; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G006450 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G006450
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP50A-like
Genome locationCmo_Chr08:4188636..4190021
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G006450
SyntenyCmoCh08G006450
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0046907 - intracellular transport (biological process)
GO:0050790 - regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0051028 - mRNA transport (biological process)
GO:0005643 - nuclear pore (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005096 - GTPase activator activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000156 - Ran binding domain
IPR011993 - PH-like domain superfamily
IPR015007 - Nuclear pore complex, NUP2/50/61


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593442.1 Nuclear pore complex protein NUP50A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-23898.26Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRR+VKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSH EKKDGDHND PAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNST VSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPARGNENENE+PCEGNE+PNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGK+SS+VLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

KAG7025782.1 Nuclear pore complex protein NUP50A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-23998.48Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRR+VKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNST VSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPARGNENENE+PCEGNE+PNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGK+SS+ LKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

XP_022964514.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Cucurbita moschata]8.8e-243100Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

XP_023000356.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Cucurbita maxima]4.7e-23697.83Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKS AQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNST VSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGG+NAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPA+GNENENEEPCEGNE+ NKETGDQEKVE+EEKKE GSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGN+LKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSE KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

XP_023514352.1 nuclear pore complex protein NUP50A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-23798.05Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVG+KTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNST VSESAIPKVDD  VAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPARGNENENEEPCEGNE+ NKETGDQEKVE+EEKKE+GSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGN+LKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E3Q0 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X11.5e-18780.47Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DD++DVSEQ TGTFKRAS+EVLA RRIVKVRRG TAS PSSNPFAGIRLVPPT+NSGS +E +   +A  EK G
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHE-EKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELI--GGDNAENDACVS
        SDEANGKD+ HE  +KDGDH+DEP + KIDTSEA+S   VQ VDQNST +SESAI KVDDNLV ESNKIENE  AG DKT NEEL+      +END CVS
Subjt:  SDEANGKDVSHE-EKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELI--GGDNAENDACVS

Query:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSF
          KNE+E PARG++NENEEP EGNE+ NKETG+QEK E+EE KE+ SE + SKEA+PL+SFQQLSSSQNAFTGLAGTGFST+TFSFGN+ KDG GL++SF
Subjt:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSF

Query:  GLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYP
        GLSNNGSSALF T  SSTVSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSILFEF+DGSWKERGKGELKVNVPT GTGR RILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt:  GLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYP

Query:  DMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        DMKLTNMDK+GITFACMNST +GKDGLSTF +KFKD SIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  DMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

A0A6J1GQJ1 nuclear pore complex protein NUP50B-like5.5e-19080.38Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+DVSEQ  GTFKRAS+EVLA RRIVKVRRGQTAS PSSNPFAGIRLVPPT+NSGSASE KS AQA GEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGG-
        SDEA  KDVSHE+ +   H+DEPAE K+DTSEAES  NVQNVDQNST  SESAI ++DD  V E NKIENE+ AGEDK  NEEL+  + AEND CVSGG 
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGG-

Query:  ----------KNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKD
                  KNENEDPAR  +NENEEP EGNE+ NKETGDQEK E+EE KE GSE D SK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG +T+TFSFGN+ KD
Subjt:  ----------KNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKD

Query:  GAGLSSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRL
        G GL++SFGLS NGSSALF T  SS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVF+ADSI+FEF+DGSWKERGKGELKVNVPT GTGRARILMRARGNYRL
Subjt:  GAGLSSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRL

Query:  ILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        ILNASLYPDMKLTNMDK+GITFACMNS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt:  ILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

A0A6J1HNF6 nuclear pore complex protein NUP50A-like4.2e-243100Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

A0A6J1JV59 nuclear pore complex protein NUP50B-like3.0e-18879.87Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDE+DVSEQ  GTFKRAS+EVLA RRIVKVRRGQTAS PSSNPFAGIRLVPPT+N+GSASE KS AQA GEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGG-
        S+EA  KDVSHE+ +   H+DEPAE K+DTSEAES  NVQNVDQNST  SESAI ++DD  V E NKIENEV AGEDK  NEEL+  + AEND CVSGG 
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGG-

Query:  ----------KNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHE---EKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNV
                  KNENEDPAR  +NENEEP EGNE+ NKETGDQEK+E+E   E KE GSE D SK+A PLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTG  T+TFSFGN+
Subjt:  ----------KNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHE---EKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNV

Query:  LKDGAGLSSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGN
         KDG GL++SFGLS NGSSALF T  SS VSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENE+VVFNADSI+FEF+DGSWKERGKGELKVNVPT GTGRARILMRARGN
Subjt:  LKDGAGLSSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGN

Query:  YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        YRLILNASLYPDMKLTNMDK+GITFACMNS SEGKDGLST+ LKF+D SIVEEFRAA+TEHKGKA STVLKTPENSP
Subjt:  YRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

A0A6J1KFN4 nuclear pore complex protein NUP50A-like2.3e-23697.83Show/hide
Query:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG
        MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKS AQAVGEKTG
Subjt:  MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTG

Query:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK
        SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNST VSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGG+NAENDACVSGGK
Subjt:  SDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGK

Query:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS
        NENEDPA+GNENENEEPCEGNE+ NKETGDQEKVE+EEKKE GSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGN+LKDGAGLSSSFGLS
Subjt:  NENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLS

Query:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
        NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT
Subjt:  NNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT

Query:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        NMDKKGITFACMNSTSE KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt:  NMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0B4K7J2 E3 SUMO-protein ligase RanBP28.8e-1233.83Show/hide
Query:  PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKKGITFACMNSTSEG
        P   EV V TGEE E + F + + LF ++D  WKERG G +K+ +    TG +R+LMR    +++  N ++  D+ +     + DKK + +A  N  ++ 
Subjt:  PSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKKGITFACMNSTSEG

Query:  KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASS
        +  L  F ++FK   + EEFR A T+    A S
Subjt:  KDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASS

Q6PDH4 Ran-binding protein 3-like5.5e-0628.88Show/hide
Query:  SFGNVLKDGAGLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVNVPT---IGTGRAR
        +F +VLK    +S+S  + N    +L  +++  S S+ S    ++++ V TGEE E  V   +  +F F     SW ERG+G L++N       GT ++R
Subjt:  SFGNVLKDGAGLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVNVPT---IGTGRAR

Query:  ILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALK--FKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
        ++MR +G+ RL+LN+ L+  MK+    +K +    + +T    DG+  F ++   KD      F  A   H+  A  ++ K  +  P
Subjt:  ILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALK--FKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP

Q86VV4 Ran-binding protein 3-like5.0e-0735.4Show/hide
Query:  SSALFNTSSTVSKSEKSGFPS----MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVN---VPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLY
        + ++ NTS   S +  S  PS    ++++ V TGEE E  V   +  LF F     SW ERG+G L++N       GT ++R++MR +G+ RLILN+ L+
Subjt:  SSALFNTSSTVSKSEKSGFPS----MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVN---VPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLY

Query:  PDMKLTNMDKKGI
          MK+   + K +
Subjt:  PDMKLTNMDKKGI

Q9C829 Nuclear pore complex protein NUP50A5.6e-8346.23Show/hide
Query:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTP--SSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGE
        MGD+EN    +KKR A ++LSRDNPGLDD+DD +E  +GTFK+ASDEVLA RRIV+V+R + ++ P  +SNPFAGI+LVP T  + +++   + A     
Subjt:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTP--SSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGE

Query:  KTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVS
        K    EA  +D  +++  D +  DE    K+D  +A      +  D++     +SA  +V    VA+    +  V                      C  
Subjt:  KTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVS

Query:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEG-SEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---GL
                      N   E  +  + P ++    ++ E +EK+  G  EAD + +    SSFQQ SS++NAFTGLA T  S ++FSFG V +DG+   G 
Subjt:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEG-SEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---GL

Query:  SSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNA
           FGL ++ SS++F    SS + KSE SGFP  QEV+ ETGEENE+V F+ADSI+FE+LDG WKERGKGELKVNV +   G+AR++MRA+GNYRLILNA
Subjt:  SSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNA

Query:  SLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
        SLYP+MKL NMDKKGITFAC+NS SEGK+GLSTFALKFKD +IVEEFR A+ +HK         + S+  LKTPENSP
Subjt:  SLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP

Q9LW88 Nuclear pore complex protein NUP50B1.4e-8146.17Show/hide
Query:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDED-DVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTAST--PSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVG
        MGD++NA   ++KR A +ELSRDNPGLDD+D D S   +GTF  AS EVLA RRI++VRR   ++T  P+SNPF GIRLVP T  + S +  ++T     
Subjt:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDED-DVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTAST--PSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVG

Query:  EKTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACV
         K             E   DG  +D   E   D+ E     +     +   D   +    + D    E ++  N V+ G    KNE+ I          V
Subjt:  EKTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACV

Query:  SGGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSK--EASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---
        + G+   +D     +N N    EG++   K+TG  +  E E K+ +G+E DT K  ++  LSSF Q SSS+NAFTGLA TGFS ++FSFG V ++G+   
Subjt:  SGGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSK--EASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---

Query:  ---GLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKS-----GFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARG
             S SFG +NNG+S+LF  S   S + KS      FPS Q+V+VETGEENE+  F ADS++FE+L+G WKERGKGELKVN+ T    +AR++MR++G
Subjt:  ---GLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKS-----GFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARG

Query:  NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
        NYRL LNASLYP+MKL  MDKKGITFAC+NS S+ KDGLST ALKFKD ++VEEFRA + EHK    S       LKTPENSP
Subjt:  NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07140.1 Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein1.1e-0431.01Show/hide
Query:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLD--GSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK
        ++EVAV TGEE+E  V +  S L+ F      WKERG G +K  +    TG+ R++MR     ++  N  +   M +      +K  +  A   +  E K
Subjt:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLD--GSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK

Query:  DGL-----------STFALKFKDASIVEE
        D L            TF  KFK+ +  EE
Subjt:  DGL-----------STFALKFKDASIVEE

AT1G52380.1 NUP50 (Nucleoporin 50 kDa) protein4.0e-8446.23Show/hide
Query:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTP--SSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGE
        MGD+EN    +KKR A ++LSRDNPGLDD+DD +E  +GTFK+ASDEVLA RRIV+V+R + ++ P  +SNPFAGI+LVP T  + +++   + A     
Subjt:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTP--SSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGE

Query:  KTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVS
        K    EA  +D  +++  D +  DE    K+D  +A      +  D++     +SA  +V    VA+    +  V                      C  
Subjt:  KTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVS

Query:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEG-SEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---GL
                      N   E  +  + P ++    ++ E +EK+  G  EAD + +    SSFQQ SS++NAFTGLA T  S ++FSFG V +DG+   G 
Subjt:  GGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEG-SEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---GL

Query:  SSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNA
           FGL ++ SS++F    SS + KSE SGFP  QEV+ ETGEENE+V F+ADSI+FE+LDG WKERGKGELKVNV +   G+AR++MRA+GNYRLILNA
Subjt:  SSSFGLSNNGSSALFNT--SSTVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNA

Query:  SLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
        SLYP+MKL NMDKKGITFAC+NS SEGK+GLSTFALKFKD +IVEEFR A+ +HK         + S+  LKTPENSP
Subjt:  SLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP

AT2G30060.1 Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein2.2e-0533.33Show/hide
Query:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF-LDGS-WKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK
        ++EVAV TGEE+E  + +  S L+ F  DGS WKERG G +K     + +G+ R++MR     ++  N  +   M +      DK  +  A   S  E K
Subjt:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF-LDGS-WKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK

Query:  DGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASS
        D L  F ++F   + VE  +A + + K  A S
Subjt:  DGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASS

AT3G15970.1 NUP50 (Nucleoporin 50 kDa) protein9.8e-8346.17Show/hide
Query:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDED-DVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTAST--PSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVG
        MGD++NA   ++KR A +ELSRDNPGLDD+D D S   +GTF  AS EVLA RRI++VRR   ++T  P+SNPF GIRLVP T  + S +  ++T     
Subjt:  MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDED-DVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTAST--PSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVG

Query:  EKTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACV
         K             E   DG  +D   E   D+ E     +     +   D   +    + D    E ++  N V+ G    KNE+ I          V
Subjt:  EKTGSDEANGKDVSHEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACV

Query:  SGGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSK--EASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---
        + G+   +D     +N N    EG++   K+TG  +  E E K+ +G+E DT K  ++  LSSF Q SSS+NAFTGLA TGFS ++FSFG V ++G+   
Subjt:  SGGKNENEDPARGNENENEEPCEGNEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSK--EASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGA---

Query:  ---GLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKS-----GFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARG
             S SFG +NNG+S+LF  S   S + KS      FPS Q+V+VETGEENE+  F ADS++FE+L+G WKERGKGELKVN+ T    +AR++MR++G
Subjt:  ---GLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKS-----GFPSMQEVAVETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARG

Query:  NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
        NYRL LNASLYP+MKL  MDKKGITFAC+NS S+ KDGLST ALKFKD ++VEEFRA + EHK    S       LKTPENSP
Subjt:  NYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP

AT5G58590.1 RAN binding protein 13.7e-0530.4Show/hide
Query:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK
        ++EVAV TGEE+E  V +  S ++ F      WKERG G +K+ +    TG+ R++MR     ++  N  +   M +   +  +K  +  A   S  E K
Subjt:  MQEVAVETGEENERVVFNADSILFEF--LDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKL---TNMDKKGITFACMNSTSEGK

Query:  DGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTE
        D L  F ++F      + F    TE
Subjt:  DGLSTFALKFKDASIVEEFRAAVTE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGATGCTGAAAATGCAACATCTACAAAGAAGAGGGCTGCTGGAAGGGAACTATCACGCGATAACCCTGGGCTTGATGATGAAGATGATGTGTCTGAGCAAGCAAC
TGGAACATTTAAGCGGGCTAGTGATGAAGTGCTAGCCGGCAGAAGAATTGTCAAAGTACGTCGTGGTCAGACTGCCTCTACCCCATCTTCTAATCCCTTTGCAGGAATAC
GCTTGGTACCTCCAACCGATAATAGTGGAAGTGCTTCAGAAGGTAAAAGTACTGCGCAGGCAGTTGGTGAAAAAACAGGTTCAGATGAGGCAAATGGAAAGGATGTTTCC
CATGAAGAGAAAAAGGATGGAGATCATAATGATGAGCCAGCAGAACATAAAATTGACACATCGGAGGCTGAATCTGGTACAAATGTGCAGAATGTTGATCAGAATAGCAC
TGATGTAAGTGAATCTGCCATACCTAAGGTAGATGATAACTTAGTTGCTGAAAGTAATAAAATTGAAAATGAAGTGCAAGCAGGAGAAGATAAGACTAAAAATGAGGAAC
TTATAGGAGGTGATAATGCTGAGAATGATGCTTGTGTTAGTGGCGGTAAGAATGAGAACGAGGATCCTGCACGAGGCAATGAGAATGAAAATGAAGAACCCTGTGAAGGA
AATGAAATGCCAAACAAAGAAACTGGGGATCAAGAAAAGGTAGAACATGAAGAAAAGAAAGAAGAGGGAAGTGAAGCCGATACTAGTAAGGAGGCTTCTCCGTTGAGCTC
ATTCCAACAACTGTCAAGTAGCCAGAACGCCTTCACAGGTCTTGCAGGTACCGGATTTTCGACTACTACGTTCTCCTTCGGTAATGTACTCAAGGATGGGGCTGGTCTAA
