CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh09G011150
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	30S ribosomal protein S12
Genome location	Cmo_Chr09:6317516..6318901
RNA-Seq Expression	CmoCh09G011150
Synteny	CmoCh09G011150
Gene Ontology terms	GO:0006334 - nucleosome assembly (biological process) GO:0006412 - translation (biological process) GO:0000786 - nucleosome (cellular component) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0003677 - DNA binding (molecular function) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR006032 - Ribosomal protein S12/S23 IPR012340 - Nucleic acid-binding, OB-fold

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6592192.1 hypothetical protein SDJN03_14538, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022936366.1 extensin-like isoform X2 [Cucurbita moschata]

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XP_022936367.1 extensin-1-like isoform X3 [Cucurbita moschata]

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TrEMBL top hits

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A0A6J1F841 extensin-like isoform X2

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A0A6J1FDF6 extensin-3-like isoform X1

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A0A6J1FDF9 extensin-1-like isoform X3

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A0A6J1IK20 extensin-3-like

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A0A6J1IP49 extensin-3-like

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G44191.1 ECA1 gametogenesis related family protein

3.4e-05

62.16

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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CAAAAAACCAAATTCTGCCTTATGTAAAGTTGCCAGAGTACGCTTAGCCTCGGGATTTGAAATCACTGCTTATATATTTGGTGTTGGCCATAATTTACAAGAACATTCTG
TAGTCTTAGTAAGAGGGAGAAGGGTTAAGGATTTACCTGTTTTCGTGGTAGCTTTAAGCTTATCATCCACATCTGCTGAAGGCTACGACGAGTACTATTCTCCTCCACCA
CCTGTTTACTACTCTCCTTGTCCACCCGTCAAATACTCTTCTCCACCACCTGTCAAATACTCGCCTCCACCTCCTAAGAAAGACGACGAATACAAATCTCCTCCACCACC
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Protein sequence

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CmoCh09G011150 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome