; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G009960 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G009960
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionubiquitin-conjugating enzyme E2 E2-like
Genome locationCmo_Chr08:6457240..6458941
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G009960
SyntenyCmoCh08G009960
Gene Ontology termsGO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
GO:0035519 - protein K29-linked ubiquitination (biological process)
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GO:0085020 - protein K6-linked ubiquitination (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0061631 - ubiquitin conjugating enzyme activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593782.1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-17096.43Show/hide
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KAG7026112.1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-10166.23Show/hide
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A0A6J1HIF1 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2-like1.4e-178100Show/hide
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A0A6J1KCF2 ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3-like7.2e-16291.88Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D3ZDK2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D14.5e-3644.52Show/hide
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P35129 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 25.9e-3645.21Show/hide
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P51668 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D14.5e-3644.52Show/hide
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P61080 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D14.5e-3644.52Show/hide
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Q2TA10 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D14.5e-3644.52Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G64230.1 ubiquitin-conjugating enzyme 284.6e-3644.22Show/hide
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AT1G64230.2 ubiquitin-conjugating enzyme 284.6e-3644.22Show/hide
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AT5G41700.1 ubiquitin conjugating enzyme 82.1e-3645.58Show/hide
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AT5G41700.2 ubiquitin conjugating enzyme 82.1e-3645.58Show/hide
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        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+   +  ++GPA S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPNI  +G+I +DIL + WSPALTI  
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        ++LSICS+L++P PD+  + E + M+  +   Y   AR WT++YAMG
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AT5G41700.5 ubiquitin conjugating enzyme 82.1e-3645.58Show/hide
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        A  RI  EL+ + +   T CS GPV  D+   +  ++GPA S Y GG+F ++I FP +YP  PP + F TK+FHPNI  +G+I +DIL + WSPALTI  
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTCTTTCCCGTCTCTGCTGTTGCTTCTCTACAAAATCCTCCTCTTCCACCGTCTACACCCGCTTTCACACCCCGCCGCCGCCGCCTCCTGTTCCGATCATCCACGG
CGACTACGCCCAGCCAAAGCCTGCGCAGCAACTCCCGATTCCGATCGTCGACGAAGGCTTTAAGCAGCCAGAGGCTTCGCCGCCTCGTGTTCCGATCATCCACGGCGACT
ACGGCCATCTAAATCCTGCGCAGCAACTGCCGATTCCGATCGTCGACGAAGTCTCTAAACAGCCAGAGGATTCACCGCCTCGTGTTCCGATCATCCACGGCGACTTCGGC
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CGGGAGTGGCAATGAAGAAAAAACAAGTGCGATGTATCGGATTGAGAACGAGTTGAGAGCGATGAACGAGGCGGCGGCGACGCACTGCAGCTTTGGGCCGGTCGGAGCGG
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TTAATCAAGTTTCTTACCAAGATCTTCCATCCAAACATAGAAGAAGATGGAACCATTTTGATCGATATATTGACGGACAATTGGTCTCCAGCATTGACCATTGAAACACT
AATGCTTTCCATATGCTCAATTCTATCGAACCCAGAGCCTGATGAAGGCTCCATTAATGAAGCTTCAAGAATGTTCCTCAATAATTGGCTCAATTACACTAAGATTGCTA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCCAGAGGCTTCGCCGCCTCGTGTTCCGATCATCCACGGCGACTACGGCCATCTAAATCCTGCGCAGCAACTGCCGATTCCGATCGTCGACGAAGTCTCTAAACAGCCAG
AGGATTCACCGCCTCGTGTTCCGATCATCCACGGCGACTTCGGCCAGCCTATGCCTGCGCAGCATCTGCCGATTCCGACCGGCGACGAAGGCTTTAAACAGCCAGAGGCT
TCGCCGCCACGTGCTGGTGGAAATAGCGACGGAGATGGCGGGGACGGGAGTGGCAATGAAGAAAAAACAAGTGCGATGTATCGGATTGAGAACGAGTTGAGAGCGATGAA
CGAGGCGGCGGCGACGCACTGCAGCTTTGGGCCGGTCGGAGCGGATATTTTACGGTGCGAAGGGATTGTGATTGGGCCGGCCTTTTCTTGCTATGACGGCGGTATTTTTC
ACCTTTCCATTCAATTTCCCTCCAACTACCCCTTGAGCCCTCCCTTAATCAAGTTTCTTACCAAGATCTTCCATCCAAACATAGAAGAAGATGGAACCATTTTGATCGAT
ATATTGACGGACAATTGGTCTCCAGCATTGACCATTGAAACACTAATGCTTTCCATATGCTCAATTCTATCGAACCCAGAGCCTGATGAAGGCTCCATTAATGAAGCTTC
AAGAATGTTCCTCAATAATTGGCTCAATTACACTAAGATTGCTAGAGAATGGACCAAGCAATATGCAATGGGAAACCCACCTCCTCCCTAACACCGATCCCTTCTATAAG
ACCTTGTATTTGATTGCGTCGACAAACTTAAATTGTGTCGATTCGATTCAATCTGAGTTAATGGGTTCTTGTATTTTAGGTCGAATAAGGTAGCTCAGCTTGTAAGTCAC
TCTAATGTATCGATGCATACGTGTTTTATATAGTTTGAATTTTAAGCTAATTAGTGTATCAATTGAAAATTTAGACTGTGATACCTAAGTAAATGAGGGTACATGAACAC
AAATGCTACGTCTGAATAAGAGTGATTCCAAGGATAAGAATGCTTCGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QPMPAQHLPIPTGDEGFKQPEASPPRAGGNSDGDGGDGSGNEEKTSAMYRIENELRAMNEAAATHCSFGPVGADILRCEGIVIGPAFSCYDGGIFHLSIQFPSNYPLSPP
LIKFLTKIFHPNIEEDGTILIDILTDNWSPALTIETLMLSICSILSNPEPDEGSINEASRMFLNNWLNYTKIAREWTKQYAMGNPPPP