; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G011750 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G011750
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionclassical arabinogalactan protein 25-like
Genome locationCmo_Chr08:7476079..7476462
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G011750
SyntenyCmoCh08G011750
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR039346 - Classical arabinogalactan protein 25/26


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593943.1 hypothetical protein SDJN03_13419, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-5596.06Show/hide
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KAG7026286.1 hypothetical protein SDJN02_12787, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-5496Show/hide
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XP_023006472.1 classical arabinogalactan protein 25-like [Cucurbita maxima]2.2e-3473.6Show/hide
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XP_023547783.1 classical arabinogalactan protein 25-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-3574.4Show/hide
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        P  SN+LLLL+ L  +LHAF+L LH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBF8 Uncharacterized protein1.9e-3172.22Show/hide
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        LPC SN LLLL   LA L  F + LH
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A0A1S3C8K2 classical arabinogalactan protein 256.4e-3273.02Show/hide
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        LPC SN LLLL   LA L AF + LH
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A0A5A7SSC0 Classical arabinogalactan protein 256.4e-3273.02Show/hide
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A0A6J1H4T0 classical arabinogalactan protein 25-like4.0e-3472.8Show/hide
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        P  SN+LLLL+ L  +LHAF+L LH
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A0A6J1KVY5 classical arabinogalactan protein 25-like1.1e-3473.6Show/hide
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        P  SN+LLL +    +LHAF+L LH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NN00 Classical arabinogalactan protein 252.3e-1052Show/hide
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        +S+ T S  Q+LSPEIAPLLPS GD +PS  GS  TIPS+PSPP+PD  +   PDP A SPF   P S  +P P LP  S  +LL+S ++++  A FL L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G18690.1 arabinogalactan protein 251.6e-1152Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAATGGCCTGCTTTTGGTATTGTTCAGCACTCATTACGGCTTTCATGGCCACACCTTCGCTTGCTTTACCATTTTTGACCTCCACCACTACCAGTTCCCCTTTTCA
AGAACTCTCCCCTGAAATTGCTCCACTGCTGCCTTCGACAGGCGATCAGATTCCTTCTGCAACTGGTTCTATTCCCACCATTCCCTCAAACCCCAGCCCTCCAAATCCAG
ACGAGTTCGAAGCGCCTGCTCCTGATCCCTCTGCCCTTTCCCCATTCGGCCTGCCAGCTTCCTTCGCAGCGCCTAAGCCCCACCTGCCTTGCTCTTCAAATGCGCTTCTT
CTTCTATCAACCTTATTAGCAGCACTACATGCCTTCTTTCTGCTCTTACATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAATGGCCTGCTTTTGGTATTGTTCAGCACTCATTACGGCTTTCATGGCCACACCTTCGCTTGCTTTACCATTTTTGACCTCCACCACTACCAGTTCCCCTTTTCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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