| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6593527.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 8.6e-192 | 99.39 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTN+KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFG YGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| KAG7025871.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.3e-189 | 95.91 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSG------------KLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIA
MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSG KLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIA
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSG------------KLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIA
Query: DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTK
DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTN+KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTK
Subjt: DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTK
Query: RSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
RSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
Subjt: RSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
Query: NYGFGYGGPMYINGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NYGFGYGGPMYINGI RYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NYGFGYGGPMYINGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_022964368.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucurbita moschata] | 2.7e-193 | 100 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_023000106.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like [Cucurbita maxima] | 3.4e-180 | 94.24 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD NDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_023514818.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.3e-192 | 99.7 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVP CYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9M1 Uncharacterized protein | 3.7e-132 | 70.26 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MA E+++N D NA + G+ QMYDQQ +F++G+ELE N DST E+K+ST+ YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TF DYFSKYGEIADSVIM+DKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRAD NDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE+ FK YFSSFG I EHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
ED+VE+IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P+RV+YD +SN + +SGY MY+C GLYDD +G FG YD+YAP+GG+G NYA+FYGAYNYGFGYG MY+
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
N GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A5A7UU27 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein a1 | 1.8e-131 | 69.57 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHG--GDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHT
MAEE+++N D N HG G +Q +QQ++F++ +ELE N DST E+K+ST+ YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TFSDYFSKYGEIADSVIM+DKHT
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHG--GDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHT
Query: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITF
GRPRGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRAD NDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE FK YFSSFG I EHQIMIDY+TKRSRGFGFITF
Subjt: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITF
Query: ENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPM
ENED+V++IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P++V+YD +SN + SSGY MY+C GLYDD +G FG YD+YAP+GG+GGNYA+FYGAYNYGFGYG M
Subjt: ENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPM
Query: YINGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
Y+N GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: YINGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A5D3BYF2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein a1 | 1.8e-131 | 69.57 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHG--GDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHT
MAEE+++N D N HG G +Q +QQ++F++ +ELE N DST E+K+ST+ YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TFSDYFSKYGEIADSVIM+DKHT
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHG--GDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHT
Query: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITF
GRPRGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRAD NDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE FK YFSSFG I EHQIMIDY+TKRSRGFGFITF
Subjt: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITF
Query: ENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPM
ENED+V++IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P++V+YD +SN + SSGY MY+C GLYDD +G FG YD+YAP+GG+GGNYA+FYGAYNYGFGYG M
Subjt: ENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPM
Query: YINGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
Y+N GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: YINGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A6J1HKL5 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 1.3e-193 | 100 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A6J1KEY7 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like | 1.6e-180 | 94.24 | Show/hide |
Query: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNFNADHNAYHGGDGAVQMYDQQDRFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD NDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFEN
Query: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYI
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.15 | 8.5e-41 | 39.81 | Show/hide |
Query: SELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVK
S L G A + + TS + + GK+F+GG++WETT+++ DYF ++GE+ D +M D TGR RGFGF+TF +P + V++K+H +DG+ ++ K
Subjt: SELEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVK
Query: RTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
R +PR + +T K+FVGG+P TE+ F+ +F+ FG + + +M+D T R RGFGF+T+ENE AVE+ + + GK VE+K+A P+
Subjt: RTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
Query: DSHSNN
DSH +
Subjt: DSHSNN
|
|
| Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 3.8e-49 | 41.18 | Show/hide |
Query: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRAD---------------TN
S GKLFVGG+SWET E+ ++F+ YGE++ +++M DK TGRPRGFGFV F DPSV D VL + H ID R V+VKR + R + +
Subjt: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRAD---------------TN
Query: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
++TKKIFVGG+PP LT++ F+ YF +G +T+ IM D T R RGFGF++F++EDAV+S+ H+L GKQVE+K+A+P+ + +
Subjt: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
Query: PPSSGY-GMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFG---------GYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG---MTGYGVPNCYG
S GY G E YD +M R+ + G GYG Y N YG YGG Y G YG GYG N G
Subjt: PPSSGY-GMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFG---------GYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG---MTGYGVPNCYG
|
|
| Q920Q6 RNA-binding protein Musashi homolog 2 | 1.2e-39 | 43.22 | Show/hide |
Query: LEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKR
+E + T G S GK+F+GG+SW+T+ ++ DYFSK+GEI + ++M D T R RGFGFVTF DP+ D VL + H +D +T++ K
Subjt: LEGGNADSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKR
Query: TVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
PR K+V+RTKKIFVGG+ + K YF FG + + +M D T R RGFGF+TFENED VE + HE+ K VE KKA P+ V +
Subjt: TVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
|
|
| Q96DH6 RNA-binding protein Musashi homolog 2 | 9.3e-40 | 43.01 | Show/hide |
Query: DSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKRTVPRAD
++ G + +++ GK+F+GG+SW+T+ ++ DYFSK+GEI + ++M D T R RGFGFVTF DP+ D VL + H +D +T++ K PR
Subjt: DSTGGEVKHSTSHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKRTVPRAD
Query: TNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
K+V+RTKKIFVGG+ + K YF FG + + +M D T R RGFGF+TFENED VE + HE+ K VE KKA P+ V +
Subjt: TNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
|
|
| Q9VVE5 RNA-binding protein Musashi homolog Rbp6 | 1.0e-41 | 43.11 | Show/hide |
Query: GKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPP
GK+F+GG+SW+T+ E+ DYF +YG+I+++++M D T R RGFGFVTF DP+ D VL + H +DG+ V+ K PR + K+V+RTKKIFVGG+
Subjt: GKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVSRTKKIFVGGIPP
Query: ALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDD
T + K YF FG I + +M D +T R RGFGF+TF++ED V+ + HE+ K VE KKA P+ V ++ T A S Y GL
Subjt: ALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDD
Query: KMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANF
G P Y YA GY G Y +F
Subjt: KMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANF
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G17640.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-74 | 49.55 | Show/hide |
Query: DHNAYHGGDGAV--QMYDQ---QDRFEL---GSELEGGNADSTGG-EVKHSTSHYDSSSS----GKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDK
D+N+ G D + ++D+ Q FE+ GG A TGG ++KHS H SSSS GKLFVGGVSWETT ETF++YF K+GE+ DSVIM D+
Subjt: DHNAYHGGDGAV--QMYDQ---QDRFEL---GSELEGGNADSTGG-EVKHSTSHYDSSSS----GKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDK
Query: HTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRA--DTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFG
TG PRGFGFVTF D +VA+ VL +DHVID R V++KRT+PR DT+ K VS+T+KIFVGG+PP L ED K YF +G I EHQIM D+ T RSRGFG
Subjt: HTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRA--DTNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFG
Query: FITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGG-------NYANFY--
F+TF+ ED+V+ +F+ + HELG KQVEIK+A P+R D+ + A G Y E Y K + Y Y +GGYG N A FY
Subjt: FITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGG-------NYANFY--
Query: -GAYNYGFGYGGPMYINGIGRYGM----TGYGV
G Y YG+GYGG M+ G G G +GYGV
Subjt: -GAYNYGFGYGGPMYINGIGRYGM----TGYGV
|
|
| AT2G33410.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.3e-49 | 41.07 | Show/hide |
Query: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVS----------
S GKLF+GG+SW+T E +YFS +GE+ +M +K TGRPRGFGFV F DP+V D VL H ID R V+VKR + R + + S
Subjt: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRADTNDKLVS----------
Query: -----RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
RTKKIFVGG+PPALT D F+ YF ++G +++ IMID T+R RGFGF++F++ED+V+ + H+L GKQVE+K+A+P+ + S
Subjt: -----RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
Query: -------PPSSGYGMYKCEGLYD-DKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYGMTGYGVP
P G G EG D ++ +P Y P+GG G Y G+GYG NG+G G GYG P
Subjt: -------PPSSGYGMYKCEGLYD-DKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYGMTGYGVP
|
|
| AT3G13224.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-54 | 44.23 | Show/hide |
Query: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPR-ADTNDKLVSRTKKIFV
D +S GK+F+GG+ +TT F+ +F KYGEI DSVIM D+HTG+PRGFGF+TF DPSV D V+ HVI+G+ VE+KRT+P+ A N +TKKIFV
Subjt: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPR-ADTNDKLVSRTKKIFV
Query: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRR------VSYDSHSNNTAAPPS-SG
GGIP +TED K +F+ +G + EHQ++ D+ T RSRGFGF+ F++E+ V+ + + ++ QVEIKKA P++ SY SH ++ S +
Subjt: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRR------VSYDSHSNNTAAPPS-SG
Query: YGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG
YG G +D G P G P +GG + + G Y YG G GP + G YG
Subjt: YGMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG
|
|
| AT4G14300.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.7e-50 | 41.18 | Show/hide |
Query: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRAD---------------TN
S GKLFVGG+SWET E+ ++F+ YGE++ +++M DK TGRPRGFGFV F DPSV D VL + H ID R V+VKR + R + +
Subjt: SSSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRAD---------------TN
Query: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
++TKKIFVGG+PP LT++ F+ YF +G +T+ IM D T R RGFGF++F++EDAV+S+ H+L GKQVE+K+A+P+ + +
Subjt: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAA
Query: PPSSGY-GMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFG---------GYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG---MTGYGVPNCYG
S GY G E YD +M R+ + G GYG Y N YG YGG Y G YG GYG N G
Subjt: PPSSGY-GMYKCEGLYDDKMGRPFGRYDVYAPFG---------GYGGNYANFYGAYNYGFGYGGPMYINGIGRYG---MTGYGVPNCYG
|
|
| AT5G40490.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.6e-55 | 46.97 | Show/hide |
Query: SSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRA--DTNDKLVSRTKKIFVGG
S+GK+FVGG++ ETT F +F KYGEI DSVIM D+ TG+PRGFGFVT+ D SV D V+ +H+I G+ VE+KRT+PR +ND +TKKIFVGG
Subjt: SSGKLFVGGVSWETTEETFSDYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLNKDHVIDGRTVEVKRTVPRA--DTNDKLVSRTKKIFVGG
Query: IPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGL
IP ++ +D FK +F FG + EHQIM D+ T RSRGFGF+T+E+ED V+ + A + EL G QVEIKKA P++ + + + S +G +G
Subjt: IPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYRTKRSRGFGFITFENEDAVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSHSNNTAAPPSSGYGMYKCEGL
Query: YDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGF-GYGGPMYINGIGRY-GMTGYGVPNCYG
G G Y GGYGG + YG Y F GYGG Y G+G Y G G YG
Subjt: YDDKMGRPFGRYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYNYGF-GYGGPMYINGIGRY-GMTGYGVPNCYG
|
|
