; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh09G012230 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh09G012230
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein FAM186A-like
Genome locationCmo_Chr09:9890694..9897380
RNA-Seq ExpressionCmoCh09G012230
SyntenyCmoCh09G012230
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022930153.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]6.0e-11962.39Show/hide
Query:  ITTSQYQKCTKTPKALTPE------AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW
        +  + +   TKTPKALTPE      AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW
Subjt:  ITTSQYQKCTKTPKALTPE------AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW

Query:  DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIA
        DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQ                                              
Subjt:  DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIA

Query:  QTPEAASDESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPE
                                                                                                            
Subjt:  QTPEAASDESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPE

Query:  AASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS
                 TPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS
Subjt:  AASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS

Query:  GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA
        GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA
Subjt:  GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA

XP_022930158.1 protein FAM186A-like [Cucurbita moschata]1.9e-13367.4Show/hide
Query:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP
        ALTPEA  DGS+ALTPE PWDGS+ALTPEAPWDGSVALTPEA WDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVA TPE PWDGSVA TPE PWDGSVA TP
Subjt:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP

Query:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAAS
        EDA DGS A TPEDASDGS A TPEDASDGS + TP      +V+QTPEDASDGS       ASD SVAHTPTVSQT EAASDESVAHT T+AQTPEAAS
Subjt:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAAS

Query:  DESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQ------TVAQTPEASSDGSIALTPEA
        DESVAHT T+ QTPEA+SD S++ TP      +IA TPEA+SD S+A TP      +IAQTPEA+SD ++A T       ++AQTPEASSDGSIA TPEA
Subjt:  DESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQ------TVAQTPEASSDGSIALTPEA

Query:  ASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSG
        +SDGSIA TPEA+SDGSIA TPEA+SDGSIA TPEA+SD SIA TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  G
Subjt:  ASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSG

Query:  SVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTP
        S+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TPEA+SD SIA TP
Subjt:  SVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTP

XP_022933039.1 uncharacterized protein LOC111439730 [Cucurbita moschata]7.6e-10688.98Show/hide
Query:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT
        +TLSYGSIASFIIEE LRL NESKIQNK NSSISNRKEL RFCDQYGC GIEAPSTS R KV+ HPKPY+SYRPRE YRNKPVQSQKP   RRK  PTKT
Subjt:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT

Query:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV
           KKK+TCFKCREEGHYANKCPI+GKINELDIDQELKNQLL L LTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCIN+LTKDQEI LEVV
Subjt:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV

Query:  EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL
        EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL
Subjt:  EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL

XP_023520818.1 sialidase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-10563.12Show/hide
Query:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP
        ALTPEA  DGS+ALTPE P DGS+ALTPEAP DGSVALTPEA  DGSVALTPEAP DGSVALTPEAP DGSVAQTPED  DGSVAQTPED  DGSVAQTP
Subjt:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP

Query:  EDA------SDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTP------TVSQTLEAASDESVAH
        EDA      SDGSDAQTPE  SDGSDAQTPE  SDGSD+QTP      + +QTPE  SDGS        SD S A TP      + +QT E  SD S A 
Subjt:  EDA------SDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTP------TVSQTLEAASDESVAH

Query:  TP------TIAQTPEAASDESVAHTP-----TITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQTV-
        TP      + AQTPE   D S A TP     +  QTPEAASD S A TP      + AQTPEAASD S A TP      + AQTPEAASD S A T    
Subjt:  TP------TIAQTPEAASDESVAHTP-----TITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQTV-

Query:  -----AQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGS
             AQTPEA+SDGS A TPEAASDGS A TPEAASDGS A TPEAASDGS A TPEAASD S A TP  A  GS A TP  A  G VALTP  A  G 
Subjt:  -----AQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGS

Query:  VALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIA
        VALTP  A  G VALTP  A  G VALTP  A  G VALTP  A  G VALTP  A  G VALTPEAASD  +ALTP  A
Subjt:  VALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIA

