; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh09G013080 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh09G013080
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionAnkyrin repeat-containing protein
Genome locationCmo_Chr09:11633633..11634234
RNA-Seq ExpressionCmoCh09G013080
SyntenyCmoCh09G013080
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002110 - Ankyrin repeat
IPR020683 - Ankyrin repeat-containing domain
IPR036770 - Ankyrin repeat-containing domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592382.1 Ankyrin repeat-containing protein BDA1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.1e-2451.54Show/hide
Query:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI
        MP+L G+VDA Q+TPLH                                             LASENGT+EIVQALLEKNTSTCMVRDLNGL PLHH VI
Subjt:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI

Query:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        N +IDIM  LIN  PQS+WMK HNG+T+LH
Subjt:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

KAG6592385.1 Ankyrin repeat-containing protein BDA1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-2452.76Show/hide
Query:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER
        +TG++DALQ+ PLH                                             LASENGT+EIVQALLEKNTS+CMVRDLNGL PLHH VIN R
Subjt:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER

Query:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        IDIM LLIN  PQS+WMKLHNGQT+LH
Subjt:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

XP_022925435.1 uncharacterized protein LOC111432732 [Cucurbita moschata]2.7e-2452.76Show/hide
Query:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER
        + G+VDALQ+TPLH                                             LASENGT++IVQALLEKNTS+CMVRDLNGL PLHH VIN R
Subjt:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER

Query:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        IDIM LLIN  PQS+WMKLHNGQT+LH
Subjt:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

XP_022925440.1 ankyrin repeat domain-containing protein 16-like [Cucurbita moschata]1.4e-2351.94Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN
        PKL G+VD LQ+TPLH                                             LASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGL PLHH VIN
Subjt:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN

Query:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
         +IDI+ LLIN  P+S W+KLHNGQ++LH
Subjt:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

XP_023535331.1 ankyrin repeat-containing protein BDA1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.2e-2553.08Show/hide
Query:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI
        MP+L G+VDALQ+TPLH                                             LASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGL PLHH VI
Subjt:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI

Query:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        N RIDI+  LIN  PQS+WMK HNG+T+LH
Subjt:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D887 ankyrin repeat-containing protein NPR4-like2.3e-2148.84Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN
        P+L G+VDALQ+TPLH                                             LAS NG VEIVQALLEKNTS C+VRDLNGL PLHH VI+
Subjt:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN

Query:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
         +I+IM  LI+  PQSVW KLHNGQT+LH
Subjt:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

A0A6J1EHY8 uncharacterized protein LOC1114327321.3e-2452.76Show/hide
Query:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER
        + G+VDALQ+TPLH                                             LASENGT++IVQALLEKNTS+CMVRDLNGL PLHH VIN R
Subjt:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER

Query:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        IDIM LLIN  PQS+WMKLHNGQT+LH
Subjt:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

A0A6J1EHZ5 ankyrin repeat domain-containing protein 16-like6.6e-2451.94Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN
        PKL G+VD LQ+TPLH                                             LASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGL PLHH VIN
Subjt:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN

Query:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
         +IDI+ LLIN  P+S W+KLHNGQ++LH
Subjt:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

A0A6J1IEM9 uncharacterized protein LOC1114725641.9e-2352.76Show/hide
Query:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER
        + G+VDALQ+TPLH                                             LAS  GTVEIVQALLEKNTSTCMVRDL+GL PLHH VIN R
Subjt:  LTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINER

Query:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        IDIM LLIN  PQS+WMKLHNGQT+LH
Subjt:  IDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

A0A6J1IG24 ankyrin repeat-containing protein BDA1-like1.9e-2352.31Show/hide
Query:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI
        +P+L G+VD LQ+TPLH                                             LASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGL PLHH VI
Subjt:  MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVI

Query:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        N RIDIM  LI   P+S W+KLHNGQTILH
Subjt:  NERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2CIR5 Ankyrin repeat-containing protein NPR49.2e-0734.21Show/hide
Query:  ASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTC--MVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLINVSPQ
        A+ +  + A+  G  E+V+ LLE +      M +D NG   +N    A+  G VEIV+ALLEK+       D  G T LH  V     D++  L++  P 
Subjt:  ASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTC--MVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLINVSPQ

Query:  SVWMKLHNGQTILH
         V +   NG T LH
Subjt:  SVWMKLHNGQTILH

P16157 Ankyrin-11.6e-0638.84Show/hide
Query:  TPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTS-TCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLI-
        TPLH        +A+  G VE V ALLEK  S  CM +   G TP +   +A++ G V + + LLE++         NGLTPLH  V +  +DI+ LL+ 
Subjt:  TPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTS-TCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLI-

Query:  -NVSPQS-VWMKLHNGQTILH
           SP S  W    NG T LH
Subjt:  -NVSPQS-VWMKLHNGQTILH

Q02357 Ankyrin-16.6e-0537.19Show/hide
Query:  TPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTS-TCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLI-
        TPLH         A+  G V+   ALLEK  S  CM +   G TP +   +A++ G V + + LLE +         NGLTPLH  V +  +DI+ LL+ 
Subjt:  TPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTS-TCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLI-

