGTGATTATATAATGGAAATGAATATGAAGTGGTTTAAAATACATACAGACATCAATAAAGCTCAACCCTTTTTGTTATGTG
GGTAACTAATCAACATTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSPDTAATTHSLQHSFRTFSLNHRLASSSSSSSSSFLDHEQRHHQLHTTLDLNSHISLPPFWEQCLHLKFRSVFQTGEVYYTNCRTGMRVKEDPRMAKDLYSEDDDDDD
ESSSDEGSEESCSSSSYSGSRQQYPRENEEEVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEGCPKCSSSRLVHFDRTHDNNGFP