| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607892.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 8.7e-70 | 80.5 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNASSS + +S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022935732.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 1.8e-83 | 91.54 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
EIKTRMKK VMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Subjt: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.2e-82 | 91.04 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSM LSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
EIKTRMKK VMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Subjt: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| XP_023534903.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.3e-81 | 89.55 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATA+ISCF+LPSKFRNLSLNASSSSM LSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
EIKTRMKK VMEALDDLKKKPE QSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Subjt: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| XP_038899721.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Benincasa hispida] | 4.6e-71 | 81.19 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPK-KADSAAKRARQAEKRRVYNKARK
MAATA +SCF+LPSKFRNLSLNASSS + SPSS TLRSLSFSSN SVSAFSNGCL++SKAQRP RYSVVCEAAPK KADSAAKR RQAEKRR+YNKARK
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPK-KADSAAKRARQAEKRRVYNKARK
Query: SEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPA
SEIKTR+KK V+EALD LKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPA
Subjt: SEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPA
Query: AA
AA
Subjt: AA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 4.6e-69 | 79 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A I+CF++ SKFRNLSLNASSSS S SSSTL+SL+FSSN+S AFSNGCLS+S+AQRP RYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRR+YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
IKTRMKK V+EALDDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASPAAA
Subjt: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 8.7e-84 | 91.54 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
EIKTRMKK VMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Subjt: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| A0A6J1FKZ1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.6e-69 | 80 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNAS S + +S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 5.6e-83 | 91.04 | Show/hide |
Query: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSM LSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Subjt: MAATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKS
Query: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
EIKTRMKK VMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Subjt: EIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAA
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| A0A6J1IVC5 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 7.2e-70 | 80.5 | Show/hide |
Query: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNASSS + +S SS LRSLSFSSNVSVSAFS+GCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: ATAIISCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSE
Query: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLP+EKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62661 30S ribosomal protein S20 | 7.5e-08 | 40.71 | Show/hide |
Query: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHR
+ + PK+ SA KR RQ+ KRR+ NKA+KS IKT KK ++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+
Subjt: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHR
Query: NTAARRKSRLARR
N AARRKSRL R+
Subjt: NTAARRKSRLARR
|
|
| P80380 30S ribosomal protein S20 | 5.7e-08 | 40.71 | Show/hide |
Query: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHR
+ + PK+ SA KR RQ+ KRR+ NKA+KS IKT KK ++ E ++EE L K++ +A S+IDKA K TLH+
Subjt: VCEAAPKKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHR
Query: NTAARRKSRLARR
N AARRKSRL R+
Subjt: NTAARRKSRLARR
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 8.8e-41 | 56.61 | Show/hide |
Query: CFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMK
C ++ SK NLS +++ +S+L+ L+FS+N+S FS GC S+ QR +SVVCE A KKADSAAKR RQAE RR+ NKARKSE+KTRM+
Subjt: CFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSSTLRSLSFSSNVSVSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAAP-KKADSAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMK
Query: KVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
K V EALD LKKK A +EE++PI+ LIAEA+S IDKAV GTLHRNTAARRKSRLAR KK VEIHHGWYTP+
Subjt: KVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
|
|
| Q2JI48 30S ribosomal protein S20 | 1.7e-07 | 41.18 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRL
SA KR + AE+ R+ NKA K+ ++ MKKV NP E L + I+ ++ AFS IDKA K G LH+NTAARRK+RL
Subjt: SAAKRARQAEKRRVYNKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRL
Query: AR
AR
Subjt: AR
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 2.3e-41 | 57.97 | Show/hide |
Query: SCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSS---------TL-RSLSFSSNVS-VSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAA--PKKADSAAKRARQAEKRRVY
SC L S+F+ LSL S S SPSSS TL SLSFS +VS AFS G L + Q+P R +VCEAA KKADSAAKRARQAEKRRVY
Subjt: SCFALPSKFRNLSLNASSSSMLLSPSSS---------TL-RSLSFSSNVS-VSAFSNGCLSISKAQRPFRYSVVCEAA--PKKADSAAKRARQAEKRRVY
Query: NKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYT
NK++KSE +TRMKK V+EAL+ LKKK +AQ++E++ +EKLI EA+S IDKAVKV LH+NT ARRKSRLARRKKAVEIHHGWY
Subjt: NKARKSEIKTRMKKVPKFGWFICIGFSLLNPVMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYT
Query: PASPAAA
P + AAA
Subjt: PASPAAA
|
|
