CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh08G003790
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Shikimate_dh_N domain-containing protein
Genome location	Cmo_Chr08:2356962..2359313
RNA-Seq Expression	CmoCh08G003790
Synteny	CmoCh08G003790
Gene Ontology terms	GO:0003855 - 3-dehydroquinate dehydratase activity (molecular function) GO:0004764 - shikimate 3-dehydrogenase (NADP+) activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7025555.1 hypothetical protein SDJN02_12051 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.1e-91

97.24

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKRA+NFRASSP ILPCNV L+RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_022150155.1 uncharacterized protein LOC111018405 [Momordica charantia]

1.8e-74

80.77

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P+SRHVS++NSS F SDF V FT+ KRA+NFRAS PQIL  N +   + TPRSY RYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEIS+VAA SYYNSLLEKRT+L DILL MARELESISYKESFHGAF SANAAVNLIAQ+IELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_022959936.1 uncharacterized protein LOC111460840 [Cucurbita moschata]

3.5e-94

100

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_023004672.1 uncharacterized protein LOC111497897 [Cucurbita maxima]

1.5e-92

98.34

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKR MNFRASSPQILPCNV LERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

XP_023515033.1 uncharacterized protein LOC111779179 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.3e-93

99.45

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BS97 uncharacterized protein LOC103492727

5.8e-71

79.67

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSSAFS  F  QF+SRKRA+NF    PQ L  N     + T RSYIR GPPYG++DDDPE +VESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+K T+L +ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A5D3D403 Uncharacterized protein

5.8e-71

79.67

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P S+HVSITNSSAFS  F  QF+SRKRA+NF    PQ L  N     + T RSYIR GPPYG++DDDPE +VESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLL+K T+L +ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1D9Y8 uncharacterized protein LOC111018405

8.7e-75

80.77

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P+SRHVS++NSS F SDF V FT+ KRA+NFRAS PQIL  N +   + TPRSY RYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLE-RLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEIS+VAA SYYNSLLEKRT+L DILL MARELESISYKESFHGAF SANAAVNLIAQ+IELS
Subjt:  LRVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1H695 uncharacterized protein LOC111460840

1.7e-94

100

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

A0A6J1KR31 uncharacterized protein LOC111497897

7.1e-93

98.34

Show/hide

Query:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
        MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDF VQFTSRKR MNFRASSPQILPCNV LERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL
Subjt:  MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWL

Query:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
        RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS
Subjt:  RVTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G03150.1 unknown protein

8.1e-41

51.69

Show/hide

Query:  VPSSRHVSITNSSAFSSDFK---VQF--TSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLR
        V  S  +S+T    F +  +   V F  T R+R+++F  +S    P    L+    +S I  G      ++D E  V++L +P+ W +PS+A+EESEWLR
Subjt:  VPSSRHVSITNSSAFSSDFK---VQF--TSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLR

Query:  VTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE
        VTLHKWLD+EYCPE TNVEIS+VAAKSYY+SLLEK +++ +ILL MA++L SISY+ESFHGAF+SANAA+NLI  RIE
Subjt:  VTLHKWLDEEYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGTCTCTGATTTTGGTTCCATCTAGTAGGCACGTTTCAATCACCAATTCTTCTGCGTTTTCCTCCGATTTTAAAGTTCAATTCACTTCTAGAAAGCGCGCCATGAA
CTTCCGAGCTTCTTCTCCGCAGATTCTCCCTTGCAATGTCGTTCTGGAGCGATTAACTCCGAGGTCTTATATTCGTTACGGGCCACCGTATGGTGATCAAGATGACGATC
CTGAAGAGCAGGTTGAAAGCCTCAGGGTTCCTGATGCTTGGTCGGTCCCTTCCAAGGCATTGGAGGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCCTGCACAAATGGCTGGACGAA
GAGTACTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAGGTTGCTGCAAAATCGTACTACAATTCTTTGTTAGAGAAGAGGACAGAGCTAGCCGATATTTTATTGAACAT
GGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCATATAAGGAAAGTTTTCATGGTGCATTCTCTTCTGCCAATGCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAAAGAATAGAGCTGTCTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATCCACACATCTCCATCCCGCCTGCCATCAACTGGTTGGGATCTCGGAGAATCACAGAAAACAGAACGAAAATGGAGTCTCTGATTTTGGTTCCATCTAGTAGGCACGTT
TCAATCACCAATTCTTCTGCGTTTTCCTCCGATTTTAAAGTTCAATTCACTTCTAGAAAGCGCGCCATGAACTTCCGAGCTTCTTCTCCGCAGATTCTCCCTTGCAATGT
CGTTCTGGAGCGATTAACTCCGAGGTCTTATATTCGTTACGGGCCACCGTATGGTGATCAAGATGACGATCCTGAAGAGCAGGTTGAAAGCCTCAGGGTTCCTGATGCTT
GGTCGGTCCCTTCCAAGGCATTGGAGGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCCTGCACAAATGGCTGGACGAAGAGTACTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAG
GTTGCTGCAAAATCGTACTACAATTCTTTGTTAGAGAAGAGGACAGAGCTAGCCGATATTTTATTGAACATGGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCATATAAGGAAAGTTT
TCATGGTGCATTCTCTTCTGCCAATGCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAAAGAATAGAGCTGTCTTAACTGTTCATCCCCTTCATTTTTCAAAATCCTGCAAGTTTGGCTC
CAAGACCTCAACTCTTGCTCTGAAAGGCATAGCACTTTCAGAAATGCGTTCAAGTGGTGGCTCGAAGGCAAAGCTAGAATTTGTAAGTACTATTAGCTAAGGCATCTATT
TGGTCCTTCAAAGATACTCGAGTAGGTTTTTTAAGTCTTTTGAGGAGGATTGAATCTATGATATTTTGATTAATGAGTTGTGGTATGGTTAAGCTAGCACAACCTCGAAT
TAGAGCACCAATCTTAGGGACGGTAAGTACAACAACAAACTTGGATTGGAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MESLILVPSSRHVSITNSSAFSSDFKVQFTSRKRAMNFRASSPQILPCNVVLERLTPRSYIRYGPPYGDQDDDPEEQVESLRVPDAWSVPSKALEESEWLRVTLHKWLDE
EYCPEETNVEISKVAAKSYYNSLLEKRTELADILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIELS

CmoCh08G003790 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome