| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6592929.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.2e-185 | 99.14 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Query: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Subjt: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Query: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
ASAHESDRVVQISGDV AVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Subjt: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Query: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| XP_022960112.1 flowering locus K homology domain-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.0e-187 | 100 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Query: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Subjt: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Query: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Subjt: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Query: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| XP_022960113.1 flowering locus K homology domain-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 2.8e-188 | 100 | Show/hide |
Query: MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
Subjt: MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
Query: DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
Subjt: DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
Query: CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Subjt: CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Query: VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| XP_023005037.1 poly(rC)-binding protein 4-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 9.2e-184 | 97.46 | Show/hide |
Query: MSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
MSGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDV APKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
Subjt: MSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
Query: IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
Subjt: IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
Query: QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
Subjt: QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
Query: ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| XP_023514318.1 poly(rC)-binding protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.0e-183 | 97.46 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
SGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIV PSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Query: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANT+RLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Subjt: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Query: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Subjt: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Query: TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1H4F3 flowering locus K homology domain-like | 2.9e-175 | 93.48 | Show/hide |
Query: GDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIK
GDIP+YPSMPA APL PLPGT+LVS SGH VTGKRRREDD IVS SEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRI+VPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIK
Subjt: GDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIK
Query: IADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQL
IADAVARYEERVIIISSKD EN+VTDAE ALQ IAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGA++TILAPNQL
Subjt: IADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQL
Query: PLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGAT
PLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSY+DPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGAT
Subjt: PLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGAT
Query: IKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
IKVCGGRGEQNYRQ+QFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQL+RQAGVQ TALQMW
Subjt: IKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| A0A6J1H6G7 flowering locus K homology domain-like isoform X1 | 5.1e-188 | 100 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIAD
Query: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Subjt: AVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLC
Query: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Subjt: ASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
Query: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: CGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| A0A6J1H7W9 flowering locus K homology domain-like isoform X2 | 1.3e-188 | 100 | Show/hide |
Query: MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
Subjt: MSGDIPVYPSMPAKAPLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIA
Query: DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
Subjt: DAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPL
Query: CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Subjt: CASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIK
Query: VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: VCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| A0A6J1KS32 poly(RC)-binding protein 4-like isoform X2 | 4.4e-184 | 97.46 | Show/hide |
Query: MSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
MSGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDV APKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
Subjt: MSGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKAT
Query: IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
Subjt: IKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPN
Query: QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
Subjt: QLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESG
Query: ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: ATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| A0A6J1KTT5 poly(RC)-binding protein 4-like isoform X1 | 1.7e-183 | 97.46 | Show/hide |
Query: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
SGDIPVYPSMPAKAPL PLPGTVLVSK GHAVTGKRRREDDPIV YSEAVDV APKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Subjt: SGDIPVYPSMPAKAPL----PLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATI
Query: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAE ALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Subjt: KIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQ
Query: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA+HPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Subjt: LPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNAIHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGA
Query: TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
Subjt: TIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQLMRQAGVQPTALQMW
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P57721 Poly(rC)-binding protein 3 | 1.8e-12 | 23.96 | Show/hide |
Query: APLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIIS
AP LP + L + S H RR + + V ++ R+++ K++G +IGK G ++K+REE+ A I I++ ER++ I+
Subjt: APLPLPGTVLVSKSGHAVTGKRRREDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKAHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIIS
Query: SKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQIS
TDA + A +ED + T T+RL++ SQ GSLIG G I+++R S+GA V + A + LP + ++R V IS
Subjt: SKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQIS
Query: GDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR--------------------QVISVSPTY------NYNAIH---------PPQSYMDP-------------------
G A+++ +++I + +PP+ Q ++ Y +H PP +P
Subjt: GDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR--------------------QVISVSPTY------NYNAIH---------PPQSYMDP-------------------
Query: -------TSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQL
S T E+ I L+G +IG G I+ IR SGA IK+ + RQ+ G+ ++LA+ ++ + S++
Subjt: -------TSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQRVDEYIYSQL
|
|
| P57723 Poly(rC)-binding protein 4 | 7.9e-13 | 24.69 | Show/hide |
Query: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
R+++ K++G +IGK G ++++RE++ A I I++ S ++ T+T + A+ ++I + + G+V+ T+RL+I
Subjt: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
Query: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
SQ GSLIG +G I+++R ++GA V + A + LP + ++R V +SG A++ + +I + +PP+ I P+ +
Subjt: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
Query: -YNAIHPPQ-SYMDPTSVNYVTF------------------EMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQ
Y A+ P + + + S + V F E L+ L+G +IG G IS IR SGA IK+ R + GS +ALA+
Subjt: -YNAIHPPQ-SYMDPTSVNYVTF------------------EMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAKQ
Query: RVDEYIYSQLMRQAGVQPTA
+ + + G +A
Subjt: RVDEYIYSQLMRQAGVQPTA
|
|
| P57724 Poly(rC)-binding protein 4 | 1.0e-12 | 26 | Show/hide |
Query: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
R+++ K++G +IGK G ++++RE++ A I I++ S ++ T+T + A+ ++I + + G V+ T+RL+I
Subjt: RIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAAN--TIRLLIA
Query: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
SQ GSLIG +G I+++R ++GA V + A + LP + ++R V +SG A++ + +I + +PP+ I P+ +
Subjt: GSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN----------------
Query: -YNAIHPPQ--------------------SYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAK
Y A+ P + MDP S + E L+ L+G +IG G IS IR SGA IK+ R + GS +ALA+
Subjt: -YNAIHPPQ--------------------SYMDPTSVNYVTFEMLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQNYRQLQFGGSAEQVALAK
|
|
| Q9SR13 Flowering locus K homology domain | 2.9e-15 | 30.58 | Show/hide |
Query: EDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKA-----------HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDK-ENTVTDAE
+++ I + E++ S P+ A + +FR++VP++++G +IG+ G I+K+ EET+A IKI D ER +++S K++ E+++ +
Subjt: EDDPIVSYSEAVDVSAPKRQAKA-----------HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDK-ENTVTDAE
Query: IALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEE
L ++ I+ DG E + + RLL+ SQAGSLIG G ++ ++ +S V +L LP+ A + DRVV++ G+ +V +ALE
Subjt: IALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEE
Query: IGNQLR
I + LR
Subjt: IGNQLR
|
|
| Q9SZH4 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER | 2.6e-16 | 32.75 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDG-TSIEELKVGTGHVAANTIRL
D +FR++VP ++G +IG+ G I+K+ EET+A IK+ D +R+++IS K++ A+ + + + G ++ V +++RL
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKENTVTDAEIALQQIAALILKEDG-TSIEELKVGTGHVAANTIRL
Query: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
L+A +QA +LIG G I+ + +SGASV IL+ + P A+ + +R+V + G+ +LKALE I LR
Subjt: LIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G14170.1 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.5e-19 | 29.26 | Show/hide |
Query: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
+ D ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
Query: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
Query: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V
Subjt: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| AT1G14170.2 RNA-binding KH domain-containing protein | 2.4e-20 | 29.74 | Show/hide |
Query: HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELKV
HD ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: HDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELKV
Query: GTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYNY
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: GTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYNY
Query: NAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V
Subjt: NAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| AT1G14170.3 RNA-binding KH domain-containing protein | 1.5e-19 | 29.26 | Show/hide |
Query: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
+ D ++R + P K+ G +IGK G +++R ETK+ ++I +A+ EERV+ + S ++E + D E+ + AL ++DGT +
Subjt: AHDVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSKDKE--NTVTDAEIALQQIAALIL----------KEDGTSIEELK
Query: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
G T+R+L+ Q G +IG GQ I+ LRN + A + ++ + LP CA D ++ I G+ V +AL ++ + L NP R Q + +S +
Subjt: VGTGHVAANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPR-QVISVSPTYN
Query: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
+++H P + + ++ NY + VGG+IG GG I++IR E+GATI+V
Subjt: YNAIHPPQSYMDPTSV-----NYVTFE-----------MLISETLVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKV
|
|
| AT5G15270.1 RNA-binding KH domain-containing protein | 3.0e-23 | 31.14 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
D +FR + P K+IG VIG+ G ++++R +T++ I+I +A+ +ERVI I S D E ++ A+ AL +I ++ +D S E+ G V
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
Query: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
T +LL+ Q G ++G GQ ++ +R+ +GA + I+ +PLCA SD ++QISG+V V KAL +I ++L NP R +S + Y A
Subjt: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
Query: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQN
PP++ DP + + F L+S + +IG GG I+++R E+ ATIKV R E N
Subjt: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQN
|
|
| AT5G15270.2 RNA-binding KH domain-containing protein | 3.0e-23 | 31.14 | Show/hide |
Query: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
D +FR + P K+IG VIG+ G ++++R +T++ I+I +A+ +ERVI I S D E ++ A+ AL +I ++ +D S E+ G V
Subjt: DVLFRIVVPSKQIGKVIGKVGCRIQKVREETKATIKIADAVARYEERVIIISSK--------DKENTVTDAEIALQQIAALILKEDGTSIEELKVGTGHV
Query: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
T +LL+ Q G ++G GQ ++ +R+ +GA + I+ +PLCA SD ++QISG+V V KAL +I ++L NP R +S + Y A
Subjt: AANTIRLLIAGSQAGSLIGASGQNIEKLRNSSGASVTILAPNQLPLCASAHESDRVVQISGDVPAVLKALEEIGNQLRVNPPRQVISVSPTYNYNA----
Query: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQN
PP++ DP + + F L+S + +IG GG I+++R E+ ATIKV R E N
Subjt: -----------------------------IHPPQSYMDPTSVNYVTFEMLISET-LVGGLIGIGGFNISRIRNESGATIKVCGGRGEQN
|
|