CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh08G012050
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	phylloplanin-like
Genome location	Cmo_Chr08:7655077..7660830
RNA-Seq Expression	CmoCh08G012050
Synteny	CmoCh08G012050
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR040404 - Phylloplanin-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6593974.1 hypothetical protein SDJN03_13450, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7026315.1 hypothetical protein SDJN02_12816 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.3e-78

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XP_022930242.1 uncharacterized protein LOC111436755 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_022930243.1 phylloplanin-like isoform X2 [Cucurbita moschata]

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XP_023000425.1 phylloplanin-like [Cucurbita maxima]

1.2e-74

96.13

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C7U3 phylloplanin-like

1.9e-46

67.11

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        MS  S +I LLI   TM   SSCQ DLIR LLG T I G LYC ++G++IYG + PTFPNA V+M CGA GTV+SSVK+DATG FS+L+DAP+L+L FLL
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         NC+LVVTTPL +CN  +PSFG L SPLQLIGNTF GLFN+TN IPVGFRF+
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A0A6J1CAI6 phylloplanin-like

2.1e-53

72.9

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        M   S  I   +++L MA +S  Q DLIR+LLGLTH+QGTLYCTLNGN I GLLTPTFPNA VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL
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        +NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQ IGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP L
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A0A6J1EPU9 uncharacterized protein LOC111436755 isoform X1

4.8e-66

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A0A6J1EUI5 phylloplanin-like isoform X2

4.8e-66

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A0A6J1KIA9 phylloplanin-like

5.7e-75

96.13

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q56S59 Phylloplanin

6.4e-15

38.89

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        LI +L     +   F ++   L  THI G ++C++NGN+  I GL    FPNA+V++ CGA   VISS  ++ +G FS+ ++      +F L NC+LVV 
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        TPL  CN  + S G LAS L+L+  T     GL  +  + P GF
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G16660.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein

7.0e-25

47.62

Show/hide

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        L+  +L L +I G ++C+LNG    G  TP F NA VE+ CG    V+S+  ++A G FS+  D+ Q+LLS LL++C +VVTTPL  CN  +PS G L S
Subjt:  LIRTLLGLTHIQGTLYCTLNGNMIYGLLTPTFPNAAVEMHCGAGGTVISSVKSDATGRFSMLLDAPQLLLSFLLNNCSLVVTTPLVNCNGAMPSFGALAS

Query:  PLQLIGNTFLGLFNITNIIPVGFRFL
         L +IGN+  GL NI +IIP GF  L
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AT3G16670.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein

