CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh08G006610
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Ribosomal protein L37
Genome location	Cmo_Chr08:4280006..4281225
RNA-Seq Expression	CmoCh08G006610
Synteny	CmoCh08G006610
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function) GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001569 - Ribosomal protein L37e IPR011331 - Ribosomal protein L37ae/L37e IPR011332 - Zinc-binding ribosomal protein IPR018267 - Ribosomal protein L37e, conserved site

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_004141772.1 60S ribosomal protein L37-3 [Cucumis sativus]

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XP_022150495.1 60S ribosomal protein L37-3 [Momordica charantia]

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XP_022953178.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Cucurbita moschata]

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XP_022964011.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Cucurbita moschata]

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XP_023000413.1 60S ribosomal protein L37-3-like [Cucurbita maxima]

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TrEMBL top hits

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A0A6J1GMN9 Ribosomal protein L37

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A0A6J1HHN6 Ribosomal protein L37

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A0A6J1JVQ3 Ribosomal protein L37

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A0A6J1KAY5 Ribosomal protein L37

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A0A6J1KMJ9 Ribosomal protein L37

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SwissProt top hits

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P79244 60S ribosomal protein L37

2.8e-29

66.32

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        M KGT SFGKRRNKTHTLC RCG +++HLQKS C  C +PA RKRKYNWS KA RR TTGTGRMR+++ V RRF+ GFREGT   P+    AAS+
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Q43292 60S ribosomal protein L37-2

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Q8LEM8 60S ribosomal protein L37-3

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Q8LFH7 60S ribosomal protein L37-1

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Q90YT1 60S ribosomal protein L37

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Arabidopsis top hits

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AT1G15250.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein

7.8e-43

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AT1G52300.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein

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AT3G16080.1 Zinc-binding ribosomal protein family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTAAGGGTACGGGAAGTTTTGGTAAGAGGAGGAACAAGACCCATACTCTCTGTGTGCGGTGCGGCCGCCGCAGCTTCCATCTCCAGAAGAGTCGGTGTTCAGCATG
TGCTTTCCCTGCTGCCCGCAAGCGAAAGTATAACTGGAGTGTGAAGGCCATTAGGAGAAAGACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACATGCGCCATGTTCCGCGTAGAT
TCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTACTGAAGCTGCACCCAGGAACAAGGGAGCTGCAGCATCAGCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CATTTTCTCTTCTGGAAGCTGCAGATAGAACTTTTCCACCCTAGGGTTTCTTCGTCCTGCATCAATGGGTAAGGGTACGGGAAGTTTTGGTAAGAGGAGGAACAAGACCC
ATACTCTCTGTGTGCGGTGCGGCCGCCGCAGCTTCCATCTCCAGAAGAGTCGGTGTTCAGCATGTGCTTTCCCTGCTGCCCGCAAGCGAAAGTATAACTGGAGTGTGAAG
GCCATTAGGAGAAAGACAACCGGAACTGGAAGGATGAGGTACATGCGCCATGTTCCGCGTAGATTCAAGAGCGGCTTCAGAGAGGGTACTGAAGCTGCACCCAGGAACAA
GGGAGCTGCAGCATCAGCATAAGGTTTTGGAAGGAGTTCAACTTAATTTCAGTTCCCAACTATAGCTTTCAGTAGGGGCTTTACTCGTCTGAGGATCATTTCATATAATT
TTGTTTTCTAGTTTTGCCTTTTCATGATTTAGTTGAACGCGGTTTCTTTAATATTTAATGTTTTGAAATTTGGACAAAGATGAATCAGATTATTCGTACTCTGCTACTTG
TTTTTGTGCTATTTTTAGCGTGTTCTTATTCTTCCCCATCCTTCCAAGATTATTTTCAGCAAGTGTTGGGATGATCGATGTTGAATCACTAGATTGAATTAGTTCATTTC
GAAATTGTTTAAATCTTGCCTAGGAGTAGTTTGTTTTGGTTCCCCATCCCCAGACGCTCCC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGKGTGSFGKRRNKTHTLCVRCGRRSFHLQKSRCSACAFPAARKRKYNWSVKAIRRKTTGTGRMRYMRHVPRRFKSGFREGTEAAPRNKGAAASA

CmoCh08G006610 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome