; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh09G009540 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh09G009540
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationCmo_Chr09:5023313..5023867
RNA-Seq ExpressionCmoCh09G009540
SyntenyCmoCh09G009540
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592046.1 hypothetical protein SDJN03_14392, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-9095.65Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        MAGGRNG SRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLI+ESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
         KN RNFASEHDDSWSDGVASDG D D+EGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLS+VRNAVLNKTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

KAG7024924.1 hypothetical protein SDJN02_13744, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.2e-9196.2Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        MAGGRNG SRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
         KN RNFASEHDDSWSDGVASDG D D+EGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLS+VRNAVLNKTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

XP_022139627.1 uncharacterized protein LOC111010482 [Momordica charantia]4.2e-6374.19Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTT-SKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPN
        M GG +G SRQSSALWRSFRNGDFEEEDVW+VLKEKS TT SK+SDDS FF+DS I+ S S  +  PSA  MIPR NG GN QIA RSAPRSIPQWF PN
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTT-SKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPN

Query:  GIKNLRNFASEHDDSWSDG-VASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
        G KN R    EHDD    G    D +DEDEEGFD R+PPHELIAKR ARAQISSFSVFEG+GRTLKGRDLS+VRNAVL KTGFLES
Subjt:  GIKNLRNFASEHDDSWSDG-VASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

XP_022936189.1 uncharacterized protein LOC111442861 [Cucurbita moschata]1.4e-95100Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
        IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

XP_023536166.1 uncharacterized protein LOC111797411 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-8994.57Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        MAGGRNG SRQSS LWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSK TSKTSDDSSFFSDS ILE+ASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
          N RNFASEHDDSWSDGVASDGD+EDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLS+VRNAVLNKTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3A6 Uncharacterized protein6.2e-4461.73Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        M GGR   +  ++ALWRSFRNGDFEEEDVW VL EKSKTTS     SSF +DS I+ES      LPSASRMIPR NGG  AQI       SIPQW K   
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFA---SEHDDSWSDGVASDG---------DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
         KN RN      E DD   DGV   G         ++E+EEG   R+PPHELIAKR ARAQISSFSVFEG GRTLKGRDLS+VRNAVL KTGFLES
Subjt:  IKNLRNFA---SEHDDSWSDGVASDG---------DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

A0A6J1CEH3 uncharacterized protein LOC1110104822.0e-6374.19Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTT-SKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPN
        M GG +G SRQSSALWRSFRNGDFEEEDVW+VLKEKS TT SK+SDDS FF+DS I+ S S  +  PSA  MIPR NG GN QIA RSAPRSIPQWF PN
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTT-SKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPN

Query:  GIKNLRNFASEHDDSWSDG-VASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
        G KN R    EHDD    G    D +DEDEEGFD R+PPHELIAKR ARAQISSFSVFEG+GRTLKGRDLS+VRNAVL KTGFLES
Subjt:  GIKNLRNFASEHDDSWSDG-VASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

A0A6J1F7L6 uncharacterized protein LOC1114428617.0e-96100Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
        IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

A0A6J1FSC1 uncharacterized protein LOC1114464241.5e-5365.78Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        M GG NG   QSSALWRSFRNGDFEEEDVW VL+EKS T S +SDD +FF+DS I ES        SAS MIPR NG GNA+IA +SAPRSIP+WFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDG---DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
         +    F  +      DGVA +    ++E+EEGF+ R+PPHELIAKR  RAQISSFSV EG+GRTLKGRDLS+VRNAVL KTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDG---DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

A0A6J1IX28 uncharacterized protein LOC1114806858.9e-5163.64Show/hide
Query:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG
        M GG NG   QSSALWRSFRNGDFEEEDVW VL+EKS T   +SDD  FF+DS I ES        SA  MIPR NG GNA+IA +SAPRSIP+WFKPNG
Subjt:  MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNG

Query:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDG---DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
         +    F      +  DGV  +    ++E+EEG + R+PPHELIAKR  RAQISSFSV EG+GRTLKGRDLS+VRNAVL KTGFLES
Subjt:  IKNLRNFASEHDDSWSDGVASDG---DDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45210.1 Protein of unknown function, DUF5841.1e-1334.44Show/hide
Query:  KTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGN-----AQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFD
        +T + T D    F +S +  + S +   P   R +  SN   +         + S P ++  W K  G +N ++                  + D++G +
Subjt:  KTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGN-----AQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVASDGDDEDEEGFD

Query:  NRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE
         ++PPHE +AK R    ++SFSV EGIGRTLKGRD+SRVRNA+L KTGFL+
Subjt:  NRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE

AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5845.4e-2445.34Show/hide
Query:  DFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVASD
        +F+EEDVW VL+E   ++ +     S FS S    S+  N         I RS       +   SAP ++P W K  G  +  N  S H  S     A+D
Subjt:  DFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVASD

Query:  GDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE
         DDED++G    +PPHE +A++ AR QISSFS+ EG+GRTLKGRDLS+VRNAVL+KTGFLE
Subjt:  GDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE

AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5841.3e-2548.78Show/hide
Query:  DFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSN--GGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVA
        +F+EE+VW VL+E     S+T       S S  L SAS +    S++R IP+ N   GG  Q    SAP +IP W K  G    +   S H  SW+    
Subjt:  DFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSN--GGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGVA

Query:  SDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES
            D+D+EG  + +PPHEL+AKR AR QISSFS+ EGIGRTLKGRDLS+ RNAVL +TGFLES
Subjt:  SDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES

AT4G26950.1 Protein of unknown function, DUF5846.6e-1437.2Show/hide
Query:  NGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIP-RSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGV
        +GDF+E+DVW+VL         +S+ ++         S S   LLPS  RMIP R    G A +  +S P ++P W      K  +             V
Subjt:  NGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIP-RSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGV

Query:  ASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE
          D +   EE F            RR+R+  SS SV EG+GR LKGRDLS+VRNA+L +TGFLE
Subjt:  ASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE

AT4G26950.2 Protein of unknown function, DUF5846.6e-1437.2Show/hide
Query:  NGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIP-RSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGV
        +GDF+E+DVW+VL         +S+ ++         S S   LLPS  RMIP R    G A +  +S P ++P W      K  +             V
Subjt:  NGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIP-RSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASEHDDSWSDGV

Query:  ASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE
          D +   EE F            RR+R+  SS SV EG+GR LKGRDLS+VRNA+L +TGFLE
Subjt:  ASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGGCGGAAGAAATGGCGGAAGCAGGCAGAGCAGCGCTCTGTGGCGGTCTTTCAGAAACGGCGATTTCGAAGAAGAGGACGTCTGGGAAGTTCTCAAAGAGAAATC
GAAAACGACTTCAAAAACCTCCGATGATTCGAGTTTCTTCTCCGATTCGTTGATTCTCGAATCCGCTTCCGTAAATCACCTTCTTCCGTCCGCTTCCAGAATGATTCCGA
GGTCGAACGGTGGCGGAAATGCTCAGATTGCTTCAAGATCGGCTCCTCGATCGATTCCGCAGTGGTTCAAACCTAACGGAATTAAAAACCTTAGGAATTTCGCTTCGGAG
CACGATGATTCTTGGAGCGATGGTGTTGCCAGTGACGGCGACGATGAAGATGAGGAAGGATTTGATAACAGAATTCCGCCGCATGAATTGATTGCGAAGCGACGGGCTAG
GGCTCAGATTTCGTCGTTCTCCGTGTTTGAAGGAATTGGAAGAACTTTGAAAGGGAGGGATCTGAGTAGAGTAAGAAACGCCGTTCTTAACAAAACTGGTTTTCTCGAAT
CGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGGCGGAAGAAATGGCGGAAGCAGGCAGAGCAGCGCTCTGTGGCGGTCTTTCAGAAACGGCGATTTCGAAGAAGAGGACGTCTGGGAAGTTCTCAAAGAGAAATC
GAAAACGACTTCAAAAACCTCCGATGATTCGAGTTTCTTCTCCGATTCGTTGATTCTCGAATCCGCTTCCGTAAATCACCTTCTTCCGTCCGCTTCCAGAATGATTCCGA
GGTCGAACGGTGGCGGAAATGCTCAGATTGCTTCAAGATCGGCTCCTCGATCGATTCCGCAGTGGTTCAAACCTAACGGAATTAAAAACCTTAGGAATTTCGCTTCGGAG
CACGATGATTCTTGGAGCGATGGTGTTGCCAGTGACGGCGACGATGAAGATGAGGAAGGATTTGATAACAGAATTCCGCCGCATGAATTGATTGCGAAGCGACGGGCTAG
GGCTCAGATTTCGTCGTTCTCCGTGTTTGAAGGAATTGGAAGAACTTTGAAAGGGAGGGATCTGAGTAGAGTAAGAAACGCCGTTCTTAACAAAACTGGTTTTCTCGAAT
CGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGGRNGGSRQSSALWRSFRNGDFEEEDVWEVLKEKSKTTSKTSDDSSFFSDSLILESASVNHLLPSASRMIPRSNGGGNAQIASRSAPRSIPQWFKPNGIKNLRNFASE
HDDSWSDGVASDGDDEDEEGFDNRIPPHELIAKRRARAQISSFSVFEGIGRTLKGRDLSRVRNAVLNKTGFLES