; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G007180 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G007180
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH87-like
Genome locationCmo_Chr08:4523831..4526864
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G007180
SyntenyCmoCh08G007180
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593500.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 87, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-19399.44Show/hide
Query:  KELELEPEPDRSVFSEVEVVVMDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGK
        KELELEPEPDRSVFSEVEVVVMDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIA YGFDDGK
Subjt:  KELELEPEPDRSVFSEVEVVVMDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGK

Query:  STSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRS
        STSVTPCSL+SLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRS
Subjt:  STSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRS

Query:  EKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTA
        EKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTA
Subjt:  EKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTA

Query:  SMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYP
        SMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYP
Subjt:  SMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYP

KAG7025846.1 Transcription factor bHLH87, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.5e-18198.82Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATS+DMDAIA YGFDDGKSTSVTPCSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYP
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQ+P
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYP

XP_022964394.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita moschata]1.9e-184100Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN

XP_023000369.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita maxima]8.7e-17796.18Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDY NRDGY SRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLP+SPPLTSFATSKDMDAIA YGFDDGKSTSVT CSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSV MILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQEST+YSVFSNTIKNLS+STSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKN+RISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH+Q+PQN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN

XP_023514891.1 transcription factor bHLH87-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-18299.12Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIA YGFDDGKSTSVTPCSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQ+PQN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9P0 BHLH domain-containing protein2.6e-13471.32Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIALY----
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERF+IS+S NS+FFNSVQD PI                   SP LTSF TS +MD + L     
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIALY----

Query:  -GFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
         G +  KS +VT CSL+SLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  -GFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD + PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRIS+DPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SSS ++          NQYPQN
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN

A0A1S3CGV3 transcription factor bHLH871.2e-13672.08Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIAL-----
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERFMIS+S NS+FFNSVQD PI                   SPPLTSF TS +MD +       
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIAL-----

Query:  YGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
        +G +  KS +VT CSL+SLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  YGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD N PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SSS ++          NQYPQN
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN

A0A5D3BVW0 Transcription factor bHLH871.2e-13672.08Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIAL-----
        MD+ N +GYGSRVA   T + TS  SFWSNYQQGVEERFMIS+S NS+FFNSVQD PI                   SPPLTSF TS +MD +       
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVA---TTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNS-NSHFFNSVQDLPI-------------------SPPLTSFATSKDMDAIAL-----

Query:  YGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS
        +G +  KS +VT CSL+SLDCLLSATNSNTDTSVED DGSVSM+LTDYTNLWNFG NAA            +TKR+H++    + +YS+FSN I NLSDS
Subjt:  YGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAA------------TTKRTHQE----STEYSVFSNTIKNLSDS

Query:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
        TS+SGGFRIITD N PK KKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAA RPVNLG+E IEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR
Subjt:  TSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRR

Query:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN
        ERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQK+ESLNCP TS+AFSFNPSFPIQ+SSS ++          NQYPQN
Subjt:  ERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH----------NQYPQN

A0A6J1HKP2 transcription factor bHLH87-like9.4e-185100Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN

A0A6J1KJP9 transcription factor bHLH87-like4.2e-17796.18Show/hide
Query:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS
        MDY NRDGY SRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLP+SPPLTSFATSKDMDAIA YGFDDGKSTSVT CSL+SLDCLLSATNS
Subjt:  MDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNS

Query:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
        NTDTSVEDNDGSV MILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQEST+YSVFSNTIKNLS+STSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC
Subjt:  NTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSC

Query:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKN+RISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGG+KMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
Subjt:  IDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Query:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN
        NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSH+Q+PQN
Subjt:  NLGQKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0P0WQ90 Transcription factor LATE FLOWERING3.0e-3139.21Show/hide
Query:  FFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYS
        F +SV  LP+  P  + AT  D   +  + F +   T  T     + +   S  +SNT      + G  +     YT + +     +TT  T    T   
Subjt:  FFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYS

Query:  VFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCI-------DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGI----
             +         S   +  T       ++        SS+I F   C    +           EPD EAIAQ+KEMIYRAAA+RPV LG        
Subjt:  VFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCI-------DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGI----

Query:  --------EKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLG
                ++P+RKNVRIS+DPQTVAAR RRER+SER+RVLQRLVPGG+KMDTA+MLDEAA+YLKFLKSQ++ALE LG
Subjt:  --------EKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLG

Q8S3D2 Transcription factor bHLH872.9e-5849.17Show/hide
Query:  KSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN
        +++S+ P    SLDCLLSAT+++ +TS ED++G +S++ +D   LW+FG  ++      + +TE +                             +  +N
Subjt:  KSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN

Query:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK
          D T            S  GGF++I D+NQ KSKKPR+EK    SSNI+FQ      S+C+    EPD EAIAQMKEMIYRAAA RPVN G+E +EKPK
Subjt:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK

Query:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS
        RKNV+ISTDPQTVAARQRRERISE+IRVLQ LVPGG KMDTASMLDEAANYLKFL++Q+KALENL  K++  N   +S   S   F+PSF P+Q+ + + 
Subjt:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS

Query:  H
        H
Subjt:  H

Q9FHA7 Transcription factor HEC14.1e-2867.03Show/hide
Query:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDTASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Q9LXD8 Transcription factor HEC31.8e-2857.26Show/hide
Query:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD
        S  PP SS++      S      + E +P E +  MKEM+Y+ AA++ V++    ++KPKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMD
Subjt:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD

Query:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN
        TASMLDEA  Y+KFLK QI+ L N
Subjt:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN

Q9SND4 Transcription factor HEC28.3e-2956.56Show/hide
Query:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT
        P     +NF+ + S  SS  ++     D   +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKRKNVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDT
Subjt:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT

Query:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        ASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G21330.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-5949.17Show/hide
Query:  KSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN
        +++S+ P    SLDCLLSAT+++ +TS ED++G +S++ +D   LW+FG  ++      + +TE +                             +  +N
Subjt:  KSTSVTPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVF--------------------------SNTIKN

Query:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK
          D T            S  GGF++I D+NQ KSKKPR+EK    SSNI+FQ      S+C+    EPD EAIAQMKEMIYRAAA RPVN G+E +EKPK
Subjt:  LSDST------------SNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKP-PSSSNINFQQSCSSGSSCIDQ--EPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPK

Query:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS
        RKNV+ISTDPQTVAARQRRERISE+IRVLQ LVPGG KMDTASMLDEAANYLKFL++Q+KALENL  K++  N   +S   S   F+PSF P+Q+ + + 
Subjt:  RKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLGQKIESLNCPSTSLAFS---FNPSF-PIQSSSSLS

Query:  H
        H
Subjt:  H

AT3G50330.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.9e-3056.56Show/hide
Query:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT
        P     +NF+ + S  SS  ++     D   +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKRKNVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDT
Subjt:  PPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQE---PDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDT

Query:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        ASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  ASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

AT4G00120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.0e-2560.61Show/hide
Query:  DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        D+E D E +  MKEM Y  A ++PV++    + KP R+NVRIS DPQTV AR+RRERISE+IR+L+R+VPGG KMDTASMLDEA  Y KFLK Q++ L+
Subjt:  DQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE

AT5G09750.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.3e-2957.26Show/hide
Query:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD
        S  PP SS++      S      + E +P E +  MKEM+Y+ AA++ V++    ++KPKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMD
Subjt:  SEKPPSSSNINFQQSCSSGSSCIDQEPDP-EAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMD

Query:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN
        TASMLDEA  Y+KFLK QI+ L N
Subjt:  TASMLDEAANYLKFLKSQIKALEN

