; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G009110 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G009110
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor 6
Genome locationCmo_Chr08:5934466..5936248
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G009110
SyntenyCmoCh08G009110
Gene Ontology termsGO:0009908 - flower development (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0032440 - 2-alkenal reductase [NAD(P)] activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ABE03878.1 AGAMOUS LIKE6-like protein [Momordica charantia]2.0e-9989.5Show/hide
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KAG7026038.1 MADS-box transcription factor 6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-11299.08Show/hide
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XP_022146242.1 agamous-like MADS-box protein AGL6 [Momordica charantia]8.8e-10089.95Show/hide
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XP_022964202.1 MADS-box transcription factor 6 [Cucurbita moschata]4.8e-114100Show/hide
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XP_038877325.1 agamous-like MADS-box protein MADS3 isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-9787.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCU5 Uncharacterized protein1.3e-9383.11Show/hide
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        P Q   I+ QH+P+LQIGY
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A0A6J1CZ22 agamous-like MADS-box protein AGL64.2e-10089.95Show/hide
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A0A6J1HH75 MADS-box transcription factor 62.3e-114100Show/hide
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A0A6J1KE81 MADS-box transcription factor 62.3e-114100Show/hide
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Q1KTF3 AGAMOUS LIKE6-like protein9.4e-10089.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29386 Agamous-like MADS-box protein AGL62.3e-7164.86Show/hide
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        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLEAAL   RQRKTQ+M E+MEDLR+KERQLGD+N++LK+K ETEG   K  Q  W++S+++     + + F
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        P+ PS  + ++   EP LQIG+
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Q38837 Agamous-like MADS-box protein AGL134.0e-5557.08Show/hide
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        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++KTQ+M EQME+LRRKER+LGD+N   KLKLETE  + K  Q    +    A     F L  
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        +  + I +      LQIG+
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Q6EU39 MADS-box transcription factor 62.7e-7570.59Show/hide
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        E+L RT RHLLGEDLGPLSVKELQ LEKQLE AL+QARQRKTQ+M EQ+E+LRRKERQLG++NR+LK KLE EG   N +A+Q    +  +  E+G  + 
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          P  ++ ++   EP LQIGY
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Q7XUN2 MADS-box transcription factor 172.3e-6664.73Show/hide
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        K E L R+ RH+LGEDLGPLS+KELQ LEKQLE +L+QARQRKTQ+M EQ++DLRRKERQLG+LN++LK KLE E  +     AIQ  W    +    G 
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             P      +   EP LQIGY
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Q8LLR1 Agamous-like MADS-box protein MADS32.7e-9181.19Show/hide
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        SL RT RHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLE ALAQARQRKTQMM EQMEDLRRKERQLGDLN++LKLKLE EGQ+LKAIQ  W+ S++ A + ++FP++P
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        SQ++ ++ + EPILQIGY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24260.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.8e-5153.65Show/hide
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         KLK +Y++L RT R+LLGEDLGPLS KEL++LE+QL+++L Q R  +TQ M +Q+ DL+ KER L + N+ L+L+L    Q       N + +  +   
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             +H        SQA     + EPILQIGY
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AT1G24260.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.1e-5154.08Show/hide
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AT2G45650.1 AGAMOUS-like 61.7e-7264.86Show/hide
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        MGRGRVE+KRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGS G   T+ERY RC   S  +N  E  +Q+W  E++KLK+KY
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCC-FSPQDNYSERESQNWFVEISKLKAKY

Query:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAA---EHGNTF
        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLEAAL   RQRKTQ+M E+MEDLR+KERQLGD+N++LK+K ETEG   K  Q  W++S+++     + + F
Subjt:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAA---EHGNTF

Query:  PLYPSQASTIEYQHEPILQIGY
        P+ PS  + ++   EP LQIG+
Subjt:  PLYPSQASTIEYQHEPILQIGY

AT3G61120.1 AGAMOUS-like 132.8e-5657.08Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQDNYSERESQNWFVEISKLKAKYE
        MGRG+VE+KRIENKI RQVTFSKR++GLLKKAYELSVLCDAEV+LIIFS+ GKLYEF + G  +T+ERY RC  +  DN +  ++Q    E++KLK KYE
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQDNYSERESQNWFVEISKLKAKYE

