; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh09G006140 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh09G006140
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionthioredoxin-related transmembrane protein 2
Genome locationCmo_Chr09:3066632..3071610
RNA-Seq ExpressionCmoCh09G006140
SyntenyCmoCh09G006140
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008466069.1 PREDICTED: thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Cucumis melo]8.2e-11483.72Show/hide
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XP_022936151.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Cucurbita moschata]1.1e-13196.83Show/hide
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XP_022976321.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 [Cucurbita maxima]2.4e-12995.24Show/hide
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XP_023535297.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-13196.43Show/hide
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XP_031738425.1 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus]6.3e-11487.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEV3 Uncharacterized protein6.8e-11483.27Show/hide
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A0A1S3CQP7 thioredoxin-related transmembrane protein 24.0e-11483.72Show/hide
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A0A6J1DU44 thioredoxin-related transmembrane protein 2 isoform X17.0e-11183.61Show/hide
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        +K++  NFRPGEWLNLM++EPYYLSHF+AFFSYFVIRSSA  +LSY   HLL CRE+QAILVFLIF+M KMVR+ETPEAF ADMLL+VK FLVAL SMMD
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        YHLA+WYVIVF GIYVFTQQPV+QGS TCSKLTPLQLE+LLTEG NKSR WLVEFRVSFSADCIR SRCLP+L+VTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFG
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        ISLGGSMNQLP+YILFENAAE+ARLPDL+ ELKAYPPITK +F+
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A0A6J1F6Q2 thioredoxin-related transmembrane protein 25.5e-13296.83Show/hide
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A0A6J1IGK9 thioredoxin-related transmembrane protein 21.2e-12995.24Show/hide
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        MV+KKE RNFRPGEWLNLMLTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSAAHVLS KNMHLLFCREMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASM
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBU2 Thioredoxin-related transmembrane protein 23.2e-1224.44Show/hide
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        RE++ ++      M+K  R  T E    ++ ++ K     L   +D  + + Y+ +     +  + P+Y G +     +   ++  L    +K   W+VE
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        F  ++S+DC  ++    +L++ Y+   L+FG VD+G + +V+ ++ +S      QLPT ILF+   E+ R P ++ + +A
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Q58E26 Thioredoxin-related transmembrane protein 25.0e-1326.01Show/hide
Query:  LTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS--SAAHVLSYKNMHLLFC----REMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASMMDYHLAVWYVIVF
        +++PYYL   L   S+ ++R    A  VL  +      C    RE++ ++      M+K  R  T E    ++ ++ K     L   +D  + + Y+ + 
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            +  + P+Y G +     +   LE  +      S  W+VEF  ++S++C  ++    EL++ Y+   L FG VD+G +P V+ ++ IS      QLP
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Query:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKA
        T ILF+   E+ R P ++ + +A
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Q6DFS0 Thioredoxin-related transmembrane protein 22.2e-1326.01Show/hide
Query:  LTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS--SAAHVLSYKNMHLLFC----REMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASMMDYHLAVWYVIVF
        +++PYYL   L   S+ ++R       VL  +      C    RE++ ++      M+K  R  T E    ++ ++ K     L   +D  + + Y+ + 
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            +  + P+Y G +     +   LE  L      S  W++EF  ++S++C  ++    EL++ Y+   L FG VD+G +P V+ ++ IS      QLP
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Query:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKA
        T ILF+   EI R P ++ + +A
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Q6IQC7 Thioredoxin-related transmembrane protein 2-B3.2e-1223.77Show/hide
Query:  LTEPYYLSHFLAFFSYFVIRS--SAAHVLSYKNMHLLFC----REMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASMMDYHLAVWYVIVF
        L +PYY++      ++ +IR        LS +      C    RE++ ++      M+K  R  T E    +++L+ K   V L   +D  L + Y+ + 
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Query:  AGIYVFTQQPVYQGSDTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRYSRCLPELAVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSMNQLP
            +  + P+Y G +     +   ++  L + +  +  W+VEF  ++S +C  ++    +L++ Y+   L FG VD+G +  V++K+ +S      QLP
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Query:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKA
        + +LF+   E+ R P ++ + +A
Subjt:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKA

Q7JW12 Thioredoxin-related transmembrane protein 2 homolog8.5e-1325.11Show/hide
Query:  KKKELRNFRPGEWLNLMLTEPYYL---SHFLAFFSYFVIRSSAAHVLSYKNMHLLFCREMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALAS
        KK+     +P  W+N++L   Y L   + F+    + +     A  L  + + +LF       L+ ++    +     T   + A   LY K     L +
Subjt:  KKKELRNFRPGEWLNLMLTEPYYL---SHFLAFFSYFVIRSSAAHVLSYKNMHLLFCREMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALAS

Query:  MMDYHLAVWYVIVFAGIYVFTQQPVYQGSDTCSKLTPLQL--ESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRYSRCLPELAVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNV
          D+   + ++++   + +   +P Y+G +  +     Q+  E L     +K   WL+ F   ++  C+ ++    EL+  Y+  HL FG +D+G FP+V
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Query:  AEKFGISLGGSMNQLPTYILFENAAEIARLP
        A+K+ IS      QLPT ILF+   E  R P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G11640.1 Thioredoxin superfamily protein5.8e-6553.97Show/hide
Query:  EWLNLMLTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSAAHVLSYKNMHLLFCREMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASMMDYHLAVWYVIVF
        E ++ ++++PYY  HF+AFFSY  IRSSAA   S    H LF RE+QA L FL+F  +KMVR ET EAF AD LLY K FL+A++ +MDY +AVW+ I+F
Subjt:  EWLNLMLTEPYYLSHFLAFFSYFVIRSSAAHVLSYKNMHLLFCREMQAILVFLIFFMLKMVRRETPEAFTADMLLYVKGFLVALASMMDYHLAVWYVIVF

Query:  AGIYVFTQQPVYQGSDTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRYSRCLPELAVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSMNQLP
        + IY+  QQP +    T  KLTP+QLE LL++GN  +++WL+EF    S+ C+R SRC PEL++TYSN  LSFG VDLGLFPN A KFGISL G M+QLP
Subjt:  AGIYVFTQQPVYQGSDTCSKLTPLQLESLLTEGNNKSRFWLVEFRVSFSADCIRYSRCLPELAVTYSNKHLSFGVVDLGLFPNVAEKFGISLGGSMNQLP

Query:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKAYPPITKVTFIFDFFVD
        TYILFE   E++R PD  ++     PITK      F +D
Subjt:  TYILFENAAEIARLPDLNLELKAYPPITKVTFIFDFFVD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGAAGAAGAAGGAGTTGAGAAACTTTCGACCAGGGGAGTGGCTGAATCTAATGCTGACTGAGCCCTACTATCTCTCCCATTTTCTAGCCTTTTTTTCCTATTTTGT
GATTCGAAGTTCTGCTGCTCATGTACTCTCATATAAGAACATGCATCTTCTCTTTTGCCGGGAGATGCAAGCGATTCTGGTGTTTCTGATTTTCTTTATGCTTAAGATGG
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