GTTCTAGTTTTGGTCTCTCTAATAATGGTAGCTCAGCCTTGTTTAATACTTCTTCCACTGTTTCCAAGAGTGAGAAAAGCGGTTTTCCATCAATGCAAGAGGTTGCAGTT
GAAACTGGTGAAGAAAATGAACGTGTGGTTTTCAATGCTGATTCTATATTATTCGAGTTTCTCGACGGATCGTGGAAGGAACGTGGAAAAGGAGAGCTGAAAGTTAATGT
CCCGACAATTGGTACTGGGCGAGCAAGGATTCTGATGAGGGCTAGAGGAAATTACAGGTTAATTTTGAATGCAAGTCTTTACCCTGACATGAAGCTCACAAACATGGACA
AGAAGGGTATCACATTTGCCTGCATGAACAGCACTAGCGAAGGGAAGGATGGTCTTTCAACATTTGCTTTGAAGTTCAAGGACGCATCCATAGTGGAAGAGTTTCGTGCA
GCAGTCACAGAGCATAAAGGCAAGGCTTCTTCTACAGTTCTGAAAACGCCAGAGAATTCTCCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGGATGCTGAAAATGCAACATCTACAAAGAAGAGGGCTGCTGGAAGGGAACTATCACGCGATAACCCTGGGCTTGATGATGAAGATGATGTGTCTGAGCAAGCAAC
TGGAACATTTAAGCGGGCTAGTGATGAAGTGCTAGCCGGCAGAAGAATTGTCAAAGTACGTCGTGGTCAGACTGCCTCTACCCCATCTTCTAATCCCTTTGCAGGAATAC
GCTTGGTACCTCCAACCGATAATAGTGGAAGTGCTTCAGAAGGTAAAAGTACTGCGCAGGCAGTTGGTGAAAAAACAGGTTCAGATGAGGCAAATGGAAAGGATGTTTCC
CATGAAGAGAAAAAGGATGGAGATCATAATGATGAGCCAGCAGAACATAAAATTGACACATCGGAGGCTGAATCTGGTACAAATGTGCAGAATGTTGATCAGAATAGCAC
TGATGTAAGTGAATCTGCCATACCTAAGGTAGATGATAACTTAGTTGCTGAAAGTAATAAAATTGAAAATGAAGTGCAAGCAGGAGAAGATAAGACTAAAAATGAGGAAC
TTATAGGAGGTGATAATGCTGAGAATGATGCTTGTGTTAGTGGCGGTAAGAATGAGAACGAGGATCCTGCACGAGGCAATGAGAATGAAAATGAAGAACCCTGTGAAGGA
AATGAAATGCCAAACAAAGAAACTGGGGATCAAGAAAAGGTAGAACATGAAGAAAAGAAAGAAGAGGGAAGTGAAGCCGATACTAGTAAGGAGGCTTCTCCGTTGAGCTC
ATTCCAACAACTGTCAAGTAGCCAGAACGCCTTCACAGGTCTTGCAGGTACCGGATTTTCGACTACTACGTTCTCCTTCGGTAATGTACTCAAGGATGGGGCTGGTCTAA
GTTCTAGTTTTGGTCTCTCTAATAATGGTAGCTCAGCCTTGTTTAATACTTCTTCCACTGTTTCCAAGAGTGAGAAAAGCGGTTTTCCATCAATGCAAGAGGTTGCAGTT
GAAACTGGTGAAGAAAATGAACGTGTGGTTTTCAATGCTGATTCTATATTATTCGAGTTTCTCGACGGATCGTGGAAGGAACGTGGAAAAGGAGAGCTGAAAGTTAATGT
CCCGACAATTGGTACTGGGCGAGCAAGGATTCTGATGAGGGCTAGAGGAAATTACAGGTTAATTTTGAATGCAAGTCTTTACCCTGACATGAAGCTCACAAACATGGACA
AGAAGGGTATCACATTTGCCTGCATGAACAGCACTAGCGAAGGGAAGGATGGTCTTTCAACATTTGCTTTGAAGTTCAAGGACGCATCCATAGTGGAAGAGTTTCGTGCA
GCAGTCACAGAGCATAAAGGCAAGGCTTCTTCTACAGTTCTGAAAACGCCAGAGAATTCTCCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDEDDVSEQATGTFKRASDEVLAGRRIVKVRRGQTASTPSSNPFAGIRLVPPTDNSGSASEGKSTAQAVGEKTGSDEANGKDVS
HEEKKDGDHNDEPAEHKIDTSEAESGTNVQNVDQNSTDVSESAIPKVDDNLVAESNKIENEVQAGEDKTKNEELIGGDNAENDACVSGGKNENEDPARGNENENEEPCEG
NEMPNKETGDQEKVEHEEKKEEGSEADTSKEASPLSSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTTTFSFGNVLKDGAGLSSSFGLSNNGSSALFNTSSTVSKSEKSGFPSMQEVAV
ETGEENERVVFNADSILFEFLDGSWKERGKGELKVNVPTIGTGRARILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKKGITFACMNSTSEGKDGLSTFALKFKDASIVEEFRA
AVTEHKGKASSTVLKTPENSP