XP_023520850.1 uncharacterized protein LOC111784362 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-8985.65Show/hide
Query:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT
        +TLSYGSIASFIIEE LRLCNESKIQNK NSSISNRKEL RFCDQYGC GIEAP TSR+KKV+ HPKPY+SYRPRE YR+KPVQSQKPT  RRK  PTKT
Subjt:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT

Query:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV
         R KKK+TCFKCR EGHYA KCPIKGKINELDIDQELKNQLLRL LT+SEQS EGEIL+LQEESDS SST+YESEQEGKRTCEGCIN+LTKDQEI LEVV
Subjt:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV

Query:  EKVQDPEIQ
        EKVQD EIQ
Subjt:  EKVQDPEIQ

XP_023520850.1 uncharacterized protein LOC111784362 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-0785.71Show/hide
Query:  MAKIEEKLDRILNPEITHQDSSVNVVNNDDEIQEFEDEILDE
        MAKIEEKLDRILNP +T QDSSVNVVNNDDE QEFEDEI +E
Subjt:  MAKIEEKLDRILNPEITHQDSSVNVVNNDDEIQEFEDEILDE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EU83 mucin-1-like2.9e-11962.39Show/hide
Query:  ITTSQYQKCTKTPKALTPE------AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW
        +  + +   TKTPKALTPE      AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW
Subjt:  ITTSQYQKCTKTPKALTPE------AASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPW

Query:  DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIA
        DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQ                                              
Subjt:  DGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIA

Query:  QTPEAASDESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPE
                                                                                                            
Subjt:  QTPEAASDESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPE

Query:  AASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS
                 TPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS
Subjt:  AASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS

Query:  GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA
        GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA
Subjt:  GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA

A0A6J1EU88 protein FAM186A-like9.2e-13467.4Show/hide
Query:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP
        ALTPEA  DGS+ALTPE PWDGS+ALTPEAPWDGSVALTPEA WDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVA TPE PWDGSVA TPE PWDGSVA TP
Subjt:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP

Query:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAAS
        EDA DGS A TPEDASDGS A TPEDASDGS + TP      +V+QTPEDASDGS       ASD SVAHTPTVSQT EAASDESVAHT T+AQTPEAAS
Subjt:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP------TVSQTPEDASDGS-------ASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAAS

Query:  DESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQ------TVAQTPEASSDGSIALTPEA
        DESVAHT T+ QTPEA+SD S++ TP      +IA TPEA+SD S+A TP      +IAQTPEA+SD ++A T       ++AQTPEASSDGSIA TPEA
Subjt:  DESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQ------TVAQTPEASSDGSIALTPEA

Query:  ASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSG
        +SDGSIA TPEA+SDGSIA TPEA+SDGSIA TPEA+SD SIA TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  G
Subjt:  ASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSG

Query:  SVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTP
        S+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TP  +  GS+A TPEA+SD SIA TP
Subjt:  SVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTP

A0A6J1EW44 uncharacterized protein LOC1114366184.1e-7386.29Show/hide
Query:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT
        +TLSYGSIAS IIEE LRLCNESKIQNK NSSISNRKEL RFCDQYGC GIEAPSTSRRKKV+ HPKPY+SYRPRE Y NKPVQSQKP   RRK  PTKT
Subjt:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT

Query:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESE
         R KKK+T FKCREEGHY NKCPI+GKINELDIDQELKNQLLRL LTDSEQSSEGEILELQ+ESDSYSSTEYESE
Subjt:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESE

A0A6J1EYM2 uncharacterized protein LOC1114397303.7e-10688.98Show/hide
Query:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT
        +TLSYGSIASFIIEE LRL NESKIQNK NSSISNRKEL RFCDQYGC GIEAPSTS R KV+ HPKPY+SYRPRE YRNKPVQSQKP   RRK  PTKT
Subjt:  ETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPYNSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKT

Query:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV
           KKK+TCFKCREEGHYANKCPI+GKINELDIDQELKNQLL L LTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCIN+LTKDQEI LEVV
Subjt:  RRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGKRTCEGCINILTKDQEIQLEVV

Query:  EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL
        EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL
Subjt:  EKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRL

A0A6J1IE55 protein FAM186A-like6.7e-7660.22Show/hide
Query:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP
        ALTPEAA DGSIALTPE   DGSIALTPEA  DGS+ALTPEA  DGS+ALTPEA  DGS+ALTPEA  DGS+A TPE   DGS+A TPE   DGS+A TP
Subjt:  ALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTP

Query:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTITQT
        E A DGS A TPE A DGS A TPE A DGS      ++ TPE A DG     S+A TP      EAA D S      IA TPEAA D S+A       T
Subjt:  EDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTITQT

Query:  PEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAA
        PEAA D S      IA TPEAA D S+A TP      +IA TPEAASD S      +A TPEA+SDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAA
Subjt:  PEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTP------TIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAA

Query:  SDG-SIALT-PEAASD-ESIALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS-----GSVALTPTIAPS
        SDG S+ALT PE ASD  S+ALTP  A S   SVALTP  A S   SVALTP  A S   SVALTP  A S    LT   A S      SVA TP  +  
Subjt:  SDG-SIALT-PEAASD-ESIALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPS-----GSVALTPTIAPS

Query:  GS-VALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALT-PEAASD-ESIALTPTIAPS
        GS VA T   A S   SVALTP +A S   SVALT PEAASD  S+ALTP  A S
Subjt:  GS-VALTPTIAPS--GSVALTPTIAPS--GSVALT-PEAASD-ESIALTPTIAPS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0P8X0 Alpha-amylase2.3e-0432.77Show/hide
Query:  TPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEA
        T T  P+G +     +APS +  + PT  P+   ++TPT+ P  +  + PT++P+ +VA  PT+ PS +   TPT+ P+ S   TPT+ P  ++A T   
Subjt:  TPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEA

Query:  ASDESIALTPTIAPSSTQA
         +  S    PT  P+   A
Subjt:  ASDESIALTPTIAPSSTQA

Q9D9R9 Protein FAM186A1.3e-0428.24Show/hide
Query:  LTKDQEIQLEVVEKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREE--RNPYRLQSV--------LQRSESYMLRQEILNLHERV-PEQKKTVQQNLDEDDFQS
        LT +Q   L +    Q   +  + AQ    A+ IS  P+++E   +P + Q++         Q  + Y+  Q+   L   V PEQ K    +L  ++  S
Subjt:  LTKDQEIQLEVVEKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREE--RNPYRLQSV--------LQRSESYMLRQEILNLHERV-PEQKKTVQQNLDEDDFQS

Query:  SFVVAITTSQYQKCTKTPKALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWD
          +  I T +  K  +    LTP+ A D  + LTPE   D  I+L P+      ++ +P       + LTP+      + LTP+      +  +PE    
Subjt:  SFVVAITTSQYQKCTKTPKALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWD

Query:  GSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP---TVSQTPEDA-------SDGSASDESVAHTPTVSQTL------
          ++ TPE+     +  T E A       TP+ A D     TPE A D   S  P    +S +P  A       +   A  + +  TP  +Q L      
Subjt:  GSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTP---TVSQTPEDA-------SDGSASDESVAHTPTVSQTL------

Query:  EAASDESV----AHTPTIAQTPEAASDESVAHTPT------ITQTPEAASD---------ESVAHTPTIAQ------TPEAASDESVAHTPTIAQTPEAA
        E A   S+    AH+  I  T E A  + +  TP       IT TPE A D         + ++ +P  AQ      TP+ A  + +  TP  AQ     
Subjt:  EAASDESV----AHTPTIAQTPEAASDESVAHTPT------ITQTPEAASD---------ESVAHTPTIAQ------TPEAASDESVAHTPTIAQTPEAA

Query:  SDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAP---------------------
           S    + ++ TPE +    IALT E A    I LTP+ A D  + LTPE A D  IA T + A    I  TPT  P                     
Subjt:  SDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAP---------------------

Query:  -----SGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAA
             S  + LTP  A    + LT + A    + LTP  A +  + +TP  A +   +LTP  A +  V LTP  A +  + +TP  A +  +ALTPE A
Subjt:  -----SGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAA

Query:  SDESIALTP
            IALTP
Subjt:  SDESIALTP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAATAGAAGAAAAGTTAGATAGAATCCTAAATCCTGAAATAACACATCAGGATTCATCTGTCAATGTCGTTAACAATGACGACGAAATCCAGGAATTCGAAGA
TGAGATTTTAGATGAGACTTTGTCGTACGGATCAATAGCATCCTTCATCATAGAAGAAAGACTCAGACTTTGCAATGAGTCAAAGATTCAAAATAAGTTCAATTCTTCGA
TATCAAATAGAAAAGAGCTTAGAAGATTTTGCGATCAATATGGATGCAATGGGATAGAGGCCCCCTCAACCTCCAGAAGAAAGAAGGTTAGGATGCATCCAAAGCCTTAT
AATTCGTACAGGCCTAGAGAAAAGTATCGAAATAAACCCGTGCAATCTCAAAAGCCAACGAATTTAAGGAGAAAGAATACTCCTACAAAAACCCGTAGAGCAAAGAAAAA
GAAAACTTGCTTTAAATGTCGAGAAGAAGGACACTATGCTAACAAGTGTCCGATCAAAGGAAAGATTAATGAGTTGGATATAGATCAAGAGCTGAAAAATCAGCTACTAC
GACTGGCTCTAACTGACTCAGAACAATCAAGTGAGGGAGAAATCCTCGAACTCCAAGAAGAATCCGATTCATATTCTAGCACAGAATATGAATCAGAACAAGAAGGAAAG
AGGACGTGTGAAGGATGCATAAACATTCTTACAAAGGATCAAGAAATTCAACTTGAGGTGGTAGAAAAAGTTCAAGATCCAGAAATTCAACAGAAAATTGCTCAACGACT
CAGAGATGCCATGACAATCTCTAAGCCACCTGAAAGGGAAGAAAGAAATCCCTACAGACTTCAATCAGTTCTCCAAAGGTCAGAATCATATATGCTTCGCCAAGAAATTC
TCAATCTTCACGAAAGGGTGCCCGAACAAAAGAAAACGGTGCAACAAAACCTGGATGAAGATGATTTTCAAAGTTCCTTCGTTGTAGCCATCACCACTTCTCAATATCAA
AAATGCACTAAAACTCCTAAGGCTTTAACCCCAGAGGCTGCATCAGATGGAAGCATTGCTCTAACCCCGGAGACTCCATGGGATGGAAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGC
TCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTCAATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTC
CATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATGCA
TCGGATGGGAGCGATGCTCAAACCCCGGAGGATGCATCGGATGGGAGCGATGCTCAAACCCCGGAGGATGCATCGGATGGGAGCGATTCTCAAACCCCAACCGTTTCTCA
AACCCCAGAGGATGCATCGGATGGGAGTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCGTTTCTCAAACCCTGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCC
CAACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCATTACTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCA
ACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCAAAC
CGTTGCTCAAACCCCGGAGGCTTCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCA
TTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGAGAGCATTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTT
GCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGC
TCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTC
TAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGAGAGCATTGCTCTAACCCCAACCATCGCACCAAGTAGCACACAAGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAAAATAGAAGAAAAGTTAGATAGAATCCTAAATCCTGAAATAACACATCAGGATTCATCTGTCAATGTCGTTAACAATGACGACGAAATCCAGGAATTCGAAGA
TGAGATTTTAGATGAGACTTTGTCGTACGGATCAATAGCATCCTTCATCATAGAAGAAAGACTCAGACTTTGCAATGAGTCAAAGATTCAAAATAAGTTCAATTCTTCGA
TATCAAATAGAAAAGAGCTTAGAAGATTTTGCGATCAATATGGATGCAATGGGATAGAGGCCCCCTCAACCTCCAGAAGAAAGAAGGTTAGGATGCATCCAAAGCCTTAT
AATTCGTACAGGCCTAGAGAAAAGTATCGAAATAAACCCGTGCAATCTCAAAAGCCAACGAATTTAAGGAGAAAGAATACTCCTACAAAAACCCGTAGAGCAAAGAAAAA
GAAAACTTGCTTTAAATGTCGAGAAGAAGGACACTATGCTAACAAGTGTCCGATCAAAGGAAAGATTAATGAGTTGGATATAGATCAAGAGCTGAAAAATCAGCTACTAC
GACTGGCTCTAACTGACTCAGAACAATCAAGTGAGGGAGAAATCCTCGAACTCCAAGAAGAATCCGATTCATATTCTAGCACAGAATATGAATCAGAACAAGAAGGAAAG
AGGACGTGTGAAGGATGCATAAACATTCTTACAAAGGATCAAGAAATTCAACTTGAGGTGGTAGAAAAAGTTCAAGATCCAGAAATTCAACAGAAAATTGCTCAACGACT
CAGAGATGCCATGACAATCTCTAAGCCACCTGAAAGGGAAGAAAGAAATCCCTACAGACTTCAATCAGTTCTCCAAAGGTCAGAATCATATATGCTTCGCCAAGAAATTC
TCAATCTTCACGAAAGGGTGCCCGAACAAAAGAAAACGGTGCAACAAAACCTGGATGAAGATGATTTTCAAAGTTCCTTCGTTGTAGCCATCACCACTTCTCAATATCAA
AAATGCACTAAAACTCCTAAGGCTTTAACCCCAGAGGCTGCATCAGATGGAAGCATTGCTCTAACCCCGGAGACTCCATGGGATGGAAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGC
TCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTCAATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTC
CATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATCCATGGGATGGAAGCGTTGCTCAAACCCCGGAGGATGCA
TCGGATGGGAGCGATGCTCAAACCCCGGAGGATGCATCGGATGGGAGCGATGCTCAAACCCCGGAGGATGCATCGGATGGGAGCGATTCTCAAACCCCAACCGTTTCTCA
AACCCCAGAGGATGCATCGGATGGGAGTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCGTTTCTCAAACCCTGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCC
CAACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCATTACTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCA
ACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCCAACCATTGCTCAAACCCCGGAGGCTGCATCAGATGAAAGCGTTGCTCACACCCAAAC
CGTTGCTCAAACCCCGGAGGCTTCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCA
TTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGGGAGCATTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGAGAGCATTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTT
GCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGC
TCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTC
TAACCCCAACCATTGCACCGAGTGGAAGCGTTGCTCTAACCCCGGAGGCTGCATCGGATGAGAGCATTGCTCTAACCCCAACCATCGCACCAAGTAGCACACAAGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKIEEKLDRILNPEITHQDSSVNVVNNDDEIQEFEDEILDETLSYGSIASFIIEERLRLCNESKIQNKFNSSISNRKELRRFCDQYGCNGIEAPSTSRRKKVRMHPKPY
NSYRPREKYRNKPVQSQKPTNLRRKNTPTKTRRAKKKKTCFKCREEGHYANKCPIKGKINELDIDQELKNQLLRLALTDSEQSSEGEILELQEESDSYSSTEYESEQEGK
RTCEGCINILTKDQEIQLEVVEKVQDPEIQQKIAQRLRDAMTISKPPEREERNPYRLQSVLQRSESYMLRQEILNLHERVPEQKKTVQQNLDEDDFQSSFVVAITTSQYQ
KCTKTPKALTPEAASDGSIALTPETPWDGSIALTPEAPWDGSVALTPEAQWDGSVALTPEAPWDGSVALTPEAPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDPWDGSVAQTPEDA
SDGSDAQTPEDASDGSDAQTPEDASDGSDSQTPTVSQTPEDASDGSASDESVAHTPTVSQTLEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTPTITQTPEAASDESVAHTP
TIAQTPEAASDESVAHTPTIAQTPEAASDESVAHTQTVAQTPEASSDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDGSIALTPEAASDESIALTPTIAPSGSV
ALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPTIAPSGSVALTPEAASDESIALTPTIAPSSTQA