AT5G67060.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.9e-2967.03Show/hide
Query:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE
        +A M+EMI+R A ++P+++  E ++ PKR+NVRIS DPQ+VAAR RRERISERIR+LQRLVPGG KMDTASMLDEA +Y+KFLK Q+++LE
Subjt:  IAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATGCGTTACCAGAAAGAGCTCGAGCTCGAGCCCGAGCCCGACAGATCGGTCTTTTCGGAAGTTGAAGTAGTAGTAATGGATTATTCGAACCGGGATGGATACGG
GTCGAGAGTTGCAACGACAAACATGACGTCGCCGGTGTCGTTTTGGAGCAATTACCAACAAGGAGTTGAAGAAAGGTTCATGATATCCAATTCAAATTCTCACTTCTTCA
ACTCAGTTCAAGATCTCCCAATCAGCCCTCCATTGACAAGCTTTGCAACATCCAAAGACATGGATGCTATTGCGCTCTATGGATTCGACGACGGTAAATCGACGTCGGTT
ACACCGTGCTCTCTCAAGTCATTGGACTGCTTGCTTTCAGCTACAAATAGCAACACAGACACATCAGTTGAAGACAATGATGGATCAGTGTCAATGATCTTAACAGATTA
CACAAATTTATGGAACTTTGGAAGCAATGCAGCAACTACAAAGAGAACCCATCAAGAATCTACAGAGTACTCTGTTTTTTCCAACACCATCAAGAATCTCTCTGATTCAA
CTTCAAACAGTGGAGGGTTTAGGATCATAACAGATCAAAATCAACCAAAATCAAAGAAACCCAGATCAGAAAAGCCACCAAGTTCATCAAACATCAACTTCCAGCAATCA
TGTTCATCAGGATCATCATGTATTGATCAAGAACCTGACCCAGAAGCCATAGCACAAATGAAGGAAATGATATACAGAGCAGCAGCTTTGAGGCCAGTGAATTTGGGGGT
AGAAGGGATAGAAAAGCCCAAAAGGAAGAACGTGAGGATCTCAACAGACCCACAAACAGTAGCAGCAAGGCAAAGGAGAGAGAGAATCAGTGAAAGAATTAGGGTTTTGC
AAAGGCTTGTTCCTGGTGGGAACAAGATGGATACTGCATCAATGCTTGATGAAGCTGCAAATTATCTCAAGTTCTTGAAGTCTCAGATCAAAGCTTTAGAGAATCTTGGG
CAAAAGATTGAATCTTTGAACTGCCCTTCAACTAGCTTAGCCTTTTCTTTCAACCCATCTTTTCCCATACAATCATCTTCATCATTATCCCATAACCAATATCCCCAAAA
CTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAATGCGTTACCAGAAAGAGCTCGAGCTCGAGCCCGAGCCCGACAGATCGGTCTTTTCGGAAGTTGAAGTAGTAGTAATGGATTATTCGAACCGGGATGGATACGG
GTCGAGAGTTGCAACGACAAACATGACGTCGCCGGTGTCGTTTTGGAGCAATTACCAACAAGGAGTTGAAGAAAGGTTCATGATATCCAATTCAAATTCTCACTTCTTCA
ACTCAGTTCAAGATCTCCCAATCAGCCCTCCATTGACAAGCTTTGCAACATCCAAAGACATGGATGCTATTGCGCTCTATGGATTCGACGACGGTAAATCGACGTCGGTT
ACACCGTGCTCTCTCAAGTCATTGGACTGCTTGCTTTCAGCTACAAATAGCAACACAGACACATCAGTTGAAGACAATGATGGATCAGTGTCAATGATCTTAACAGATTA
CACAAATTTATGGAACTTTGGAAGCAATGCAGCAACTACAAAGAGAACCCATCAAGAATCTACAGAGTACTCTGTTTTTTCCAACACCATCAAGAATCTCTCTGATTCAA
CTTCAAACAGTGGAGGGTTTAGGATCATAACAGATCAAAATCAACCAAAATCAAAGAAACCCAGATCAGAAAAGCCACCAAGTTCATCAAACATCAACTTCCAGCAATCA
TGTTCATCAGGATCATCATGTATTGATCAAGAACCTGACCCAGAAGCCATAGCACAAATGAAGGAAATGATATACAGAGCAGCAGCTTTGAGGCCAGTGAATTTGGGGGT
AGAAGGGATAGAAAAGCCCAAAAGGAAGAACGTGAGGATCTCAACAGACCCACAAACAGTAGCAGCAAGGCAAAGGAGAGAGAGAATCAGTGAAAGAATTAGGGTTTTGC
AAAGGCTTGTTCCTGGTGGGAACAAGATGGATACTGCATCAATGCTTGATGAAGCTGCAAATTATCTCAAGTTCTTGAAGTCTCAGATCAAAGCTTTAGAGAATCTTGGG
CAAAAGATTGAATCTTTGAACTGCCCTTCAACTAGCTTAGCCTTTTCTTTCAACCCATCTTTTCCCATACAATCATCTTCATCATTATCCCATAACCAATATCCCCAAAA
CTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQMRYQKELELEPEPDRSVFSEVEVVVMDYSNRDGYGSRVATTNMTSPVSFWSNYQQGVEERFMISNSNSHFFNSVQDLPISPPLTSFATSKDMDAIALYGFDDGKSTSV
TPCSLKSLDCLLSATNSNTDTSVEDNDGSVSMILTDYTNLWNFGSNAATTKRTHQESTEYSVFSNTIKNLSDSTSNSGGFRIITDQNQPKSKKPRSEKPPSSSNINFQQS
CSSGSSCIDQEPDPEAIAQMKEMIYRAAALRPVNLGVEGIEKPKRKNVRISTDPQTVAARQRRERISERIRVLQRLVPGGNKMDTASMLDEAANYLKFLKSQIKALENLG
QKIESLNCPSTSLAFSFNPSFPIQSSSSLSHNQYPQN