| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6593325.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.0e-122 | 99.58 | Show/hide |
Query: ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRR THTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
Subjt: ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
Query: SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTS
SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTS
Subjt: SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTS
Query: KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| KAG7025672.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.6e-123 | 99.59 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRR THTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022959724.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 9.6e-124 | 100 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023004641.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.3e-120 | 97.93 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023513630.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.5e-121 | 98.34 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSS KPAEILL SVSFHRRRTHT LRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVE+HGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 1.2e-100 | 80.31 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R TRLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEEL R
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VNTVDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 1.2e-100 | 80.31 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R TRLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEEL R
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VNTVDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1H8X7 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 4.6e-124 | 100 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 1.2e-100 | 80.31 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R TRLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEEL R
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPTRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VNTVDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1KSN9 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 6.3e-121 | 97.93 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.6e-31 | 39.04 | Show/hide |
Query: DSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLE
+S SV +LYVGN+P ++ + +L I + G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + + VGGRT+KVN E P V + +
Subjt: DSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ F+DSPHK+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + ++ G+GF+TFSS E + +A+ + N LEG+P+R+N A
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 7.7e-68 | 56.32 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIH------SSTKP---AEILLKSVSFHRRRTHTL-LRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVA----------ERKLYVGNIPRNVDNEEL
MA+IS++L L+ SS+KP ++ L++ SF L R+S P A+ +++SS + R+LYVGNIPRN++N+EL
Subjt: MASISAVLSPTNLIH------SSTKP---AEILLKSVSFHRRRTHTL-LRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVA----------ERKLYVGNIPRNVDNEEL
Query: KRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTET
+ IVE+HGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLN+T++GGR IKVNITEKP + +D++ +AE+SQF++SP+KVY+GN++ TV+ E
Subjt: KRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTET
Query: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
LK+FFSEKGKVL AKV R PGTSK++G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 1.5e-31 | 37.84 | Show/hide |
Query: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLEAE
+S E +LYVGN+P + + EL +I + G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N + +GGRT+KVN E P N V + +
Subjt: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLEAE
Query: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
++DSPHKVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T ++ G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.6e-68 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+L ++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q9ZUU4 RNA-binding protein CP29B, chloroplastic | 4.6e-28 | 38.5 | Show/hide |
Query: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEA
++ S A+ KL+VGN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N ++ GR ++VN P S
Subjt: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEA
Query: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
S F S ++VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + ++ G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV++A
Subjt: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.6e-31 | 37.17 | Show/hide |
Query: SSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV
S+ KP I +S S R + + + A D + KLY GN+P NVD+ L +I++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V
Subjt: SSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPTRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV
Query: DDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSS
+D N I+ L+ T+ GR +KVN +KP N +E + ++ HK++VGN+S TV++E+L F E G V+ A+V T ++ GYGFV +SS
Subjt: DDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSS
Query: EEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: EEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.3e-29 | 38.5 | Show/hide |
Query: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEA
++ S A+ KL+VGN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N ++ GR ++VN P S
Subjt: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLEA
Query: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
S F S ++VYVGN+S V L++ FSE+GKV+ A+V + ++ G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IRV++A
Subjt: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-69 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+L ++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-69 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+L ++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ ++ D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNTVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.1e-32 | 37.84 | Show/hide |
Query: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLEAE
+S E +LYVGN+P + + EL +I + G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N + +GGRT+KVN E P N V + +
Subjt: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELKRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNTVDMSLLEAE
Query: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
++DSPHKVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T ++ G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