Query:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAAEHGNTFPLYP
        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++KTQ+M EQME+LRRKER+LGD+N   KLKLETE  + K  Q    +    A     F L  
Subjt:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAAEHGNTFPLYP

Query:  SQASTI-EYQHEPILQIGY
        +  + I +      LQIG+
Subjt:  SQASTI-EYQHEPILQIGY

AT5G15800.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein3.0e-5053.1Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCFS--PQDNYSERESQNWFVEISKLKA
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+   KTL+RYQ+C +     +N   +E +N + E  KLK 
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCFS--PQDNYSERESQNWFVEISKLKA

Query:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAAEHGN---
        +YE+L R  R+LLGEDLGPL+ KEL+ LE+QL+ +L Q R  KTQ M +Q+ DL+ KE+ L + NR L +KL+    ++  ++S         E G    
Subjt:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAAEHGN---

Query:  TFPLYPSQASTIEYQHE--PILQIGY
        T+  + +Q+  +    E  P LQ+GY
Subjt:  TFPLYPSQASTIEYQHE--PILQIGY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGAGGAAGAGTTGAACTGAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGCCAAGTCACTTTCTCCAAGCGCCGTAATGGTCTCCTCAAAAAAGCTTATGAACTCTCTGT
TCTTTGCGATGCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTATGAATTCGGCAGCGCTGGTACGACCAAGACACTGGAGCGATACCAACGTTGTTGCT
TCTCTCCCCAAGACAATTACAGCGAACGAGAATCCCAGAACTGGTTCGTGGAAATCTCGAAACTGAAAGCTAAATATGAATCGCTATGTCGCACTCATAGGCACTTGCTT
GGGGAAGATCTTGGACCATTGAGTGTTAAGGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAGCAGCTCTTGCTCAAGCTAGACAAAGGAAGACTCAGATGATGACTGAACA
GATGGAAGATCTACGCAGAAAGGAACGACAACTCGGAGATCTGAATCGAGAGCTGAAGCTCAAGCTCGAGACAGAGGGACAAAATCTTAAAGCCATCCAAAGTTTTTGGA
GCTCAAGTTCATCAGCTGCTGAACATGGCAACACCTTCCCGTTGTATCCTTCACAAGCTAGCACCATTGAGTATCAACACGAACCTATCTTACAAATCGGGTATCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAATAAACAAAGCAGTGGTGAGGTTTCCATTTTATTGTTAAGGAAGATCTTGTTGTTGTTGTTGTTCTTGTTGTTCTTCATCATCTTGTTGTTCCTCCTCCCACTTCCC
CAAAACTCCATAAACAGCCGCCAAAAATGGGGAGAGGAAGAGTTGAACTGAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGCCAAGTCACTTTCTCCAAGCGCCGTAATGGTCTC
CTCAAAAAAGCTTATGAACTCTCTGTTCTTTGCGATGCTGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTATGAATTCGGCAGCGCTGGTACGACCAAGAC
ACTGGAGCGATACCAACGTTGTTGCTTCTCTCCCCAAGACAATTACAGCGAACGAGAATCCCAGAACTGGTTCGTGGAAATCTCGAAACTGAAAGCTAAATATGAATCGC
TATGTCGCACTCATAGGCACTTGCTTGGGGAAGATCTTGGACCATTGAGTGTTAAGGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAGCAGCTCTTGCTCAAGCTAGACAA
AGGAAGACTCAGATGATGACTGAACAGATGGAAGATCTACGCAGAAAGGAACGACAACTCGGAGATCTGAATCGAGAGCTGAAGCTCAAGCTCGAGACAGAGGGACAAAA
TCTTAAAGCCATCCAAAGTTTTTGGAGCTCAAGTTCATCAGCTGCTGAACATGGCAACACCTTCCCGTTGTATCCTTCACAAGCTAGCACCATTGAGTATCAACACGAAC
CTATCTTACAAATCGGGTATCTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQDNYSERESQNWFVEISKLKAKYESLCRTHRHLL
GEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQMMTEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLETEGQNLKAIQSFWSSSSSAAEHGNTFPLYPSQASTIEYQHEPILQIGYL