; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G004070 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G004070
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionheat shock factor-binding protein 1-like
Genome locationCmo_Chr08:2510836..2514823
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G004070
SyntenyCmoCh08G004070
Gene Ontology termsGO:0045892 - negative regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0070370 - cellular heat acclimation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003714 - transcription corepressor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009643 - Heat shock factor binding 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593188.1 Heat shock factor-binding protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.1e-3798.85Show/hide
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XP_004136040.1 heat shock factor-binding protein isoform X2 [Cucumis sativus]2.8e-3393.26Show/hide
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XP_008451602.1 PREDICTED: heat shock factor-binding protein 1 [Cucumis melo]1.6e-3393.26Show/hide
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XP_022150885.1 heat shock factor-binding protein 1 [Momordica charantia]1.6e-3393.26Show/hide
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XP_022960363.1 heat shock factor-binding protein 1-like [Cucurbita moschata]2.5e-37100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BSN9 heat shock factor-binding protein 18.0e-3493.26Show/hide
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A0A6J1D9Q0 heat shock factor-binding protein 18.0e-3493.26Show/hide
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A0A6J1H8P3 heat shock factor-binding protein 1-like1.2e-37100Show/hide
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A0A6J1JVW1 heat shock factor-binding protein 1-like isoform X26.7e-3391.01Show/hide
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A0A6J1KVD3 heat shock factor-binding protein 1-like1.2e-37100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75506 Heat shock factor-binding protein 11.3e-0954.1Show/hide
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Q3ZC22 Heat shock factor-binding protein 11.3e-0954.1Show/hide
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Q5RDI2 Heat shock factor-binding protein 11.3e-0954.1Show/hide
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Q8GW48 Heat shock factor-binding protein5.7e-2978.16Show/hide
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Q9CQZ1 Heat shock factor-binding protein 11.1e-0850.82Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G15802.1 heat shock factor binding protein4.0e-3078.16Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGACACGACTCCGAAGATGCAAAACAAAGCACAGCTGATATGACTGTTTTTGTGCAAAATCTTCTTCAACAGATGCAATCAAGGTTCCAAACCATGTCTGACTC
CATTATCACAAAGATTGATGAGATGGGAAGCCGCATAAATGAATTGGAGCAGAGCATCAACGACCTAAAAGCTGAGATGGGCGTGGAGGGTTCGCCGTTGCCTCCGTCCA
AGACGAATGCCGATGAATCGAAGAAAGACGAAGGTTCTGCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAAAAAAGGAAGCCATTCGCTATATTCTACGTCCCGCATTCTTCCCCCGCGAACTGGACGATTGGGCACCGCGAGTTTCAGCATCTCCCGATTGTCTCTTGAAGATCC
ACTCTTGCGGAAATGGATGGACACGACTCCGAAGATGCAAAACAAAGCACAGCTGATATGACTGTTTTTGTGCAAAATCTTCTTCAACAGATGCAATCAAGGTTCCAAAC
CATGTCTGACTCCATTATCACAAAGATTGATGAGATGGGAAGCCGCATAAATGAATTGGAGCAGAGCATCAACGACCTAAAAGCTGAGATGGGCGTGGAGGGTTCGCCGT
TGCCTCCGTCCAAGACGAATGCCGATGAATCGAAGAAAGACGAAGGTTCTGCGTAGACATAGTTGAGAGTGTATGTTTTATTTATGAGTTTGTTGTCTTTTCGCTATTGC
CTTTGTGAAACTGAAGTCAATGCTTAGGATGAGACAGAAAAATACAATATGTTCTAGACATGGACCTGCTATTTCAGCATAATTTCTTATTGGCAATATAGTGATGATTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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