; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh08G012000 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh08G012000
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCmo_Chr08:7622667..7623050
RNA-Seq ExpressionCmoCh08G012000
SyntenyCmoCh08G012000
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593968.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.5e-6399.21Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILA+SRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_022138421.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.6e-4882.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRV S LAA AI AAH LLSSA A DFSG  KLL+VPA+S+CRGSIAEC LAGD  DS FG EFEMDSEINRRILA+ RY+SYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_022930438.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]3.8e-63100Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_023000591.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]1.6e-6197.64Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAM VDFSG DKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILA+SRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

XP_038875155.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]4.4e-5182.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV S LAA AI+AAHFL+SSA AVDFSG  KLLFVP +S+CRGSIAECFLAG+D+DSAFGMEF MDSEINRRILA++RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C9N4 protein RALF-like 337.5e-4982.68Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRV S LAA AI AAH LLSSA A DFSG  KLL+VPA+S+CRGSIAEC LAGD  DS FG EFEMDSEINRRILA+ RY+SYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1EV64 protein RALF-like 331.8e-63100Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1H3W7 protein RALF-like 339.8e-4975.59Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV + +AA A++AAHFL+ SA A+DFSG +++LF P +S+CRGSIAECFLAG+D+DS FGMEFEMDSEINRRILA++RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1KG89 protein RALF-like 337.7e-6297.64Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAM VDFSG DKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILA+SRYLSYGALKRNSVPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

A0A6J1KVY0 protein RALF-like 336.4e-4874.8Show/hide
Query:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG
        M ISRV + +AA A++AAHFL+SSA A+DFSG +++LF P +S+CRGSI ECFLAG+ +DS FGMEFEMDSEINRRILA++RY+SYGAL+RN+VPCSRRG
Subjt:  MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRG

Query:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        ASYYNC+PGAQANPY RGC+AITRCRS
Subjt:  ASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 336.2e-3264.6Show/hide
Query:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN
        AI+  HFL   A     S GD   FVP ESKC G+IAEC L+  +       EFEMDSEINRRILA+++Y+SYGAL+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQAN
Subjt:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN

Query:  PYRRGCNAITRCR
        PY RGC+AITRCR
Subjt:  PYRRGCNAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor4.1e-2855.75Show/hide
Query:  IIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANP
        ++   F +S A A D    D ++   +   C+GSI EC    +        EFE+DSE NRRILA+ +Y+SYGAL++NSVPCSRRGASYYNC+PGAQANP
Subjt:  IIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANP

Query:  YRRGCNAITRCRS
        Y RGC+AITRCRS
Subjt:  YRRGCNAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 237.5e-3055.81Show/hide
Query:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCS
        +  A   I+A H   +  S+ + +F+G     F P E++CRG+IAEC ++   GD  D        G EFEMDSEINRRILA+ RY+SYGAL+RN++PCS
Subjt:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        RRGASYYNC+ GAQANPY RGC+AITRCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 225.0e-2655.37Show/hide
Query:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN
        A  A+IA   ++ SA+      GD L FV A S      C GSIAEC    +        E E DS+I+RRILA  +Y+SYGA++RNSVPCSRRGASYYN
Subjt:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        CQ GAQANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 13.3e-2568.24Show/hide
Query:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        S C GSIAEC  A ++         EMDSEINRRILA+++Y+SY +LKRNSVPCSRRGASYYNCQ GAQANPY RGC+ I RCRS
Subjt:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 12.3e-2668.24Show/hide
Query:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS
        S C GSIAEC  A ++         EMDSEINRRILA+++Y+SY +LKRNSVPCSRRGASYYNCQ GAQANPY RGC+ I RCRS
Subjt:  SKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 193.4e-1757.75Show/hide
Query:  GDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSR-YLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRC
        G+D +    +++ MDSE NRR LA+ R Y+SYGAL++N+VPCSRRG SYY+C+   +ANPYRRGC+ IT C
Subjt:  GDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSR-YLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 223.6e-2755.37Show/hide
Query:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN
        A  A+IA   ++ SA+      GD L FV A S      C GSIAEC    +        E E DS+I+RRILA  +Y+SYGA++RNSVPCSRRGASYYN
Subjt:  AASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESK-----CRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        CQ GAQANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYRRGCNAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 235.3e-3155.81Show/hide
Query:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCS
        +  A   I+A H   +  S+ + +F+G     F P E++CRG+IAEC ++   GD  D        G EFEMDSEINRRILA+ RY+SYGAL+RN++PCS
Subjt:  SFLAASAIIAAH--FLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLA---GDDND-----SAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCS

Query:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR
        RRGASYYNC+ GAQANPY RGC+AITRCR
Subjt:  RRGASYYNCQPGAQANPYRRGCNAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 334.4e-3364.6Show/hide
Query:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN
        AI+  HFL   A     S GD   FVP ESKC G+IAEC L+  +       EFEMDSEINRRILA+++Y+SYGAL+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQAN
Subjt:  AIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGAQAN

Query:  PYRRGCNAITRCR
        PY RGC+AITRCR
Subjt:  PYRRGCNAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCTCACGCGTTTTTTCCTTCCTCGCGGCCTCCGCCATTATCGCCGCTCACTTTCTGCTCTCATCGGCGATGGCCGTCGATTTCTCCGGCGGTGACAAACTCCT
CTTCGTCCCGGCGGAATCCAAGTGCAGAGGCTCTATCGCTGAATGCTTTCTCGCCGGAGATGACAATGATTCCGCCTTCGGAATGGAGTTCGAGATGGACTCCGAGATCA
ATCGCCGAATTCTAGCGTCTTCTCGCTACCTGAGCTATGGCGCTTTGAAAAGGAACAGCGTTCCTTGCTCTCGCCGAGGTGCTTCTTACTACAACTGCCAGCCTGGCGCT
CAGGCCAATCCTTACAGACGCGGTTGCAACGCCATTACTCGCTGCCGGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATCTCACGCGTTTTTTCCTTCCTCGCGGCCTCCGCCATTATCGCCGCTCACTTTCTGCTCTCATCGGCGATGGCCGTCGATTTCTCCGGCGGTGACAAACTCCT
CTTCGTCCCGGCGGAATCCAAGTGCAGAGGCTCTATCGCTGAATGCTTTCTCGCCGGAGATGACAATGATTCCGCCTTCGGAATGGAGTTCGAGATGGACTCCGAGATCA
ATCGCCGAATTCTAGCGTCTTCTCGCTACCTGAGCTATGGCGCTTTGAAAAGGAACAGCGTTCCTTGCTCTCGCCGAGGTGCTTCTTACTACAACTGCCAGCCTGGCGCT
CAGGCCAATCCTTACAGACGCGGTTGCAACGCCATTACTCGCTGCCGGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEISRVFSFLAASAIIAAHFLLSSAMAVDFSGGDKLLFVPAESKCRGSIAECFLAGDDNDSAFGMEFEMDSEINRRILASSRYLSYGALKRNSVPCSRRGASYYNCQPGA
QANPYRRGCNAITRCRS