Query:  -NVSPQS-VWMKLHNGQTILH
           SP S  W    NG T LH
Subjt:  -NVSPQS-VWMKLHNGQTILH

Q8GYH5 Ankyrin repeat-containing protein BDA11.0e-0530.53Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVV
        P +  +VD L    TPLH         AS  G +++   L+    S     +  GL+P +   LA EN  VE+   L++ + S   +R   G+TPLH V 
Subjt:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVV

Query:  INERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
            +D+++  +   P+S+     NG+TILH
Subjt:  INERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

Q9C7A2 Ankyrin repeat-containing protein ITN11.9e-0430.19Show/hide
Query:  VLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHN
        V A+  G  E+V  LL K  +   +   N    +N   LA+  G VE+++ALL K+       D  G T LH  V  +  +++ LL++  P  V     +
Subjt:  VLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHN

Query:  GQTILH
          T LH
Subjt:  GQTILH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07710.1 Ankyrin repeat family protein9.4e-0729.69Show/hide
Query:  KLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINE
        +L   VD    T LH         A+  G  E+V  LLE  +S   +   NG T  +    AS NG V++++ALL    +  +  D  G T LH  V   
Subjt:  KLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINE

Query:  RIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
         ++++  LI     S+ +    G T LH
Subjt:  RIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

AT2G31820.1 Ankyrin repeat family protein1.4e-0727.97Show/hide
Query:  KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLIN
        +TPL+ A+ENG        ++ + + L   +  T  +   NG  P +   +A++ G +E+++ LLE   +  M  DL+  T LH       ID+++LL+ 
Subjt:  KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLLIN

Query:  VSPQSVWMKLHNGQTILH
               +  +NG+T LH
Subjt:  VSPQSVWMKLHNGQTILH

AT3G09550.1 Ankyrin repeat family protein6.5e-0831.78Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN
        P+L+  V     TPL        V A+  G  E+V  LL K++S   +   NG   +N   LA+  G V+IV+ LL+K+       D  G T LH  V  
Subjt:  PKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVIN

Query:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
            ++ LL+   P  V +    G T+LH
Subjt:  ERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

AT4G10720.1 Ankyrin repeat family protein2.7e-0630.08Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLN--GLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHH
        P +   +DA+    TPLH+AS +G +    +  +E++      N      R LN  GL+P +   LA E G   +V +LL+ ++    +R   G+TP H 
Subjt:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLN--GLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHH

Query:  VVINERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
        VV     D+M+  +   P  +     NG+T LH
Subjt:  VVINERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH

AT5G54610.1 ankyrin7.2e-0730.53Show/hide
Query:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVV
        P +  +VD L    TPLH         AS  G +++   L+    S     +  GL+P +   LA EN  VE+   L++ + S   +R   G+TPLH V 
Subjt:  PKLTGQVDALQ--KTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVV

Query:  INERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH
            +D+++  +   P+S+     NG+TILH
Subjt:  INERIDIMSLLINVSPQSVWMKLHNGQTILH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTAAACTTACTGGGCAAGTTGATGCCCTGCAAAAGACACCTCTCCACTTAGCTTCAGAAAATGGAACGGTTTTAGCTTCAGAAAATGGAACAGTCGAGATTGTTCA
AGCTTTGCTGGAGAAGAACACAAGCACTTGCATGGTACGTGATTTGAATGGGTTGACTCCTGAAAATGGAACGGTTTTAGCTTCAGAAAATGGAACGGTCGAGATTGTTC
AAGCTTTGCTGGAGAAGAACACAAGCACTTGCATGGTACGTGATTTGAATGGGTTGACTCCTCTCCACCATGTCGTGATTAATGAAAGAATTGATATCATGTCACTTTTG
ATTAATGTGAGCCCACAATCTGTTTGGATGAAACTTCACAATGGTCAAACTATTCTTCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTAAACTTACTGGGCAAGTTGATGCCCTGCAAAAGACACCTCTCCACTTAGCTTCAGAAAATGGAACGGTTTTAGCTTCAGAAAATGGAACAGTCGAGATTGTTCA
AGCTTTGCTGGAGAAGAACACAAGCACTTGCATGGTACGTGATTTGAATGGGTTGACTCCTGAAAATGGAACGGTTTTAGCTTCAGAAAATGGAACGGTCGAGATTGTTC
AAGCTTTGCTGGAGAAGAACACAAGCACTTGCATGGTACGTGATTTGAATGGGTTGACTCCTCTCCACCATGTCGTGATTAATGAAAGAATTGATATCATGTCACTTTTG
ATTAATGTGAGCCCACAATCTGTTTGGATGAAACTTCACAATGGTCAAACTATTCTTCATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPKLTGQVDALQKTPLHLASENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPENGTVLASENGTVEIVQALLEKNTSTCMVRDLNGLTPLHHVVINERIDIMSLL
INVSPQSVWMKLHNGQTILH