2.8e-18

Show/hide

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        +L+ ++ ++P+++ Q  L    + +  I G L+CT+NG  + G   P F NA V++ CG    V++   ++  G F+   +  Q+ L  LLN+C +VV T
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Query:  PLVNCNGAMPSFGALASPLQLIGNTFLGLFNITNIIPVGF
        P  +C+  +PS G L S L L+G+   GL NI  I+P GF
Subjt:  PLVNCNGAMPSFGALASPLQLIGNTFLGLFNITNIIPVGF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTTTCACATCTCATTACATTTCTTTGTTAATCATCGTTTTGACGATGGCCCCGTTGAGTTCATGTCAGTTCGATTTGATCCGAACTCTTCTTGGTCTCACCCACAT
CCAAGGAACTCTCTATTGTACTCTCAACGGCAACATGATCTACGGACTTTTGACCCCAACTTTTCCGAATGCGGCGGTGGAAATGCACTGCGGAGCCGGCGGAACTGTGA
TTTCGTCCGTCAAATCCGATGCGACCGGCAGGTTCTCAATGCTTCTCGATGCGCCTCAACTGCTACTCTCCTTTTTACTAAACAATTGCAGTCTTGTCGTCACGACGCCG
CTCGTCAATTGCAACGGCGCCATGCCGTCGTTTGGCGCCCTCGCCTCGCCGCTGCAACTCATCGGAAATACGTTTCTTGGACTCTTCAATATCACCAATATCATTCCGGT
AGGGTTTCGATTCCTTCCGATTCTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AGTCAGTTCCCGTTGCTTCAGCTCTGACGGAGTGCATATCGTAATCGTTGCTCTGTCAGAGAAATGATCGTTATCTGGCCAGAGAGGGTCAAGAAGATACCAGGCCGCGC
CTTGGAGATGGCGCCAGTAGAGCTACAGTCATTGAAGAAGCATAAGCTTCAAAATCTCTCAAAAGAGCCCTGGACTTCTTCTCTCCGGCTCACGGCCATGTCGCTCCTCC
TGATCATGAGAGTGACATTGAAGACCTTCAGAAACTTTACCAACATTGCAACCTTTTTCAATCAATGGTTCTCTCGTGGTGAGCATTACAAAGTTTTGCATCGGCTTCAG
CTGACAACATCAAGAAATTTAATCTCTCCAAAGGGGGGAGTTTGTGCACAATATGATGTGAGTTTCTATAGTAATTTATTATTTGCAATTTAATAATGTGCCCTTTGTAG
CCTTATTTACTTCAAAAGCTAGGTCTATATGTGAGAATATATTAAAGGAGAACAAGAAACTTGTTTCTTTGGAGTGAGTCGGTGTGATCTCACATTGGTTAGAGAGGGAA
CAAAACATTTCTTATAAAGAGTGTGGAAACCTCTCTTAGTATATGTGTTTTAAAATCGTGAGGCTGATGGTGATACGTAACGAGCCAAAGTAGACAATATCTACTAGCGG
TGGGCTTGAACTGTTATAGTAGCTATGACCCTCACTATTTTGAGTGGGTCTCGGGTCGAGCTGCCTTAGCCAAAATTCTTGGAGAGCTTGTTTCCCTCTCTTTTCTCAGT
TTGTCAGGTGCCATCTTCGGGAAGGTTCGAAAGTTTGTTTTTGGGAGGTTGTTAGGTTTAATGCATCCTTGTAGGCGTCGGTCACTACTAGGCTGTTCTGTGTGATGATG
TTATTTTGGTGTTCCGTGCAAAATATACGAGAGAAAGAACAATGGGTCGTGGGTCAGAGATATCAACCATCCGAAGGAGGTTAATAACTGGTCCCAGAATTTGTTTTCTC
TGAACTTCTATTAAAAACAATGGCGTAGAGAATGTTTGTGAACTTTGAGGATAACAATTTAGAGGATCGAGAGATCTTCGGAGTTAGTTAGGTTTAATTCTTCTTGTTGA
GTGTCCATTGAATAGACAGGGAGGTGGATTGTGAGATCCCACATCGGTTGGATAGAGAAAGGAAAACCTCTCCCTAATAAACGCGTTTTGACGATATGTAACAAGCCAAA
AAGGATTTTCTCTCCCAAACAACCATGAAAGAAAAACATCTCACAATGCAACCATTATGAATGATCCAAAAGTCCCGCCCATAAAAAAGGCTCATTTCTTCTTCACACAC
CATTTCCATGATGAGGCTTTGTAGCAAAGTTTGTTGTTAACTTCATTCCCCAAACTATTGAAATTGTTCTTCTAAAAGGTCTCTTTCTTTCCATCTCTTCCAAATTTACT
TCCATTATACAAACAATAATGTCTTTCACATCTCATTACATTTCTTTGTTAATCATCGTTTTGACGATGGCCCCGTTGAGTTCATGTCAGTTCGATTTGATCCGAACTCT
TCTTGGTCTCACCCACATCCAAGGAACTCTCTATTGTACTCTCAACGGCAACATGATCTACGGACTTTTGACCCCAACTTTTCCGAATGCGGCGGTGGAAATGCACTGCG
GAGCCGGCGGAACTGTGATTTCGTCCGTCAAATCCGATGCGACCGGCAGGTTCTCAATGCTTCTCGATGCGCCTCAACTGCTACTCTCCTTTTTACTAAACAATTGCAGT
CTTGTCGTCACGACGCCGCTCGTCAATTGCAACGGCGCCATGCCGTCGTTTGGCGCCCTCGCCTCGCCGCTGCAACTCATCGGAAATACGTTTCTTGGACTCTTCAATAT
CACCAATATCATTCCGGTAGGGTTTCGATTCCTTCCGATTCTTTAATATTCAAGAAAAATGTTCACCATTGTTGATGTAGCTAACTAAATAAACGGAGTCCTTAACTTGT
TGCGCTGTAATGATGTATGTGATGACCGAGTACTAAATCTCTACTTGGCTAATTTTTAGGTGCTTTGGTTTGTTTGTATATATATATATATATATATATATGAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSFTSHYISLLIIVLTMAPLSSCQFDLIRTLLGLTHIQGTLYCTLNGNMIYGLLTPTFPNAAVEMHCGAGGTVISSVKSDATGRFSMLLDAPQLLLSFLLNNCSLVVTTP
LVNCNGAMPSFGALASPLQLIGNTFLGLFNITNIIPVGFRFLPIL

CmoCh08G012050 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome