; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh09G001730 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh09G001730
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionCalmodulin
Genome locationCmo_Chr09:778153..778704
RNA-Seq ExpressionCmoCh09G001730
SyntenyCmoCh09G001730
Gene Ontology termsGO:0050790 - regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
GO:0030234 - enzyme regulator activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591338.1 putative calcium-binding protein CML41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-9798.37Show/hide
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KAG7024217.1 putative calcium-binding protein CML41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-9697.28Show/hide
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XP_022936314.1 probable calcium-binding protein CML41 [Cucurbita moschata]9.6e-100100Show/hide
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XP_022974919.1 probable calcium-binding protein CML41 [Cucurbita maxima]2.1e-9495.65Show/hide
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XP_023535419.1 calmodulin-like protein 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.1e-9595.65Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CT00 probable calcium-binding protein CML412.9e-7074.86Show/hide
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        MA+S I+ PFKWF+ TN KLN P L  KHKP  S PP P       PPLAE AFRHLD DGDGKISGDEL+SYFAS+GEYMT D A+S+I +FD DGD L
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        LELGDFERLVKG E+E++EDLKRAFEMFEGEKGCGFIG  GLQKMFGRLGYVKS E+CM MI VFDVDG+GVIDY EFLRMMT
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A0A5A7UHX6 Putative calcium-binding protein CML412.9e-7074.86Show/hide
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        MA+S I+ PFKWF+ TN KLN P L  KHKP  S PP P       PPLAE AFRHLD DGDGKISGDEL+SYFAS+GEYMT D A+S+I +FD DGD L
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A0A6J1CDM6 probable calcium-binding protein CML412.0e-6674.01Show/hide
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        +S  FKWFS +N KLN PRL F  KPT SNPPPPP  L  APPLAE AF HLDADGDGKIS DEL+SYFAS+GE +TRDD R +IR+FDG+GD LLEL D
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        F RL++  E+EE EDL+RAFEMFE EKGCGFIGP GLQKMF RLGYVKS +ECMAMI VFD++G+GVIDYREFLRMM
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A0A6J1F7Y7 probable calcium-binding protein CML414.6e-100100Show/hide
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A0A6J1IIY2 probable calcium-binding protein CML411.0e-9495.65Show/hide
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        LLELGDFERLVKGGE+EEKEDLK AFEMFEGEKGCGFIGP GLQKMFGRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDG+GVIDYREFLRMMT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D4 Probable calcium-binding protein CML152.5e-1837.93Show/hide
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        P PP A    E  FR  DA+GDG+IS  EL + F SVG  +T D+   +++E D DGD  + LG+F  +     G     +EDL+ AF +F+ + G G I
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         PA L ++   +G   ++ +C  MI   D +G+G+I++ EF  MM
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Q8L3R2 Probable calcium-binding protein CML417.5e-3143.15Show/hide
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        P S  FKWFS   LKLNL     +  P           RSN      + +      E    F H D+DGDGKIS  EL+ YF SVGEY++ + A+  I E
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         D D D  L   DF  L+        GE +   +LK AFEMFE EKG G I P GLQKM  +LG  ++  EC AMI  +D+DGNG++D+ EF +MMT
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Q8RYK0 Probable calcium-binding protein CML313.3e-1840.56Show/hide
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        +P  + A F   D DGDG+IS  EL+     ++GE ++ ++A  L+   D DGD LL   +F RLV+  E EE+++     L+ AF M+E E G G I P
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          L++M  RLG  + I++C AMI  FD++G+GV+ + EF  MM
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Q9SRE6 Calcium-binding protein CML381.3e-1938.35Show/hide
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        EA F ++DA+ DG+IS +ELQ  F ++GE ++ ++A + +R  D DGD +L+  +F +L+K  ++EEK+ +LK AF ++  E G   I P  L+ M  +L
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        G  ++ ++C  MI  FD++ +GV+ + EF  MM
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Q9SRE7 Calcium-binding protein CML398.6e-1936.03Show/hide
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        EA F ++DA+ DG+IS +EL+  F ++GE M+ ++A + ++  D DGD +L++ +F  L+KG     E+E+K  +  AF M+  + G   I P  L+ M 
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Query:  GRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMM
         +LG  ++ ++C  MI  FD++ +GV+ + EF  MM
Subjt:  GRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G76640.1 Calcium-binding EF-hand family protein6.1e-2036.03Show/hide
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        EA F ++DA+ DG+IS +EL+  F ++GE M+ ++A + ++  D DGD +L++ +F  L+KG     E+E+K  +  AF M+  + G   I P  L+ M 
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         +LG  ++ ++C  MI  FD++ +GV+ + EF  MM
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AT1G76650.1 calmodulin-like 389.4e-2138.35Show/hide
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        EA F ++DA+ DG+IS +ELQ  F ++GE ++ ++A + +R  D DGD +L+  +F +L+K  ++EEK+ +LK AF ++  E G   I P  L+ M  +L
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        G  ++ ++C  MI  FD++ +GV+ + EF  MM
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AT1G76650.3 calmodulin-like 389.4e-2138.35Show/hide
Query:  EAAFRHLDADGDGKISGDELQSYFASVGEYMTRDDARSLIREFDGDGDLLLELGDFERLVKGGEQEEKE-DLKRAFEMFEGEKGCGFIGPAGLQKMFGRL
        EA F ++DA+ DG+IS +ELQ  F ++GE ++ ++A + +R  D DGD +L+  +F +L+K  ++EEK+ +LK AF ++  E G   I P  L+ M  +L
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Query:  GYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMM
        G  ++ ++C  MI  FD++ +GV+ + EF  MM
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AT3G50770.1 calmodulin-like 415.3e-3243.15Show/hide
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        P S  FKWFS   LKLNL     +  P           RSN      + +      E    F H D+DGDGKIS  EL+ YF SVGEY++ + A+  I E
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Query:  FDGDGDLLLELGDFERLVK------GGEQEEKEDLKRAFEMFEGEKGCGFIGPAGLQKMFGRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMMT
         D D D  L   DF  L+        GE +   +LK AFEMFE EKG G I P GLQKM  +LG  ++  EC AMI  +D+DGNG++D+ EF +MMT
Subjt:  FDGDGDLLLELGDFERLVK------GGEQEEKEDLKRAFEMFEGEKGCGFIGPAGLQKMFGRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMMT

AT4G12860.1 EF hand calcium-binding protein family4.4e-1834.59Show/hide
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        F+  D +GDGKI+ +EL+ +F SVG  +  ++   +I + D +GD  +++ +F  L +    E+EE+ED++ AF +F+ + G GFI    L+ +   +G 
Subjt:  FRHLDADGDGKISGDELQSYFASVGEYMTRDDARSLIREFDGDGDLLLELGDFERLVKG--GEQEEKEDLKRAFEMFEGEKGCGFIGPAGLQKMFGRLGY

Query:  V--KSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMM
           +++E+C  MI   DVDG+G+++++EF +MM
Subjt:  V--KSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTTTCACCCATTTCCACTCCCTTCAAATGGTTTTCCAACACCAATCTCAAGCTCAACCTCCCTCGCCTTCGCTTCAAACATAAGCCCACCCGGTCTAACCCTCC
TCCTCCACCACTACTCCTCACGCCTGCGCCCCCGCTCGCCGAAGCTGCCTTCCGCCACCTCGATGCCGATGGAGATGGCAAAATCTCAGGGGACGAGCTCCAATCCTACT
TTGCATCAGTCGGTGAGTACATGACACGGGACGATGCTCGAAGTCTAATAAGAGAGTTCGACGGGGATGGTGATTTGTTACTGGAGCTCGGAGACTTCGAACGGCTGGTG
AAGGGTGGGGAGCAGGAAGAGAAAGAGGATCTGAAAAGGGCTTTTGAGATGTTTGAAGGTGAAAAGGGATGCGGATTCATCGGACCGGCAGGGCTGCAAAAGATGTTTGG
ACGGCTTGGATACGTGAAATCCATAGAAGAGTGCATGGCTATGATCGGAGTGTTTGATGTTGACGGCAACGGTGTAATTGATTATCGTGAATTTCTCAGAATGATGACTT
AA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCTTTCACCCATTTCCACTCCCTTCAAATGGTTTTCCAACACCAATCTCAAGCTCAACCTCCCTCGCCTTCGCTTCAAACATAAGCCCACCCGGTCTAACCCTCC
TCCTCCACCACTACTCCTCACGCCTGCGCCCCCGCTCGCCGAAGCTGCCTTCCGCCACCTCGATGCCGATGGAGATGGCAAAATCTCAGGGGACGAGCTCCAATCCTACT
TTGCATCAGTCGGTGAGTACATGACACGGGACGATGCTCGAAGTCTAATAAGAGAGTTCGACGGGGATGGTGATTTGTTACTGGAGCTCGGAGACTTCGAACGGCTGGTG
AAGGGTGGGGAGCAGGAAGAGAAAGAGGATCTGAAAAGGGCTTTTGAGATGTTTGAAGGTGAAAAGGGATGCGGATTCATCGGACCGGCAGGGCTGCAAAAGATGTTTGG
ACGGCTTGGATACGTGAAATCCATAGAAGAGTGCATGGCTATGATCGGAGTGTTTGATGTTGACGGCAACGGTGTAATTGATTATCGTGAATTTCTCAGAATGATGACTT
AA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALSPISTPFKWFSNTNLKLNLPRLRFKHKPTRSNPPPPPLLLTPAPPLAEAAFRHLDADGDGKISGDELQSYFASVGEYMTRDDARSLIREFDGDGDLLLELGDFERLV
KGGEQEEKEDLKRAFEMFEGEKGCGFIGPAGLQKMFGRLGYVKSIEECMAMIGVFDVDGNGVIDYREFLRMMT